New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6063938 | 42 (0.860) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 8.4% | coding (270/891 nt) | ubiA | 4‑hydroxybenzoate octaprenyltransferase |
? | NC_002947 | = 6063958 | 46 (0.970) | coding (290/891 nt) | ubiA | 4‑hydroxybenzoate octaprenyltransferase |
CGGCAATGGGTCACCCACCCTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCTTGGCGTTCTGCTACCC > NC_002947/6063803‑6064084 | cGGCAATGGGTCACCCACCCTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCg > 6:102553/1‑149 (MQ=255) aaTGGGTCACCCACCCTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCtt < 2:56964/137‑1 (MQ=255) aaTGGGTCACCCACCCTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCtt > 1:56964/1‑137 (MQ=255) aaTGGGTCACCCACCCTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGG‑CAGCGGCCgg < 4:55102/149‑1 (MQ=255) gggTCACCCACCCTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCgg < 6:174651/147‑1 (MQ=255) gggTCACCCACCCTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCgg > 5:174651/1‑147 (MQ=255) tCACCCACCCTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTgcg < 1:298282‑M2/149‑4 (MQ=255) cccTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCAcgc < 7:87912/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCAcgc > 1:73016/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCAcgc > 2:200733/1‑148 (MQ=255) gCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAg < 5:256791/147‑1 (MQ=255) gCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAg < 2:237199/147‑1 (MQ=255) tgtgCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGa < 1:200733/149‑1 (MQ=255) gCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGacac > 6:95543/1‑149 (MQ=255) aTCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGtt > 8:14771/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAACAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTcgc > 3:147747/1‑149 (MQ=255) ccTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGa < 1:182961/134‑1 (MQ=255) ccTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGa > 2:182961/1‑134 (MQ=255) ggtgtggtgCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGt > 8:168969/1‑149 (MQ=255) gtggtgCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑gg < 5:95543/149‑1 (MQ=255) gtgCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGt > 7:85138/1‑149 (MQ=255) cTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGa < 2:278201/148‑1 (MQ=255) tGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑ggg > 8:97617/1‑143 (MQ=255) tGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑ggg < 7:97617/143‑1 (MQ=255) cgcgcgGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGTGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTcc < 2:136945/148‑1 (MQ=255) cgcgGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCctgc < 7:14771/149‑1 (MQ=255) gcgGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCacccggccgctggccaaggggcggtctgctgt < 6:246994‑M1/104‑33 (MQ=255) gcgGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCacccggccgctggccaaggggcggtctgctgt > 5:246994‑M1/1‑72 (MQ=255) gccggcTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCacccggccgctggccaaggggcg < 4:57228‑M1/92‑24 (MQ=255) gccggcTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCacccggccgctggccaaggggcg > 3:57228‑M1/1‑69 (MQ=255) gccggcTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGt > 7:65255/1‑149 (MQ=255) cggcTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGc > 1:77712/1‑149 (MQ=255) ggcTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCt < 2:73016/149‑1 (MQ=255) cATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCAcc < 5:102553/148‑1 (MQ=255) cAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCaa > 8:88538/1‑147 (MQ=255) aaCGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAg > 6:136708/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTCGGGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCt > 7:253304/1‑149 (MQ=255) cAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGTTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGt > 1:301620/1‑149 (MQ=255) aaGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGc < 4:146030/132‑1 (MQ=255) aaGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGc > 3:146030/1‑132 (MQ=255) ggTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGTTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGt < 2:301620/149‑1 (MQ=255) ttGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTc < 2:298282/149‑1 (MQ=255) aCGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCgg < 7:168969/148‑1 (MQ=255) tCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGcc < 2:77712/149‑1 (MQ=255) aaGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCtt < 8:85138/149‑1 (MQ=255) cgcACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCTTGGc < 8:65255/149‑1 (MQ=255) acaGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTgcggtctgctgtgcgcttgacgtggccgtcaaccttgcggtcggcaaagtcgttgatgcagcagccggccgc < 6:246994‑M2/104‑73 (MQ=255) acaGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTgcggtctgctgtgcgcttgacgtggccgtcaaccttgcggtcggcaaagtcgttgatgcagcagccggccgc > 5:246994‑M2/1‑32 (MQ=255) agcagACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCTTGGCGTTCt < 5:136708/149‑1 (MQ=255) agcagACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCTTGGCGTTCt < 7:88538/149‑1 (MQ=255) agcagACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCTTGGCGTTCt > 6:15984/1‑149 (MQ=255) aCCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCctgct < 7:289313/82‑1 (MQ=255) aCCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCctgct > 8:289313/1‑82 (MQ=255) cGCacccggccgctggccaaggggcggtctgctgtgcgcttgacgtggccgtcaaccttgcggtcggcaaagtcgttgatgcagcagccggccgcgcgcatcagcaccacaccaaggccgaagatgagcacattggccagggtgggtga < 1:298282‑M1/149‑147 (MQ=255) cGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTgcggtctgctgtgcgcttgacgtggccgtcaaccttgcggtcggcaaagtcgttgatgcagcagccggc > 3:57228‑M2/1‑23 (MQ=255) cGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTgcggtctgctgtgcgcttgacgtggccgtcaaccttgcggtcggcaaagtcgttgatgcagcagccggc < 4:57228‑M2/92‑70 (MQ=255) cGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCTTGGCGTTCTGCTAccc > 8:115531/1‑149 (MQ=255) cGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCTTGGCGTTCTGCTAccc > 1:140565/1‑149 (MQ=255) cGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCTTGGCGTTCTGCTAccc > 2:6934/1‑149 (MQ=255) ccccTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCTTGGCGTTCTGCTa > 7:210297/1‑144 (MQ=255) ccccTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCTTGGCGTTCTGCTa < 8:210297/144‑1 (MQ=255) | CGGCAATGGGTCACCCACCCTGGCCAATGTGCTCATCTTCGGCCTTGGTGTGGTGCTGATGCGCGCGGCCGGCTGCTGCATCAACGACTTTGCCGACCGCAAGGTTGACGGCCACGTCAAGCGCACAGCAGACCGCCCCTTGGCCAGCGGCCGGGTGCGGCCACGCGAGGCGCTGACACTGTTCGCGATTCTGGTC‑GGGGTGAGTTTCCTGCTGGTGCTGTGCACCAACAGCCGCACTGTCTGGCTGTCGTTCGGGGCGGTGGCCTTGGCGTTCTGCTACCC > NC_002947/6063803‑6064084 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |