New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 634613 | 75 (1.530) | 4 (0.090) | 4/246 | NT | 5.2% | coding (919/2016 nt) | PP_0546 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 634660 | 76 (1.660) | coding (966/2016 nt) | PP_0546 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
CGTGCAGCCATGACGAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTCGCCCAGGC > NC_002947/634512‑634806 | cgTGCAGCCATGACGAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCgg < 6:228544/149‑1 (MQ=255) gCCATGACGAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGcccg < 7:115220‑M2/147‑5 (MQ=255) ccATGACGAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGcccgcag > 8:17543‑M2/1‑142 (MQ=255) aCGAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTg > 7:42229/1‑147 (MQ=255) cGAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAg > 5:141438/1‑149 (MQ=255) cGAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAg > 8:199112/1‑149 (MQ=255) cGAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAg > 7:283374/1‑149 (MQ=255) gAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGTCGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGt < 8:119236/149‑1 (MQ=255) gAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGt < 5:118537/149‑1 (MQ=255) gAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGt > 1:19902/1‑149 (MQ=255) gAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGt < 8:115220/149‑1 (MQ=255) aaaTGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTg > 3:190255/1‑149 (MQ=255) aTGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGa < 2:220751/149‑1 (MQ=255) gTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGc > 1:57685/1‑149 (MQ=255) ttCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGcc > 5:188865/1‑149 (MQ=255) ttCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGcc > 5:198076/1‑149 (MQ=255) gCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTg > 1:35918/1‑149 (MQ=255) cGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCACCCGCCGCCCGCAGGTCAAGTGGAGCCGCTGgt > 8:147668/1‑149 (MQ=255) tGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGgtct < 6:198076/149‑1 (MQ=255) cACGCCGGGCGTCAGGGCTGTCTGGCCGCTGCGCACGCTGGACGGTGGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGgtctgtc < 7:147668/149‑1 (MQ=255) cACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGgtctgtc < 2:19902/149‑1 (MQ=255) cACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGgtctgtc > 2:143818/1‑149 (MQ=255) cGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGtctgtctg < 3:85165/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGc < 2:157658/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGc < 6:141438/149‑1 (MQ=255) cggcAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGAcc < 4:216083/149‑1 (MQ=255) ggcAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGAccc > 5:123941/1‑149 (MQ=255) gTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCg > 5:294195/1‑149 (MQ=255) tGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTg > 2:150926/1‑148 (MQ=255) tCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTAACCCT‑GCGTTGc < 8:42229/147‑1 (MQ=255) tGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCaaaa > 8:257155/1‑149 (MQ=255) gCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAAt < 6:121756/148‑1 (MQ=255) cGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGAt > 8:14089/1‑149 (MQ=255) cgcACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTccg > 2:101126/1‑149 (MQ=255) cACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTccgcc < 4:190255/149‑1 (MQ=255) ccTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTccgccg > 5:172831/1‑147 (MQ=255) ccTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTccgccg > 4:233663/1‑147 (MQ=255) ccTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCa > 5:177089/1‑149 (MQ=255) gACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCAGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGt > 4:178897/1‑149 (MQ=255) aCGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTg < 6:188865/149‑1 (MQ=255) cGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGc > 8:9649/1‑149 (MQ=255) gTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCgg < 2:254312/149‑1 (MQ=255) cAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGTGGGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGgtgt > 1:63049/1‑149 (MQ=255) cAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGtt < 1:214807/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTccgcc < 4:164464/123‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTccgcc > 3:164464/1‑123 (MQ=255) aGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGAtgt < 3:233663/149‑1 (MQ=255) gCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGcccgcaggctggcgaacacctggcgaccgtccagggtgcgcagcggccagacagcactgccgccgggcgtggcacggctgaacatttcgtcat > 7:121099‑M2/1‑56 (MQ=255) gCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGcccgcaggctggcgaacacctggcgaccgtccagggtgcgcagcggccagacagcactgccgccgggcgtggcacggctgaacatttcgtcat < 8:121099‑M2/149‑94 (MQ=255) gCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGAtgtg > 5:68289/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGcccgcaggctggcgaacacctggcgaccgtccagggtgcgcagcggccagacagcactgccgccgggcgtggcacggctgaa > 7:133753‑M2/1‑55 (MQ=255) ccTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGcccgcaggctggcgaacacctggcgaccgtccagggtgcgcagcggccagacagcactgccgccgggcgtggcacggctgaa < 8:133753‑M2/137‑83 (MQ=255) cTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCTCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGc > 7:208719/1‑148 (MQ=255) cGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCAt < 6:294195/148‑1 (MQ=255) gggCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATtgct > 2:32284/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATtgctgc > 6:257259/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTCTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGAGCCATtgctgc > 7:158238/1‑149 (MQ=255) cAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATtgctgct > 1:302960/1‑149 (MQ=255) aGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATtgctgctg > 3:257368/1‑149 (MQ=255) aGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATtgctgctg > 1:135542/1‑149 (MQ=255) cccGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTgcgc < 7:14089/149‑1 (MQ=255) cgcCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCgag < 2:57685/149‑1 (MQ=255) gcCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCgaga < 6:177089/149‑1 (MQ=255) gcCGGTGG‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCgaga < 6:172831/149‑1 (MQ=255) cGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGAcc < 1:150926/149‑1 (MQ=255) gtgt‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCgg > 1:176096/1‑149 (MQ=255) tgt‑gGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGc < 6:123941/149‑1 (MQ=255) ggTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGGCTGTCTGCTTGACACT‑GCGGTGCAAAATGATTTACGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCtgt < 7:199112/149‑1 (MQ=255) gTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCtgt < 1:32284/148‑1 (MQ=255) gTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCtgt < 4:257368/148‑1 (MQ=255) tCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTgg < 6:68289/149‑1 (MQ=255) tCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTgg < 2:302960/149‑1 (MQ=255) gTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCTAGCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGCCCGGCTGTGGc > 1:91267/1‑148 (MQ=255) gTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCaa < 2:135542/149‑1 (MQ=255) gTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCaa < 5:152941/149‑1 (MQ=255) cggccgCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAgg > 7:261283/1‑147 (MQ=255) cggccgCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGaa < 2:176096/149‑1 (MQ=255) ggccgCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAg < 2:35918/149‑1 (MQ=255) cgccCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCt > 8:282055/1‑149 (MQ=255) gccCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGCAGCCtt > 7:141332/1‑149 (MQ=255) gccCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGAGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGCCCTGATGTGGCAAGGAAGcag > 8:281762/1‑146 (MQ=255) cccAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTc < 1:101126/149‑1 (MQ=255) cccAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTc > 1:295645/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTCg > 5:194060/1‑149 (MQ=255) cAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTCGc < 3:178897/149‑1 (MQ=255) aGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTCGcc > 2:174986/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTCGcc > 5:24564/1‑147 (MQ=255) cgcgGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTCGCCCAg < 6:194060/149‑1 (MQ=255) gcgGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTCGCCCAgg < 2:63049/149‑1 (MQ=255) gcgGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTCGCCCAgg < 8:283374/149‑1 (MQ=255) cgGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTCGCCCAGGc > 5:107137/1‑149 (MQ=255) | CGTGCAGCCATGACGAAATGTTCAGCCGTGCCACGCCCGGCGGCAGTGCTGTCTGGCCGCTGCGCACCCTGGACGGTCGCCAGGTGTTCGCCAGCCTGCGGGGGCAGGCCCGGGCGCCGGTGT‑GGTCGGTGCCGGCCGCCCAGCCGCGGCCCGCAGGTGAAGTGGAGCCGCTGGTCTGTCTGCTTGACCCT‑GCGTTGCAAAATGATTTCCGCCGCAGCGTGCGGGTGTTCGAGCGCGATGTGCCATTGCTGCTGCGCGGCGAGACCGGCTGTGGCAAGGAAGCCTTCGCCCAGGC > NC_002947/634512‑634806 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |