New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1578505 = | 56 (1.140) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 5.4% | coding (2892/3153 nt) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB |
? | NC_002947 | 1578560 = | 50 (1.050) | coding (2837/3153 nt) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB |
CCGGCGCCGGCGCCGCTGGCGATGGTCAACGGTACCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATACCCAGCGGTACTACCAGCACCAC > NC_002947/1578413‑1578702 | ctgcgcggcctgtccaacgacgtgtacttcctggttggcctgttgaccaccatcggtcttgcggcgaaaaacgccattctgatcgtggaattCGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGaa > 4:298748‑M1/93‑149 (MQ=255) cggcgccggcgcCGCTGGCGATGGTCAACGGTACCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAAt < 2:285567/149‑1 (MQ=255) gccggcgccgCTGGCGATGGTCAACGGTACCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCa < 7:18887/149‑1 (MQ=255) gccggcgccgCTGGCGATGGTCAACGGTACCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCa < 4:78438/149‑1 (MQ=255) gcctgtccaacgacgtgtacttcctggttggcatgttgaccaccatcggtcttgcggcgaaaaacgccattctgatcgtggaattCGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACg > 3:104002‑M1/86‑149 (MQ=255) cggcgccgCTGGCGATGGTCAACGGTACCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACg < 8:147151/149‑1 (MQ=255) tGGCGATGGTCAACGGTACCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCACTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATg < 2:97365/149‑1 (MQ=255) gCGATGGTCAACGGTACCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGc < 4:279917/149‑1 (MQ=255) tGGTCAACGGTACCACGCCCAGGATGAACGCCTGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGttt < 8:114453/149‑1 (MQ=255) tCAACGGTACCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGAACGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTc > 1:219487/1‑149 (MQ=255) cAACGGTACCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTcg > 2:105977/1‑149 (MQ=255) tACCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCaa < 7:90235/149‑1 (MQ=255) aCCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTcgccgc > 6:179291/1‑146 (MQ=255) ccACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGa > 3:86948/1‑149 (MQ=255) cGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGAcc > 4:54035/1‑148 (MQ=255) cccAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGAt < 1:239900/149‑1 (MQ=255) ccAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGAtg > 5:249105/1‑149 (MQ=255) gAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTc < 2:219487/148‑1 (MQ=255) aaggCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCaa < 8:73938/146‑1 (MQ=255) aCGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTAGCCGCAAGACCGATGGTGGTCaa > 5:105690/1‑148 (MQ=255) cAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGc < 4:86948/149‑1 (MQ=255) cAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGc < 3:54035/149‑1 (MQ=255) aGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGc > 2:148344/1‑148 (MQ=255) cGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTACAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCaa > 1:246831/1‑149 (MQ=255) gAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAAc > 7:188153/1‑149 (MQ=255) ggTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCa < 2:69506/149‑1 (MQ=255) atgatgATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAgg > 1:303273/1‑147 (MQ=255) atgatgATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGaa < 7:10661/149‑1 (MQ=255) gatgatCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAg > 8:31004/1‑148 (MQ=255) tgatCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTac < 1:119770/149‑1 (MQ=255) ggCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAgg < 3:41126/137‑1 (MQ=255) ggCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAgg > 4:41126/1‑137 (MQ=255) gcAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGAtggtg < 4:53190/116‑1 (MQ=255) gcAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGAtggtg > 3:53190/1‑116 (MQ=255) gcAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTg < 6:249105/149‑1 (MQ=255) cAGACGCATGCGGCACGACACGATCCCTGCGTCGTACACGCTCCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCAATCGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCCCCGCAAGACAGATGCAGGTCAACAGGCCAACCAGCAAGTAAACTTCGATg > 2:290536/1‑148 (MQ=255) cgtggaattcgccaaggagctgcacgaacaaggccgcagcctgtacgacgcagcgatcgaggcgAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACATGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGc > 3:104002‑M2/65‑149 (MQ=255) aTGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGcc > 5:239978/1‑149 (MQ=255) ttcgccaaggagctgcacgaacaaggccgcagcctgtacgacgcagcgatcgaggcgAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAg > 4:298748‑M2/58‑149 (MQ=255) CTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTACAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTgg > 2:246831‑M1/1‑149 (MQ=255) aggagctgcacgaacaaggccgcagcctgtacgacgcagcgatcgaggcgAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCtggtg < 3:298748‑M2/99‑1 (MQ=255) cGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGa > 3:255160/1‑149 (MQ=255) tGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGAt > 6:84385/1‑147 (MQ=255) cAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCg < 1:148344/148‑1 (MQ=255) aGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAgc > 5:38376/1‑141 (MQ=255) aGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAgc < 6:38376/141‑1 (MQ=255) aGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCgat < 5:84385/149‑1 (MQ=255) gggtGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTGCTTGGCGAATTCCACCATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATTGTTGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCgatg < 6:105690/146‑1 (MQ=255) gCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGAtggtg < 7:34282/76‑1 (MQ=255) gCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGAtggtg > 8:34282/1‑76 (MQ=255) cGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATAcc < 1:147304/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCtggtgg > 7:270905/1‑126 (MQ=255) ggCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCtggtgg < 8:270905/126‑1 (MQ=255) tGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATACCCAGCGGtactac < 7:31004/149‑1 (MQ=255) tGCAGCTCCTTGGAGAATTCCACGATCAGAATGGAGTTTTTCGCCGCAAGACCGATTGTGGTCAACAGGCCAACCAGTAAGTACACGTCGTTGGTCAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATACCCAGCGGtactac < 1:290536/149‑1 (MQ=255) gCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTTGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATACCCAGCGGTACTACCAg > 5:143343/1‑148 (MQ=255) gCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATACCCAGCGGTACTACCAg > 5:12217/1‑148 (MQ=255) atcgaggcgAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACATGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATACCCAGCGGTACTACCAGcac < 4:104002‑M2/140‑1 (MQ=255) cTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATACCCAGCGGTACTACCAGcac < 5:179291/147‑1 (MQ=255) ggcgAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATGCCCAGCGGTACTACCAGcaccac < 8:188153‑M2/143‑1 (MQ=255) cgAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGcc > 6:125760‑M2/3‑88 (MQ=255) cgAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGcc < 5:125760‑M2/86‑1 (MQ=255) gAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATACCCa < 6:271101‑M2/124‑1 (MQ=255) gAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATACCCa > 5:271101‑M2/2‑125 (MQ=255) | CCGGCGCCGGCGCCGCTGGCGATGGTCAACGGTACCACGCCCAGGATGAACGCCAGCGAGGTCATGATGATCGGGCGCAGACGCATGCGGCACGCCTCGATCGCTGCGTCGTACAGGCTGCGGCCTTGTTCGTGCAGCTCCTTGGCGAATTCCACGATCAGAATGGCGTTTTTCGCCGCAAGACCGATGGTGGTCAACAGGCCAACCAGGAAGTACACGTCGTTGGACAGGCCGCGCAGGCTGGTGGCGATCAGCGCACCGATGATACCCAGCGGTACTACCAGCACCAC > NC_002947/1578413‑1578702 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |