New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1824801 = | 34 (0.690) | 4 (0.090) | 4/246 | NT | 11.0% | coding (453/2574 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
? | NC_002947 | 1824867 = | 33 (0.720) | coding (387/2574 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
GGGATCAACAGCTCGACCGGGTTCAGGCGCTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGCTCACAGATCACCACCGACTCGCCGAGCTTGAC > NC_002947/1824721‑1825013 | tggagcgccaggtggtgcgcatcatcaccccgggtacggtcagtgacgaggcactgctcgacgagcgccgcgacaacctgATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAg > 7:274022‑M1/81‑149 (MQ=255) gggATCAACAGCTCGACCGGGTTCAGGCGCTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAg > 4:138660/1‑149 (MQ=255) gggATCAACAGCTCGACCGGGTTCAGGCGCTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGACGCTGGTGATGTCCAGTACAGCCAGGCCGAACATGCGCTCGTCACCGAGAAGGGCGGCAATCAg > 3:185836/1‑149 (MQ=255) cAACAGCTCGACCGGGTTCAGGCGCTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGt > 8:30731/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGACCGGGTTCAGGCGCTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTcgc > 4:226249/1‑149 (MQ=255) tggtgcgcatcatcaccccgggtacggtcagtgacgaggcactgctcgacgagcgccgcgacaacctgATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCa < 6:90005‑M1/68‑1 (MQ=255) tggtgcgcatcatcaccccgggtacggtcagtgacgaggcactgctcgacgagcgccgcgacaacctgATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCa > 5:90005‑M1/69‑136 (MQ=255) cGGGTTCAGGCGCTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCtcgt < 3:138660/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGc < 2:253049/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCGAGTTCCGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGc < 6:214343/148‑1 (MQ=255) gcgcTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGc < 6:12385/145‑1 (MQ=255) gcgcTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGc > 5:12385/1‑145 (MQ=255) gcTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCTAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAGATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAg < 3:94699/121‑1 (MQ=255) gcTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCAAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAGATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAg > 4:94699/1‑121 (MQ=255) gAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGt < 6:303548/149‑1 (MQ=255) ttCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCAc < 3:226249/149‑1 (MQ=255) gTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCg > 1:61396/1‑149 (MQ=255) cccAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGGCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGt < 7:111251/148‑1 (MQ=255) aGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGtgat > 7:27440/1‑148 (MQ=255) cTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACt < 3:181198/126‑1 (MQ=255) cTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACt > 4:181198/1‑126 (MQ=255) ccTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCtcgtc > 6:40322/1‑100 (MQ=255) ccTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCtcgtc < 5:40322/100‑1 (MQ=255) cTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACt > 8:264430/1‑117 (MQ=255) cTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACt < 7:264430/117‑1 (MQ=255) cTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCt > 2:289438/1‑149 (MQ=255) cTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCt > 2:191828/1‑149 (MQ=255) aCGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGgcg > 8:34767/1‑149 (MQ=255) ctgattgccgccctgctcggtgacgagcgcctgttcggcctggcggtactggacatcaccagcggcaatCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCa > 7:274022‑M2/70‑149 (MQ=255) tgattgccgccctgctcggtgacgagcgcctgttcggcctggcggtactggacatcaccagcggcaatCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGcacca < 6:90005‑M2/68‑1 (MQ=255) tgattgccgccctgctcggtgacgagcgcctgttcggcctggcggtactggacatcaccagcggcaatCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGcacca > 5:90005‑M2/69‑136 (MQ=255) GCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACAGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCAACCGGGc < 1:64903‑M1/149‑1 (MQ=255) CGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGt < 8:47418‑M1/115‑1 (MQ=255) CGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCGCGTCACTGACCGTACCCGGGGt > 7:47418‑M1/1‑115 (MQ=255) gTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCt > 8:275590/1‑149 (MQ=255) tCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGc > 5:218706/1‑149 (MQ=255) tCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGc > 7:291154/1‑149 (MQ=255) ccAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGc < 1:289438/148‑1 (MQ=255) cAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCCCCGAGCAGGGCGGCAATCACGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCATCGACACTGACCGAACACGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGccg > 2:4208/1‑147 (MQ=255) cAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCgg < 6:218706/149‑1 (MQ=255) acgagcgcctgttcggcctggcggtactggacatcaccagcggcaatCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCggg < 8:274022‑M2/102‑1 (MQ=255) aGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCggg > 5:155914/1‑149 (MQ=255) aGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCggg < 2:61396/149‑1 (MQ=255) ccGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGACCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCg > 1:25871/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGcc > 2:251404/1‑148 (MQ=255) cAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGa > 2:70626/1‑149 (MQ=255) cGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGc < 1:191828/149‑1 (MQ=255) ggcggcAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGCTCACAGATCACCACCGACTCGCCGa > 6:184749/1‑149 (MQ=255) ggcggcAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGCTCACAGATCACCACCGACTCGCCGa < 8:291154/149‑1 (MQ=255) cggcaatCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGCTCACAGATCACCACCGACTCGCCGAGc < 7:30731‑M2/142‑1 (MQ=255) caatCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGCTCACAGATCACCACCGACTCGCCGAGCtt < 3:36929‑M2/144‑1 (MQ=255) caatCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGCTCACAGATCACCACCGACTCGCCGAGCtt > 4:36929‑M2/5‑148 (MQ=255) aatCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGCTCACAGATCACCACCGACTCGCCGAGCTtgc > 4:63028‑M2/4‑148 (MQ=255) atCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGCTca > 6:126109‑M2/3‑120 (MQ=255) atCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGCTCACAGATCACCACCGACTCGCCGAGCTTGAc > 3:36642‑M2/3‑149 (MQ=255) tCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGCTCACAGATCACCACCGACTCGCCGAGCTTGAc > 4:299863‑M2/2‑148 (MQ=255) | GGGATCAACAGCTCGACCGGGTTCAGGCGCTCGAGTTCGGCCAGCAGGTTTTCCCAGCCCTTGATCTCCTGCACGCTGAAATTGCCGCTGGTGATGTCCAGTACCGCCAGGCCGAACAGGCGCTCGTCACCGAGCAGGGCGGCAATCAGGTTGTCGCGGCGCTCGTCGAGCAGTGCCTCGTCACTGACCGTACCCGGGGTGATGATGCGCACCACCTGGCGCTCCACCGGGCCCTTGCTGGTGGCGGGGTCGCCGATCTGCTCACAGATCACCACCGACTCGCCGAGCTTGAC > NC_002947/1824721‑1825013 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |