New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2378934 = | 44 (0.900) | 4 (0.090) | 4/252 | NT | 9.1% | coding (214/825 nt) | cmpX | protein CmpX |
? | NC_002947 | 2378967 = | 38 (0.810) | coding (247/825 nt) | cmpX | protein CmpX |
CGTGGTGCTGCTCGGTTTCGTGGTGGCCAAGCTGCTCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTCGGCGCGGCTCTGGTGCTGCTGG > NC_002947/2378819‑2379114 | cGTGGTGCTGCTCGGTTTCGTGGTGGCCAAGCTGCTCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGAccc > 5:266753/1‑149 (MQ=255) gtggtgCTGCTCGGTTTCGTGGTGGCCAAGCTGCTCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGAccc < 4:121115/148‑1 (MQ=255) gtggtgCTGCTCGGTTTCGTGGTGGCCAAGCTGCTCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCt > 2:239912/1‑149 (MQ=255) tacagggcgagcatgtcgagggttgccgaaacccgctcaaggcccagcgattcggcagccgagaccaggaagatgagcagcacgaaccaatagacgatcttgccgatcagGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATc > 1:108330‑M1/111‑149 (MQ=255) gctgctCGGTTTCGTGGTGGCCAAGCTGCTCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCg < 3:6800/149‑1 (MQ=255) gctCGGTTTCGTGGTGGCCAAGCTGCTCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGc > 3:151973/1‑148 (MQ=255) ctCGGTTTCGTGGTGGCCAAGCTGCTCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGc > 7:52747/1‑147 (MQ=255) tCGTGGTGGCCAAGCTGCTCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGt < 3:107980/148‑1 (MQ=255) gtggtgGACAAGCTGCTCGACACGATGCTGTCCAAACTGTTGTCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTa < 8:128692/149‑1 (MQ=255) tggtggCCAAGCTGCTCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTAt > 4:186700/1‑149 (MQ=255) tggtggCCAAGCTGCTCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTAt < 8:184810/149‑1 (MQ=255) ctCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGtgctg < 8:52747/147‑1 (MQ=255) cacGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCt > 8:44114/1‑149 (MQ=255) tgTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTc > 8:18779/1‑143 (MQ=255) tgTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTc < 7:18779/143‑1 (MQ=255) tgTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGtc > 8:8405/1‑149 (MQ=255) aaaCTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGc < 7:8405/149‑1 (MQ=255) ttGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGcc < 1:239912/147‑1 (MQ=255) ccAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCCCCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGCCCCTGATCGGCAACATCGTCTAGTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAGTCg > 2:27757/1‑149 (MQ=255) aaTTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTg < 4:151973/149‑1 (MQ=255) caggaagatgagcagcacgaaccaatagacgatcttgccgatcagGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGAt > 7:264479‑M1/46‑83 (MQ=255) caggaagatgagcagcacgaaccaatagacgatcttgccgatcagGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGAt < 8:264479‑M1/38‑1 (MQ=255) gCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCtt < 3:186700/149‑1 (MQ=255) cTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCtt > 6:210552/1‑147 (MQ=255) ggACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGc > 8:161715/1‑149 (MQ=255) ccTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCg > 2:81095/1‑118 (MQ=255) ccTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCg < 1:81095/118‑1 (MQ=255) ccGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCg < 1:300076/136‑1 (MQ=255) ccGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTCATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGACGAAACGCTGGGCCTTCAGCg > 2:300076/1‑136 (MQ=255) cGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAAccc > 3:121498/1‑149 (MQ=255) cGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAAccc > 4:80791/1‑149 (MQ=255) cACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCg < 4:121498/149‑1 (MQ=255) cTCACCAAAATGCTTGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCt > 6:305084/1‑149 (MQ=255) aCCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTc < 7:161715/147‑1 (MQ=255) aCCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGc > 2:57772/1‑149 (MQ=255) aaaaTGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCt < 5:210552/149‑1 (MQ=255) gatcagggtcgagatcggcacctggatgccgccgcgaccCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTa > 1:108330‑M2/40‑149 (MQ=255) atcagggtcgagatcggcacctggatgccgccgcgaccCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTg < 8:264479‑M2/45‑1 (MQ=255) atcagggtcgagatcggcacctggatgccgccgcgaccCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTg > 7:264479‑M2/39‑83 (MQ=255) cTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCTTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACtt < 1:57772/149‑1 (MQ=255) cTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCAGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTa < 2:63660/146‑1 (MQ=255) cTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCAGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTa > 1:63660/1‑146 (MQ=255) ggtcgagatcggcacctggatgccgccgcgaccCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGCCAACCCTCGACATCCTCGCCCTGTACTTGcc > 4:246474‑M2/34‑149 (MQ=255) GTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGccc > 7:44114‑M1/1‑149 (MQ=255) gcggcATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGgtg > 1:123123/1‑149 (MQ=255) gcATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCGGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTc < 4:218461/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGGCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCCCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTCGGCGCgg < 1:27757/149‑1 (MQ=255) cGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTc > 2:264737/1‑137 (MQ=255) cGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTc < 1:264737/137‑1 (MQ=255) gATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTCGGCGCGGCTCTgg > 7:95685/1‑149 (MQ=255) tctcGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTCGGCGCGGCTCTGGtg > 3:35931/1‑149 (MQ=255) ctcGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTCGGCGCGGCTCTGGtgc > 1:64854/1‑149 (MQ=255) gaccCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTCGGCGCGGCTCTGGtgct < 2:64854‑M2/143‑1 (MQ=255) gaccCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTCGGCGCGGCTCTGGt < 3:80791‑M2/140‑1 (MQ=255) aCCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCATGGTCTCGGCTCCCGAATCGATGGCACTTGAGCGGGTTTAGGCAACCATCGACATGCTCCACCTGTACTTGCGCAAGGTGTTCGGCCCGGCACAGCTgcttct > 8:266208/1‑149 (MQ=255) cCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTCGGCGCGGCTCTGGTGCTGCTgg > 1:49026‑M2/2‑149 (MQ=255) | CGTGGTGCTGCTCGGTTTCGTGGTGGCCAAGCTGCTCGACACGCTGCTGTCCAAACTGTTGGCCAAATTTGGCCTGGACCGCCTGATGGCCGGCACCGGCCTCACCAAAATGCTCGGTCGCGGCGGCATCCAGGTGCCGATCTCGACCCTGATCGGCAAGATCGTCTATTGGTTCGTGCTGCTCATCTTCCTGGTCTCGGCTGCCGAATCGCTGGGCCTTGAGCGGGTTTCGGCAACCCTCGACATGCTCGCCCTGTACTTGCCCAAGGTGTTCGGCGCGGCTCTGGTGCTGCTGG > NC_002947/2378819‑2379114 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |