New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2654023 = | 48 (0.980) | 4 (0.090) | 4/246 | NT | 8.5% | coding (338/498 nt) | PP_2326 | universal stress protein |
? | NC_002947 | 2654096 = | 41 (0.890) | coding (411/498 nt) | PP_2326 | universal stress protein |
TGACCTGGCGGTGATCAAGGCCGTGCGTGTGCGGCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAGGTGCAGTCCATTTCCGCGGGCATGTAACAAAATAGTTCTAGATTTATTTC > NC_002947/2653955‑2654239 | tGACCTGGCGGTGATCAAGGCCGTGCGTGTGCGGCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCAcgg > 5:251515/1‑149 (MQ=255) aCCTGGCGGTGATCAAGGCCGTGCGTGTGCGGCAGGGGGACCCGGCGCAGGTGAGTCTCGACCAGGCCCAGCTGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCAcggcg < 4:15116/149‑1 (MQ=255) gCGGTGATCAAGGCCGTGCGTGTGCGGCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGc < 2:195031/148‑1 (MQ=255) agggcaccatgtacaccggcaccggcgacagctgcagcagccgcaccgccgtgcgcCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTgggg < 2:232509‑M1/74‑1 (MQ=255) agggcaccatgtacaccggcaccggcgacagctgcagcagccgcaccgccctgcgcCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTgggg > 1:232509‑M1/57‑130 (MQ=255) gcatggCCGGGCGTGTGCGGCAGGGCGACCCGGCGCAGGGGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTTAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCAGAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGctgctg < 8:50419/145‑1 (MQ=255) aaGGCCGTGCGTGTGCGGCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGAATCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGctgctg > 3:34759/1‑147 (MQ=255) aGGCCGTGCGTGTGCGGCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAg < 8:160105/149‑1 (MQ=255) aGGCCGTGCGTGTGCGGCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAg < 8:164554/149‑1 (MQ=255) gCCGTGCGTGTGCGGCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCt < 5:162085/149‑1 (MQ=255) tgtgCGGCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCgccgg > 1:62966/1‑149 (MQ=255) cGGCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCgccggtgcc < 5:31330/149‑1 (MQ=255) ggCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCgccggtgccg < 2:246230/149‑1 (MQ=255) gCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCgccggtgccgg < 3:278308/149‑1 (MQ=255) ctgggCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACGAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCgccggtgccggt < 4:34759/147‑1 (MQ=255) cAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCgccggtgccggt < 4:5642/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCgccggtgccggt < 2:6660/149‑1 (MQ=255) gCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTa > 7:226209/1‑148 (MQ=255) gaaGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGATAAGCGTCGAACTGTTGATAATTGGTAGCCACAGTGCCCGTGCCCGCGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGAAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGCTAccca > 4:275969/3‑148 (MQ=255) tctcGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTg < 7:245232/112‑1 (MQ=255) tctcGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTg > 8:245232/1‑112 (MQ=255) tctcGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCgcag > 4:26654/1‑148 (MQ=255) aCCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTg > 2:91158/1‑149 (MQ=255) aCCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTg > 7:107256/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTgg < 7:29568/149‑1 (MQ=255) cAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTggg < 2:62966/149‑1 (MQ=255) ggCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGc > 3:17320/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCg > 2:42960/1‑149 (MQ=255) ccccagcggtacatccaccccggcaccggcactgtggctaccaaatatcaacaggtcgacgcttagccgctgggGCGCAGGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCt > 1:232509‑M2/75‑130 (MQ=255) ccccagcggtacatccaccccggcaccggcactgtggctaccaaatatcaacaggtcgacgcttagccgctgggGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCt < 2:232509‑M2/56‑1 (MQ=255) cccagcggtacatccaccccggcaccggcactgtggctaccaaatatcaacaggtcgacgcttagccgctgggGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATgg < 6:256508‑M2/50‑1 (MQ=255) cccagcggtacatccaccccggcaccggcactgtggctaccaaatatcaacaggtcgacgcttagccgctgggGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATgg > 5:256508‑M2/74‑123 (MQ=255) CCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTa > 8:226209‑M1/1‑149 (MQ=255) CAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAg < 1:39811‑M1/149‑1 (MQ=255) GGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGaa < 6:42879‑M1/148‑1 (MQ=255) GCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAg > 6:47275‑M1/1‑144 (MQ=255) GCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAg < 5:47275‑M1/144‑1 (MQ=255) gCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGa < 1:42960/149‑1 (MQ=255) gCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGa < 6:251515/149‑1 (MQ=255) cGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGaa < 2:39811/149‑1 (MQ=255) cGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGaa < 3:275969/149‑1 (MQ=255) gTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGgcgc < 4:4115/113‑1 (MQ=255) gTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGgcgc > 3:4115/1‑113 (MQ=255) gTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAg < 4:80048/145‑1 (MQ=255) gTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAg > 3:80048/1‑145 (MQ=255) gATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGGACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTTCATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAGGTGGAGt > 1:247281/1‑149 (MQ=255) gCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAGGTGCAGTCCATTTCcgc < 4:17320/148‑1 (MQ=255) cacaGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACAGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCAGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATATGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAGGTGCAGTCCATTTCCGCggg > 1:247362/1‑149 (MQ=255) aacaGTGCCGGTGCCGTGTTGGATTTACCGCTGGGGCGCACGGAGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAATATAGGTGCAGTCCATTTCCGCggg < 2:247362/148‑1 (MQ=255) acaGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAGGTGCAGTCCATTTCCGCggg > 1:280849/1‑148 (MQ=255) gtgccggGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAGGTGCAGTCCATTTCCGCGGGCATGTAACaa < 5:42879/149‑1 (MQ=255) gggTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAGGTGCAGTCCATTTCCGCGGGCATGTAACAAAATAGt > 4:20557/1‑149 (MQ=255) tACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAGGTGCAGTCCATTTCCGCGGGCATGTAACAAAATAGTTCTAGattt < 3:26654/149‑1 (MQ=255) cgctgggGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAGGTGCAGTCCATTTCCGCGGGCATGTAACAAAATAGTTCTAGatttatt > 8:5957‑M2/8‑149 (MQ=255) ctgggGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAGGTGCACTCCATTTCCGCGGGCATGTAACAAAATAGTTCTAGATTTATTTc < 1:91158‑M2/144‑1 (MQ=255) | TGACCTGGCGGTGATCAAGGCCGTGCGTGTGCGGCAGGGCGACCCGGCGCAGGTGATTCTCGACCAGGCCCAGCGGCTAAGCGTCGACCTGTTGATATTTGGTAGCCACAGTGCCGGTGCCGGGGTGGATGTACCGCTGGGGCGCACGGCGGTGCGGCTGCTGCAGCTGTCGCCGGTGCCGGTGTACATGGTGCCCTTGGCGCAGCATCTGGGGCGTAGGAAAACGTGAAGATAGGTGCAGTCCATTTCCGCGGGCATGTAACAAAATAGTTCTAGATTTATTTC > NC_002947/2653955‑2654239 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |