New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3555318 = | 31 (0.630) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 9.2% | coding (934/1203 nt) | PP_3139 | group 1 family glycosyl transferase |
? | NC_002947 | 3555365 = | 30 (0.650) | coding (981/1203 nt) | PP_3139 | group 1 family glycosyl transferase |
AGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCGCAACCGGCCGAGGTACTGCAGCGCATGGGCGAGGTGGCCTAC > NC_002947/3555217‑3555512 | ggcagtcggccatggctgttgccaactcgtccacggcaccggctgggaacagccagccgttttcgccaggccgcaccagctcggggatacccgctacatagGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGaccacc > 5:30359‑M1/102‑149 (MQ=255) gcaAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCt < 6:124560/149‑1 (MQ=255) gTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATg > 4:153985/1‑148 (MQ=255) cGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGc > 8:117207/1‑149 (MQ=255) cGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGc < 5:7204/149‑1 (MQ=255) gTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCg < 1:270270/149‑1 (MQ=255) tATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCgg < 7:117207/149‑1 (MQ=255) gATGAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGa < 7:60539/147‑1 (MQ=255) agcagTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCATCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTATCGGGTATCCCCGAGCTGGt < 6:137175/149‑1 (MQ=255) agcagTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGt > 2:172164/1‑149 (MQ=255) aGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGCGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGc < 4:8491/149‑1 (MQ=255) gAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACggctg > 3:213908/1‑149 (MQ=255) aTCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACggctggct > 3:77103/1‑149 (MQ=255) ccgccCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTcc > 8:17416/1‑147 (MQ=255) cgcTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGc < 3:153985/148‑1 (MQ=255) tGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTg > 6:177629/1‑149 (MQ=255) gTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATGATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTg < 7:292622/147‑1 (MQ=255) gCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGAc > 5:209574/1‑148 (MQ=255) cccAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGtt > 5:278733/1‑149 (MQ=255) cccAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGtt < 4:77103/149‑1 (MQ=255) ccAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTg < 5:177629/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGt > 4:30247/1‑134 (MQ=255) ttCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGt < 3:30247/134‑1 (MQ=255) ccGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGAGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGc > 2:195765/1‑148 (MQ=255) ggCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCTTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGc < 1:172164/149‑1 (MQ=255) gCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCg < 1:47929/146‑1 (MQ=255) gCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCg > 2:47929/1‑146 (MQ=255) cccGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACt < 2:225011/148‑1 (MQ=255) ggtggtcagcacgggccggcgcaaggccatggcctccatgatgaccacCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGcc > 5:30359‑M2/49‑149 (MQ=255) tggtcagcacgggccggcgcaaggccatggcctccatgatgaccacCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTg > 4:287235‑M2/47‑149 (MQ=255) TGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTg > 6:278733‑M1/1‑149 (MQ=255) gtcagcacgggccggcgcaaggccatggcctccatgatgaccacCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGgc < 3:287235‑M2/105‑1 (MQ=255) atGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCGCAAcc > 1:8118/1‑149 (MQ=255) ggAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCGCAACCgg > 3:81142/1‑149 (MQ=255) ccTTGCGCCGGCCCGTGCTGACTCCCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCGCAACCGGCCGAGGTACTg > 7:47414/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCGCAACCGGCCGAGGTACTg > 5:114913/1‑147 (MQ=255) ccGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCGCAACCGGCCGAGGTACTGCAGCGCATGGGc > 4:268910/1‑149 (MQ=255) gaccacCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCGCAACCGGCCGAGGTACTGCAGCGCATGGGCGAGGTgg > 1:32515‑M2/7‑149 (MQ=255) accacCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCGCAACCGGCCGAGGTACTGc < 8:217514‑M2/125‑1 (MQ=255) accacCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCGCAACCGGCCGAGGTACTGc > 7:217514‑M2/6‑130 (MQ=255) cTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCGCAACCGGCCGAGGTACTGCAGCGCATGGGCGAGGTGGCCTAc > 3:105938/1‑148 (MQ=255) | AGCAAGTGCGTATCACTGGCTGGATCAGCAGTGCGCAGGTACGCGAGGAAATCCTGGCCGCCCGTGCGCTGGTGCTACCCAGCTTCGCCGAGGGCTTGCCCGTGGTCATCATGGAGGCCATGGCCTTGCGCCGGCCCGTGCTGACCACCTATGTAGCGGGTATCCCCGAGCTGGTGCGGCCTGGCGAAAACGGCTGGCTGTTCCCAGCCGGTGCCGTGGACGAGTTGGCAACAGCCATGGCCGACTGCCTGGCGCAACCGGCCGAGGTACTGCAGCGCATGGGCGAGGTGGCCTAC > NC_002947/3555217‑3555512 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |