New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3558296 | 26 (0.530) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 13.0% | coding (595/1422 nt) | PP_3142 | sugar transferase |
? | NC_002947 | = 3558333 | 28 (0.590) | coding (632/1422 nt) | PP_3142 | sugar transferase |
GCAACAACCCGTGGTTTGGCGAGCGGGTGCTGGGGTGCGTGGTGCTTGACAAGGGCGATGAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTGCGGTCAATTGGGTGCCCGACATCTTCTCGTTACGCCTGATCAACCATAG > NC_002947/3558192‑3558474 | gCAACAACCCGTGGTTTGGCGAGCGGGTGCTGGGGTGCGTGGTGCTTGACAAGGGCGATGAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCggcatgg > 6:73404/1‑148 (MQ=255) aacaacCCGTGGTTTGGCGAGCGGGTGCTGGGGTGCGTGGTGCTTGACAAGGGCGATGAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCggcatggcat > 6:138541/1‑149 (MQ=255) ccGTGGTTTGGCGAGCGGGTGCTGGGGTGCGTGGTGCTTGACAAGGGCGATGAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTAc > 7:59968/1‑149 (MQ=255) tGCTGGGGTGCGTGGTGCTTGACAAGGGCGATGAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGAcgccg > 3:114559/1‑149 (MQ=255) cTGGGGTGCGTGGTGCTTGACAAGGGCGATGAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCt < 5:138541/149‑1 (MQ=255) ggggTGCGTGGTGCTTGACAAGGGCGATGAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTgg > 6:311974/1‑149 (MQ=255) ggtgCTTGACAAGGGCGATGAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTcc > 6:120700/1‑148 (MQ=255) gATGAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGGCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGGTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGAtgt < 8:59968/149‑1 (MQ=255) gAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGt > 2:24812/1‑96 (MQ=255) gAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGt < 1:24812/96‑1 (MQ=255) gCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTAAGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACt > 8:208624/1‑149 (MQ=255) gCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGCCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTAc > 2:274917/1‑148 (MQ=255) aaGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTc < 5:73404/149‑1 (MQ=255) ggAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGc < 5:311974/149‑1 (MQ=255) ggAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGc < 5:204898/149‑1 (MQ=255) gatggCAAGCAGCGCCTGCCGGGGCGGGGGCATATTGGCCACCTCGACGTGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGAACCTGGGGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTg < 2:216923/146‑1 (MQ=255) aGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCa > 4:148102/1‑149 (MQ=255) gCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCAtt < 7:208624/149‑1 (MQ=255) cAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTg < 5:120700/149‑1 (MQ=255) cAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTg < 4:114559/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGTGCTGGGTCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTGCGGTCAATTg < 1:274917/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGgcaccggcaggcgctgcttgccttcggcactttccggcccttgctcatcgcccttgtcaagcacaacgcaccccagcacccgctcgccaaaccacgggttgttgc < 1:140549‑M2/149‑106 (MQ=255) gTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGgcaccggcaggcgctgcttgccttcggcactttccggcccttgctcatcgcccttgtcaagcaccacgcaccccagcacccgctcgccaaaccacgggttgttgctga < 3:138624‑M2/149‑109 (MQ=255) cTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGgcaccggcaggcgctgcttgccttcggcactttccggcccttgctcatcgcccttgtcaagcaccacgcaccccagcacccgctcgccaaaccacgggttgttgctgatt > 4:138624‑M2/1‑38 (MQ=255) gggCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTGCGGTCAATTGGGTGCCCGACAt > 4:97801/1‑149 (MQ=255) ggCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGgcaccggcaggcgctgcttgccttcggcactttccggcccttgctcatcgcccttgtcaagcaccacgcaccccagcacccgctcgccaaaccacgggttgttgctgattttctg > 2:140549‑M2/1‑34 (MQ=255) ttGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTGCGGTCAATTGGGTGCCCGACATCTtctc < 5:40875/148‑1 (MQ=255) gCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACaa < 4:129651/109‑1 (MQ=255) gCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACaa > 3:129651/1‑109 (MQ=255) ggtggCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTGCGGTCAATTGGGTGCCCGACATCTTCTCGt < 1:106671/131‑1 (MQ=255) ggtggCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTGCGGTCAATTGGGTGCCCGACATCTTCTCGt > 2:106671/1‑131 (MQ=255) gtggCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTGCGGTCAATTGGGTGCCCGACATCTTCTCGTTACGCCTGATCAACCATAg > 5:204516/1‑149 (MQ=255) gtggCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTGCGGTCAATTGGGTGCCCGACATCTTCTCGTTACGCCTGATCAACCATAg > 8:206293/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTGCGGTCAATTGGGTGc > 7:171960/1‑112 (MQ=255) gCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTGCGGTCAATTGGGTGc < 8:171960/112‑1 (MQ=255) | GCAACAACCCGTGGTTTGGCGAGCGGGTGCTGGGGTGCGTGGTGCTTGACAAGGGCGATGAGCAAGGGCCGGAAAGTGCCGAAGGCAAGCAGCGCCTGCCGGTGCTGGGGCATATTGGCGACCTCGACGAGCTGGTGGCCCGGCATGGCATTCGTACGGTGTACCTGGTGACGCCGCTGGGGGGCTCCGAAGTCATCAACGATGTGTACTTCAAATTGCTCGACAAGTGCATTGCGGTCAATTGGGTGCCCGACATCTTCTCGTTACGCCTGATCAACCATAG > NC_002947/3558192‑3558474 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |