New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3921612 | 34 (0.690) | 4 (0.090) | 4/246 | NT | 10.3% | coding (154/1689 nt) | acs | acyl‑CoA synthetase |
? | NC_002947 | = 3921702 | 38 (0.830) | coding (64/1689 nt) | acs | acyl‑CoA synthetase |
CGGGCTGCACGCCCAGGGCCATCAGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACAGGAGGCGC > NC_002947/3921558‑3921840 | cGGGCTGCACGCCCAGGGCCATCAGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCgcc < 2:99367‑M2/148‑4 (MQ=255) cGGGCTGCACGCCCAGGGCCATCAGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGAGTCgcc < 4:13496‑M2/148‑4 (MQ=255) cTGCACGCCCAGGGCCATCAGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCgccgatgc > 3:234368‑M2/1‑141 (MQ=255) tGCACGCCCAGGGCCATCAGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCa > 6:304589/1‑149 (MQ=255) tGCACGCCCAGGGCCATCAGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCa > 3:208006/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCCATCAGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGt > 8:250249/1‑148 (MQ=255) ccAGGGCCATCAGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGt > 3:190964/1‑148 (MQ=255) ccATCAGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAgg < 4:190964/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGc > 7:65414/1‑149 (MQ=255) aGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCtt < 5:115816/149‑1 (MQ=255) gcgcgcGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTg > 5:180185/1‑149 (MQ=255) gcgGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCt > 3:277327/1‑149 (MQ=255) tGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTg > 1:34690/1‑149 (MQ=255) gTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTgg < 7:250249/148‑1 (MQ=255) gTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTgg < 4:277327/148‑1 (MQ=255) gACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCCCCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGgtg > 1:170576/1‑148 (MQ=255) gACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCgccgatgccgtcgaccagcacgcccgcgcgctgatggccctgggcgt < 8:284643‑M2/149‑48 (MQ=255) aTCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCgccgatgccgtcgaccagcacgcccgcgcgctgatggccctgggcgtgcagcc > 7:284643‑M2/1‑96 (MQ=255) ggCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCt < 8:65414/149‑1 (MQ=255) gCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTg > 1:223869/1‑149 (MQ=255) aGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTgggg < 6:180185/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGc > 1:151728/1‑149 (MQ=255) gccACGTGTAGCGCTGGGCCTGATGGTGAACCACCCGCGCCTCACGGTCGGGGGAGCGGGCTACGGTGGCGTCGACGGCGTGGCCGATGCATTGGGTCAGGGGGGGCTTGTGCTGGGTGCCGTGGGTGTAGGTTGGCTGGGGCTTGGGc > 8:143328/1‑149 (MQ=255) gccACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTgg < 4:89455/116‑1 (MQ=255) gccACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTgg > 3:89455/1‑116 (MQ=255) cctcgggtAGGGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCTTCGCCTCACGGTGGGTGATGGGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGCGTCAGCTGGGGCTTGTGCTGGGTGCCCTGGGTTTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCg < 3:13496/143‑1 (MQ=255) cGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTtc < 4:208006/149‑1 (MQ=255) gaGCGCAGGGCCTGATGGGGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCtt < 4:233497/148‑1 (MQ=255) gCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCTGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCtt < 8:100457/149‑1 (MQ=255) gATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTgtgt > 7:201501/1‑149 (MQ=255) ggTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGgtg < 8:209926/104‑1 (MQ=255) gTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGtttt < 2:34690/148‑1 (MQ=255) gTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTc < 3:262965/149‑1 (MQ=255) tGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCt > 3:297600/1‑149 (MQ=255) caGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGc < 4:297600/149‑1 (MQ=255) tCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTcg > 4:86731/1‑149 (MQ=255) cACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCgccgatgccgtcgaccagcacgcccgcgcgctgatggccctgggcgtgcagcccg < 7:35842‑M2/95‑56 (MQ=255) cACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCgccgatgccgtcgaccagcacgcccgcgcgctgatggccctgggcgtgcagcccg > 8:35842‑M2/1‑40 (MQ=255) aCGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTcg < 8:201501/147‑1 (MQ=255) gTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGt < 5:304589/149‑1 (MQ=255) gTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGt > 2:282792/1‑149 (MQ=255) gggAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTGAAc > 2:260617/1‑149 (MQ=255) tGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACagga < 1:282792/149‑1 (MQ=255) tGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACagga < 2:151728/149‑1 (MQ=255) cGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTcgcg < 7:227329/123‑1 (MQ=255) cGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTcgcg > 8:227329/1‑123 (MQ=255) tCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACAGGAGgcgc < 2:170576/149‑1 (MQ=255) | CGGGCTGCACGCCCAGGGCCATCAGCGCGCGGGCGTGCTGGTCGACGGCATCGGCCAGTTGCCGCCACGTGTAGCGCAGGGCCTGATGGTGAACCACCAGCGCCTCACGGTCGGGGAAGCGGGCTACGGTGGCGTCGAAGGCGTCGCCGATGCATTGGGTCAGCAGGGGCTTGTCCTGGGTGCCCTGGGTGTAGCTTGGCTGGGGCATGGGCGTTCTCTTGCTGTTCTTGTGTTTTCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACAGGAGGCGC > NC_002947/3921558‑3921840 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |