New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5362551 = | 70 (1.430) | 4 (0.090) | 4/246 | NT | 5.6% | coding (1215/1341 nt) | glmM | phosphoglucosamine mutase |
? | NC_002947 | 5362607 = | 68 (1.480) | coding (1159/1341 nt) | glmM | phosphoglucosamine mutase |
CTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAGCGCGGCAATGATCGCGTCGC > NC_002947/5362460‑5362753 | cTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGc < 1:73991/149‑1 (MQ=255) cTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCACAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGc < 4:196031/149‑1 (MQ=255) ttCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCt > 4:258110/1‑149 (MQ=255) cAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTc > 4:151845/1‑148 (MQ=255) aGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCa < 2:171778/149‑1 (MQ=255) cATGGGCCCGCACCTGGGGTTCGTCCGCGCCCTCAACCATGACCGGCACCAACGGCTCGGTACCTGACTTGCGCTACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAAGCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGc < 5:298243/149‑1 (MQ=255) tGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCgg < 5:258674/149‑1 (MQ=255) gCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTc > 8:135515/1‑149 (MQ=255) cccGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCCCAACCTTGACCCGCCCCAACGGCTCGGTACCGTACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCg < 2:272833/149‑1 (MQ=255) ccGCACCTGGCTTTCGTTCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGa > 2:57222/1‑149 (MQ=255) cGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGAc < 1:247957/149‑1 (MQ=255) cTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGa > 4:302896/1‑143 (MQ=255) cTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGa < 3:302896/143‑1 (MQ=255) tGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCt > 3:33367/1‑149 (MQ=255) gCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCt < 7:135515/147‑1 (MQ=255) cTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGgc < 3:151845/149‑1 (MQ=255) cTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGgc < 5:292905/149‑1 (MQ=255) tttCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGt > 1:58604/1‑135 (MQ=255) 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cATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGAt > 3:100950/1‑147 (MQ=255) cATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCa < 8:207709/149‑1 (MQ=255) aCCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCgg < 1:236873/149‑1 (MQ=255) aaCGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGTACCTGCGGGCa > 1:142698/1‑149 (MQ=255) ggTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTgcgc < 1:305460/148‑1 (MQ=255) 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cgc‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGa < 2:306089/149‑1 (MQ=255) gc‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAg > 5:138887/1‑149 (MQ=255) ttCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAgcg > 3:96237/1‑149 (MQ=255) tgccaaggttaccgaagcgctggcggggcggggtGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCAt < 6:188688‑M2/115‑1 (MQ=255) tAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATc < 4:96237/149‑1 (MQ=255) tAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATc < 3:231494/149‑1 (MQ=255) aCCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAg > 6:102346/1‑149 (MQ=255) aCTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGt > 8:181127/1‑114 (MQ=255) aCTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGt < 7:181127/114‑1 (MQ=255) tGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAgc > 4:280160/1‑149 (MQ=255) cTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAGcgcg < 8:26186/149‑1 (MQ=255) ttCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAGCGCgg > 2:14103/1‑149 (MQ=255) ccTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAGCGCgg < 6:138887/147‑1 (MQ=255) gACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAGCGCGGCAAt < 8:202446/147‑1 (MQ=255) ggcggggtGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGACCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTTCCGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAGCGCGGCAATGATc < 1:67015‑M2/141‑1 (MQ=255) gcggggtGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAGCGCGGCAATGATcgc < 6:27518‑M2/142‑1 (MQ=255) gggtGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCCGCGGGGCAATGATTGCGTc > 3:32776‑M2/5‑149 (MQ=255) ggtGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAGCGCGGCAATGATCGCGTCg > 1:6877‑M2/4‑149 (MQ=255) gtGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAGCGCGGCAAtgatcgcgagat > 3:180492‑M2/3‑145 (MQ=255) gtGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAGCGCGGCAATGATcgc < 4:180492‑M2/142‑1 (MQ=255) | CTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCC‑AGCGC‑TTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTT‑CGCCCCGGCGCTTGAGCGCCATCAGCACCTGCAGCGCGGCAATGATCGCGTCGC > NC_002947/5362460‑5362753 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |