New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5648364 | 45 (0.920) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 6.5% | coding (150/297 nt) | PP_4957 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5648394 | 43 (0.910) | coding (120/297 nt) | PP_4957 | hypothetical protein |
GCCGCAAGTGACGGATGATCCACTGCTTGTCGATCGCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTTCCATGCTGCATGTTCCTTAGAGGTT > NC_002947/5648246‑5648534 | gCCGCAAGTGACGGATGATCCACTGCTTGTCGATCGCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTTGTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGCTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCtgtg > 5:177186/1‑149 (MQ=255) cGCAAGTGACGGATGATCCACTGCTTGTCGATCGCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCtgtg < 1:110168/147‑1 (MQ=255) tGACGGATGATCCACTGCTTGTCGATCGCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACgggg > 8:278123/1‑149 (MQ=255) tCCACTGCTTGTCGATCGCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGTCGATAGTGTCCTGCGCTGTGCGACggg < 7:231669/138‑1 (MQ=255) cACTGCTTGTCGATCGCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGc < 7:278123/149‑1 (MQ=255) aCTGCTTGTCGATCGCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGcc < 2:13938/149‑1 (MQ=255) cTGCTTGTCGATCGCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCt > 3:177541/1‑149 (MQ=255) cTGCTTGTCGATCGCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCCGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCt < 3:269616/149‑1 (MQ=255) gATCGCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAggg > 2:119620/1‑149 (MQ=255) gCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAgggcggg < 4:177541/149‑1 (MQ=255) ccccccAGTCATGGATGCGATAATGCCCGGGGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAgggcggg > 1:25325/1‑148 (MQ=255) ccccAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCAc > 1:191539/1‑149 (MQ=255) aGTCATGGATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTg < 2:25325/149‑1 (MQ=255) aaTGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGGGACgg > 4:293725/1‑106 (MQ=255) aaTGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGGGACgg < 3:293725/106‑1 (MQ=255) cccGGCGTGGGTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCg < 5:271532/148‑1 (MQ=255) ccGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGAt > 1:251994/1‑149 (MQ=255) cGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATc < 2:191539/149‑1 (MQ=255) ggggTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCa < 2:251994/146‑1 (MQ=255) tggcgtgcgCCTTCCTGCTGGTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGc < 6:177186/147‑1 (MQ=255) cgtgcgCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCAc < 5:22353/149‑1 (MQ=255) cgcCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGcc > 7:90591/1‑143 (MQ=255) cgcCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGcc < 8:90591/143‑1 (MQ=255) cgcCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTAc < 1:15490/149‑1 (MQ=255) ccTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAg > 1:271564/1‑149 (MQ=255) ccTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAg < 2:271564/149‑1 (MQ=255) tgctgTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGgcggcg > 7:11857/1‑149 (MQ=255) ctgTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGcggcgg < 3:25633/148‑1 (MQ=255) ctgTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGcggcgg > 1:11049/1‑148 (MQ=255) gTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTg < 7:252418/112‑1 (MQ=255) gTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTg > 8:252418/1‑112 (MQ=255) aCTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAgctg > 4:100370/1‑149 (MQ=255) cTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAgctgc > 7:135923/1‑149 (MQ=255) gCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAg < 5:101530/114‑1 (MQ=255) gCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAg > 6:101530/1‑114 (MQ=255) gACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCCGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTgg > 5:244068/1‑149 (MQ=255) cGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTc < 6:290962/149‑1 (MQ=255) tGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGcgacctggacatcgtctgcgagttcgaacagcaggaaggcgcacgcaaccacgccgggcattatcgcattcatgactggggggcgatcgacaagcagtggatcatccg < 1:286599‑M2/149‑109 (MQ=255) ccAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGcgacctggacatcgtctgcgagttcgaacagcaggaaggcgcacgcaaccacgccgggcattatcgcattcatgactggggggcgatcgacaagcagtg < 5:225139‑M2/137‑100 (MQ=255) ccAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGcgacctggacatcgtctgcgagttcgaacagcaggaaggcgcacgcaaccacgccgggcattatcgcattcatgactggggggcgatcgacaagcagtg > 6:225139‑M2/1‑38 (MQ=255) ccAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCt > 2:284178/1‑148 (MQ=255) tCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTTc > 2:107177/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACtt > 5:230091/1‑145 (MQ=255) gCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACtt < 6:230091/145‑1 (MQ=255) gcgcGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTTCCAtgctg > 2:94209/1‑149 (MQ=255) gcgcGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTTCCAtgctg < 1:284178/149‑1 (MQ=255) gcgACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTTCCATGCTGCa < 1:107177/149‑1 (MQ=255) gacgaTAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTTCCATGCTGCATg > 3:16395/1‑149 (MQ=255) acgaTAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTTCCATGCTGCATGt < 6:244068/149‑1 (MQ=255) gtgtCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTTCCATGCTGCATGTTCCt > 2:248343/1‑147 (MQ=255) cgCTGCGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCCCGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGCACAGGCGGCGGCAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTACCATGCTGCATGTTCCTTAGAgggt < 8:11857/146‑3 (MQ=255) aGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTTCCATGCTGCATGTTCCTTAGAGGtt < 5:124555/147‑1 (MQ=255) gtgCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTTCCAtgct < 2:197456/125‑1 (MQ=255) | GCCGCAAGTGACGGATGATCCACTGCTTGTCGATCGCCCCCCAGTCATGAATGCGATAATGCCCGGCGTGGTTGCGTGCGCCTTCCTGCTGTTCGAACTCGCAGACGATGTCCAGGTCGGCCAGCGCGACGATAGTGTCCTGAGCTGTGCGACGGGGCATGCCGGTGGCCTCCATCAGGGCGGGCACGCTGGTCGCGGTCTGGCTATCGATCAGCCAGGCCACGTACAGGCGGCGGTAGAAGCTGCTCTTGGTCTTGCTCACTTCCATGCTGCATGTTCCTTAGAGGTT > NC_002947/5648246‑5648534 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |