New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5712442 | 46 (0.940) | 3 (0.060) | 3/252 | NT | 6.5% | coding (511/624 nt) | PP_5012 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5712482 | 42 (0.890) | coding (551/624 nt) | PP_5012 | hypothetical protein |
GCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCAGCGTGTGGTGATCCGCTACCGCCTCGATGACCTGCTGTTC > NC_002947/5712334‑5712629 | gccggccATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGaa < 7:10599/149‑1 (MQ=255) cGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAgc > 2:72736‑M2/1‑147 (MQ=255) atatCCCCCTGCGCGCTCGCTTGACTCGCCAAGGCCTGAAACCTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCAGGCCGAACAATCCCGAACCCTCGTCGTCAAGCCCGAGACCCAAGCCTCCTTCAGCGAACTCGATTCCTTGAAGCTTGa > 8:210562/1‑148 (MQ=255) tatCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATa < 7:225154/149‑1 (MQ=255) atCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATa > 4:90398/1‑148 (MQ=255) atCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATa > 3:211954/1‑148 (MQ=255) atCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGACACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCAGGCCGAAGAATCCCTTACCCTGGACGGCAAGCGCGAGTCCTAAGACGCCTTCAGCGAGCTCGATGCATTCAAGCTAGATa > 3:158990/1‑148 (MQ=255) tCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATAc < 6:45920/148‑1 (MQ=255) tCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACa < 8:144895/149‑1 (MQ=255) cTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAAc < 4:99565/148‑1 (MQ=255) cTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAAc > 3:99565/1‑148 (MQ=255) tGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGc > 8:153458/1‑149 (MQ=255) tGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAgcgcg > 2:307316/1‑149 (MQ=255) gACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAgcgcg < 8:252181/147‑1 (MQ=255) aCTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGcc > 8:33031/1‑148 (MQ=255) gCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAg > 1:191688/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAgc < 8:233914/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAgc > 6:68777/1‑149 (MQ=255) ccTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGt < 7:181519/149‑1 (MQ=255) tGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAgcgc > 2:86922/1‑143 (MQ=255) tGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAgcgc < 1:86922/143‑1 (MQ=255) tGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTcc > 2:294/1‑149 (MQ=255) ggCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTccc > 1:128267/1‑149 (MQ=255) gCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTccc < 6:271412/148‑1 (MQ=255) gTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATcc < 6:59026/149‑1 (MQ=255) tttCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATccc < 7:153458/149‑1 (MQ=255) aaCCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAg > 8:117439/1‑149 (MQ=255) aCCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGc < 7:117439/149‑1 (MQ=255) tCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATa < 4:114987/148‑1 (MQ=255) cGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAAc < 5:68777/148‑1 (MQ=255) gAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGc < 7:33031/149‑1 (MQ=255) aTACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCa < 2:191688/148‑1 (MQ=255) cGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCATCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAgctgct > 4:47551/1‑149 (MQ=255) gaagaaTCCCTTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTc < 7:210562/149‑1 (MQ=255) gaagaaTCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAgctgc > 6:254540/1‑147 (MQ=255) gaagaaTCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAgctgc < 5:254540/147‑1 (MQ=255) ccGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATc < 2:53086/108‑1 (MQ=255) ccGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTcc < 4:211954/148‑1 (MQ=255) aCCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGt > 6:103384/1‑149 (MQ=255) ggCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCg > 3:123063/1‑148 (MQ=255) ggCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTAGAAgcttgccgaccagggtacgggattcttcggccaggtattcggacaggttctggctgaaacgtgccaggccttggcgagtccagcgagcgcgcaggcggatat < 2:190096‑M2/149‑103 (MQ=255) cAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAgcttgccgaccagggtacgggattcttcggccaggtattcggacaggttctggc > 7:35295‑M2/1‑45 (MQ=255) cAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAgcttgccgaccagggtacgggattcttcggccaggtattcggacaggttctggc < 8:35295‑M2/99‑55 (MQ=255) aaGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGAt < 7:97548/99‑1 (MQ=255) aaGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGAt > 8:97548/1‑99 (MQ=255) gcgcGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCa < 3:90398/149‑1 (MQ=255) gCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCCCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCAGCGtgtg < 6:156446/149‑1 (MQ=255) ccGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCTTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCAGCGTgtgg < 3:47551/149‑1 (MQ=255) ccGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCAGCGTgtgg < 5:103384/149‑1 (MQ=255) ccGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCAGCGTgtgg < 1:294/149‑1 (MQ=255) cGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTc > 2:9521/1‑133 (MQ=255) cGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTc < 1:9521/133‑1 (MQ=255) tCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCAGCGTGTGGTGATCCGCTAcc > 1:275589/1‑149 (MQ=255) gATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCAGCGTGTGGTGATCCGCTACCGCCTCGATGAc > 7:70034/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCAGCGTGTGGTGATCCGCTACCGCCTCGATGACctgctg > 5:111357/1‑149 (MQ=255) gAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCAGCGTGTGGTGATCCGCTACCGCCTCGATGACCTGCTGtt > 1:127786/1‑149 (MQ=255) aGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCAGCGTGTGGTGATCCGCTACCGCCTCGATGACCTGCTGTTc > 5:211269/1‑148 (MQ=255) | GCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTCCGAATACCTGGCCGAAGAATCCCGTACCCTGGTCGGCAAGCGCGAGGCCGAAGCCGCCTTCAGCGAGCTCGATGCCTTGAAGCTTGATACAGAACGCCTCGAAGCGCGCCTCAAGCGCCTGTCCCGATCCCTTGATACCAGCGATAACGCATGAAGCTGCTCGCCGTCCGACGTCTTTTTCGCATCCAGCGTGTGGTGATCCGCTACCGCCTCGATGACCTGCTGTTC > NC_002947/5712334‑5712629 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |