New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5819865 = | 30 (0.610) | 3 (0.070) | 3/244 | NT | 8.6% | coding (305/591 nt) | PP_5096 | shape determination factor |
? | NC_002947 | 5819919 = | 36 (0.790) | coding (359/591 nt) | PP_5096 | shape determination factor |
CTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTG > NC_002947/5819774‑5820067 | ctgGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCAt > 5:281939/1‑149 (MQ=255) tgGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATg < 1:278576/149‑1 (MQ=255) gttggtAATCCAGGCCTTGCTGATGGTCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGTCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGAGATCATCTTCATCACCTCGCTGTTCACGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGa < 3:75018/147‑1 (MQ=255) tCCAGGCCTTGCTGATCGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATATTCTGGGTCGAGAAGATCGTCATGGTGATCGTTTcc > 4:250230/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTggg < 3:250230/149‑1 (MQ=255) cTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTg > 1:145606/1‑149 (MQ=255) tGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGTCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCAcc > 7:187845/1‑148 (MQ=255) gATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCAccc > 5:280677/1‑148 (MQ=255) tGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCcg > 7:192759/1‑149 (MQ=255) aTGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCcgg < 1:104578/148‑1 (MQ=255) cGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTg < 1:237074/148‑1 (MQ=255) ggTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGc > 2:47879/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTAc > 5:239486/1‑148 (MQ=255) cTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGAAGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCCCCCACCAGCCACAACCCGGCGGCAGAACTGGCCTAc > 8:212980/1‑148 (MQ=255) aCGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATgg > 5:127995/1‑84 (MQ=255) aCGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATgg < 6:127995/84‑1 (MQ=255) cACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGt < 6:281939/149‑1 (MQ=255) aCCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTg > 3:128666/1‑149 (MQ=255) ctgctgATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCt > 8:184378/1‑149 (MQ=255) ctgctgATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCt > 6:249726/1‑149 (MQ=255) aTGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGgcg < 1:47879/147‑1 (MQ=255) aTGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGgcg < 5:249726/147‑1 (MQ=255) ggCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTcc > 8:32555/1‑149 (MQ=255) ggCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTcc < 7:184378/149‑1 (MQ=255) gatcatcgccacccagaaaatcttcaggaacagcgaggtgatgccgatgatcgTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTccgcc > 3:6734‑M2/54‑149 (MQ=255) TCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCcgccgc < 2:248932‑M1/149‑1 (MQ=255) cgccacccagaaaatcttcaggaacagcgaggtgatgccgatgatcgTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGt > 1:229366‑M2/48‑137 (MQ=255) cgccacccagaaaatcttcaggaacagcgaggtgatgccgatgatcgTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGt < 2:229366‑M2/90‑1 (MQ=255) CGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTgg < 4:197220‑M1/149‑1 (MQ=255) gCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTg > 1:100825/1‑149 (MQ=255) gCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTg < 2:100825/149‑1 (MQ=255) tCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCa < 3:302165/149‑1 (MQ=255) cTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGt < 7:282421/117‑1 (MQ=255) cTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGt > 8:282421/1‑117 (MQ=255) cTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATc > 2:220670/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAAGTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTg < 7:212980/148‑1 (MQ=255) gCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTgg < 6:280677/149‑1 (MQ=255) ttCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGt < 4:128666/147‑1 (MQ=255) gAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATg > 3:290116/1‑148 (MQ=255) aaGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATgg < 7:32555/148‑1 (MQ=255) aGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGAc < 2:145606/149‑1 (MQ=255) ttCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACACAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCTAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGACGACTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACAtctc > 7:48279/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCg < 8:192759/148‑1 (MQ=255) ggTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGa > 4:195515/1‑149 (MQ=255) gCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCtt > 8:209244/1‑149 (MQ=255) cgatgatcgTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTc < 4:290116‑M2/140‑1 (MQ=255) atgattgTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGc > 5:188524‑M2/8‑149 (MQ=255) tCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCCCCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGCTCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAAGCTGGGGGGCATGGACATCTCGCCGCTCTTCGCCTTCCTg > 6:206348/1‑149 (MQ=255) | CTGGCGGTGGTCATCCAGGCCTTGCTGATGGGCTTTGTGCTGATGGTCACCTACGGTACCTTCGGCGACGTCCTGCACCTGCTGATGTGGGCGATCATCGGCATCACCTCGCTGTTCCTGAAGATTTTCTGGGTGGCGATGATCGTCATGGTGATCGTTTCCTGGGTTGCACCCAACAGCCACAACCCGGCGGCCGAACTGGCCTACCAGATCAGCGAGCCGGTGCTGGCGCCGTTCCGCCGCCTGGTGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTG > NC_002947/5819774‑5820067 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |