| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4032898 = | 73 (1.290) | 7 (0.130) | 7/246 | NT | 9.5% | coding (536/1008 nt) | PP_3555 | transmembrane sensor |
| ? | NC_002947 | 4032932 = | 64 (1.190) | coding (570/1008 nt) | PP_3555 | transmembrane sensor | |||||
GCCTGCATGCCAGGGCCAAGGCGGTAGCCACCGGCACTGCCCTCACTGGACACCAGCACTGAACCTTCCACCAGGGTGACCTTCACCTGGTCCTGGTACTTCCACACGTTGAACTGGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4033048‑4032898‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccggcacCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGAGCCG > NC_002947/4032932‑4033076 GCCTGCATGCCAGGGCCAAGGCGGTAGCCACCGGCACTGCCCTCACTGGACACCAGCACTGAACCTTCCACCAGGGTGACCTTCACCTGGTCCTGGTACTTCCACACGTTGAACTGGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGG > 4:112158/1‑148GCCTGCATGCCAGGGCCAAGGCGGTAGCCACCGGCACTGCCCTCACTGGACACCAGCACTGAACCTTCCACCAGGGTGACCTTCACCTGGTCCTGGTACTTCCACACGTTGAACTGGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCG < 2:113148/147‑1 CTGCATGCCAGGGCCAAGGCGGTAGCCACCGGCACTGCCCTCACTGGACACCAGCACTGAACCTTCCACCAGGGTGACCTTCACCTGGTCCTGGTACTTCCACACGTTGAACTGGGTGCCGGTGCCCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCAC > 2:266376/1‑149 CTGCATGCCAGGGCCAAGGCGGTAGCCACCGGCACTGCCCTCACTGGACACCAGCACTGAACCTTCCACCAGGGTGACCTTCACCTGGTCCTGGTACTTCCACACGTTGAACTGGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCAC > 3:252830/1‑149 CTGCATGCCAGGGCCAAGGCGGTAGCCACCGGCACTGCCCTCACTGGACACCAGCACTGAACCTTCCACCAGGGTGACCTTCACCTGGTCCTGGTACTTCCACACGTTGAACTGGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCAC > 4:324225/1‑149 CTGCATGCCAGGGCCAAGGCGGTAGCCACCGGCACTGCCCTCACTGGACACCAGCACTGAACCTTCCACCAGGGTGACCTTCACCTGGTCCTGGTACTTCCACACGTTGAACTGGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCAC > 7:174786/1‑149 CTTCCACACGTTGAACTGGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCG > 7:111261/1‑149 GTTGAACTGGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCACGCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCC > 7:166105/1‑149 AACTGGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGG < 8:111261/148‑1 GGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGC < 5:271102/133‑1 GGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGC > 6:271102/1‑133 CGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCACGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCAAGAGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCC > 2:102561/1‑148 TCTGGCCACTGCCGGCACGCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGG < 8:166105/149‑1 cCCGGCACCCAGTTCACCGTGGGGAAGGACCAGGACCAGGTGAAGGGCACCCTGGTGGAAGGGTCAGTGCTGGGGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGA < 8:337557/148‑1 CCGGCACCCATTTGAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTTAGGGCATTTGCCGGTGGGTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGA < 1:102561/149‑1 ACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGAGCCG > 5:19571/1‑147 ACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGG < 2:171334/134‑1 ACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGG > 1:171334/1‑134 GCCTGCATGCCAGGGCCAAGGCGGTAGCCACCGGCACTGCCCTCACTGGACACCAGCACTGAACCTTCCACCAGGGTGACCTTCACCTGGTCCTGGTACTTCCACACGTTGAACTGGGTGCCGGTGACCCGGGTCTGGCCACTGCCGGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4033048‑4032898‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccggcacCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGAGCCG > NC_002947/4032932‑4033076 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |