New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4032898 = | 73 (1.290) | 7 (0.130) | 7/246 | NT | 9.5% | coding (536/1008 nt) | PP_3555 | transmembrane sensor |
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ACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGAGCCGCAGC > NC_002947/4032784‑4033080 | aCCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCAcc < 3:264042/149‑1 (MQ=255) tCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAg > 3:332134/1‑149 (MQ=255) cacaCCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAg < 5:132667/147‑1 (MQ=255) ccagggccaaggcggtagccaccggcactgccctcactggacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacctggtcctggtacttccacacgttgaactggGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGtt < 8:111261‑M1/40‑1 (MQ=255) acacCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGtt > 4:89645/1‑148 (MQ=255) acCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCaa < 8:182893/149‑1 (MQ=255) gggccaaggcggtagccaccggcactgccctcactggacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacctggtcctggtacttccacacgttgaactgcGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAAc > 7:166105‑M1/106‑149 (MQ=255) cGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAAc > 2:274125/1‑148 (MQ=255) cGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACg > 3:3158/1‑149 (MQ=255) tCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGAGTTCTTCAAGGTGCGACACGACATCAGCCACCCGTTCATCGTTCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACACAGTTCAACGtctg > 1:104022/1‑148 (MQ=255) gcggtagccaccggcactgccctcactggacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacctggtcctggtacttccacacgttgaactggGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCAccc > 6:271102‑M1/98‑133 (MQ=255) gcggtagccaccggcactgccctcactggacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacctggtcctggtacttccacacgttgaactggGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCAccc < 5:271102‑M1/36‑1 (MQ=255) aCCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGTGCACGCTCAAGCGCGGAGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTTGaa < 2:104022/149‑1 (MQ=255) aCCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTgg > 2:151513/1‑147 (MQ=255) aCCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTgg > 8:174786/1‑147 (MQ=255) aCCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGaa < 1:151513/149‑1 (MQ=255) cggtagccaccggcactgccctcactggacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacctggtcctggtacttccacacgttgaactggGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAg > 7:111261‑M1/97‑149 (MQ=255) ccTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAg < 2:283561/149‑1 (MQ=255) 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8:73165/1‑149 (MQ=255) aCCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAg < 2:41135/149‑1 (MQ=255) aCCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAg < 2:94519/149‑1 (MQ=255) aCCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGCAAGTACCAGGACCAGGTGAAg < 3:89645/149‑1 (MQ=255) cAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGt > 7:191838/1‑149 (MQ=255) cAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTGCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CCGACCCGCGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGt > 7:337557/1‑149 (MQ=255) 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aTCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTgg < 7:73165/149‑1 (MQ=255) aTCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTg < 4:338635/148‑1 (MQ=255) aactgggtgccggtgacccgggtctggccactgccggcacCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTgg < 8:111261‑M2/108‑1 (MQ=255) gggtgccggtgacccgggtctggccactgccggcacCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGc > 6:271102‑M2/37‑133 (MQ=255) gggtgccggtgacccgggtctggccactgccggcacCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGc < 5:271102‑M2/97‑1 (MQ=255) 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CCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGc > 4:112158‑M1/1‑148 (MQ=255) CGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGc < 2:113148‑M1/147‑1 (MQ=255) cggtgacccgggtctggccactgccggcacCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCACGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCAAGAGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGcc > 2:102561‑M2/31‑148 (MQ=255) gC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACca > 4:133239/1‑148 (MQ=255) cAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACcac > 4:88459/1‑147 (MQ=255) tctggccactgccggcacGCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAgg < 8:166105‑M2/131‑1 (MQ=255) gACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAgg < 3:88459/149‑1 (MQ=255) ccGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCa > 2:185066/1‑134 (MQ=255) ccGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCa < 1:185066/134‑1 (MQ=255) gggTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGAc < 6:189160/149‑1 (MQ=255) cACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTc > 2:91713/1‑148 (MQ=255) cccggcacCCAGTTCACCGTGGGGAAGGACCAGGACCAGGTGAAGGGCACCCTGGTGGAAGGGTCAGTGCTGGGGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGa < 8:337557‑M2/141‑1 (MQ=255) ccggcacCCATTTGAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTTAGGGCATTTGCCGGTGGGTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGa < 1:102561‑M2/142‑1 (MQ=255) acCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAggg > 1:171334‑M2/3‑134 (MQ=255) acCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAggg < 2:171334‑M2/132‑1 (MQ=255) acCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGAGCCg > 5:19571‑M2/3‑147 (MQ=255) ccAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGAGCCGCAGc > 4:49089/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGAGCCGCAGc > 4:44306/1‑149 (MQ=255) | ACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCA‑GTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAGGCCAGCTACCACAAGGGCGACTTCGAGCCGCAGC > NC_002947/4032784‑4033080 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |