| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 4032898 = | 73 (1.290) | 7 (0.130) | 7/246 | NT | 9.5% | coding (536/1008 nt) | PP_3555 | transmembrane sensor |
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GAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAG > NC_002947/4032753‑4033046 | cggctcgaagtcgcccttgtggtagctggcctgcatgccagggccaaggcggtagccaccggcactgccctcactggacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacctggtcctggtacttccacacgttgaactggGt > 5:19571‑M1/146‑147 (MQ=255) aGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGcc > 1:283561/1‑149 (MQ=255) tcgaagtcgcccttgtggtagctggcctgcatgccagggccaaggcggtacccaccggcaaatgccctaactggacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacctggtcctggtacttccacacgttcaaatggGTGCCgg < 1:102561‑M1/7‑1 (MQ=255) tcgaagtcgcccttgtggtagctggcctgcatgccagggccaaggcggtagccaccggcactgccctcactggaccccagcactgacccttccaccagggtgcccttcacctggtcctggtccttccccacggtgaactggGTGCcggg < 8:337557‑M1/8‑2 (MQ=255) cAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAAGTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCACAAGCGCGGCGACGCGTTCTGCAAGGTGCGACCCGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCgg > 4:445/1‑147 (MQ=255) cGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTg < 5:138319/149‑1 (MQ=255) gcagcaCGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGc > 1:41135/1‑146 (MQ=255) cccttgtggtagctggcctgcatgccagggccaaggcggtagccaccggcactgccctcactggacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacctggtcctggtacttccacacgttgaactggGt > 1:171334‑M1/133‑134 (MQ=255) cccttgtggtagctggcctgcatgccagggccaaggcggtagccaccggcactgccctcactggacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacctggtcctggtacttccacacgttgaactggGt < 2:171334‑M1/2‑1 (MQ=255) ccttgtggtagctggcctgcatgccagggccaaggcggtagccaccggcactgccctcactggacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacctggtcctggtacttccacacgttgaactgcGTGCCGGCAGTGGC‑CAGa < 8:166105‑M1/18‑1 (MQ=255) caCGGTACAGCTCAATCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGAccc > 2:203671/1‑149 (MQ=255) cGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCgg < 1:196873/149‑1 (MQ=255) cGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCAACGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCgg < 1:28303/149‑1 (MQ=255) aGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAACGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTTCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCAcc < 3:445/149‑1 (MQ=255) ggcctgcatgccagggccaaggcggtagccaccggcactgccctctcttgacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacgtggtcctggtacttccacacgttgaactggGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCg > 2:102561‑M1/119‑148 (MQ=255) cAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCa > 8:178237/1‑149 (MQ=255) aaCCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCgg > 6:146818/1‑138 (MQ=255) aaCCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCgg < 5:146818/138‑1 (MQ=255) aCCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCAcc < 3:264042/149‑1 (MQ=255) 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cggtagccaccggcactgccctcactggacaccagcactgaaccttccaccagggtgaccttcacctggtcctggtacttccacacgttgaactggGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAg > 7:111261‑M1/97‑149 (MQ=255) ccTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAg < 2:283561/149‑1 (MQ=255) tCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCAcc > 7:281215/1‑125 (MQ=255) tCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTaccag > 7:253177/1‑149 (MQ=255) cTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCCACGTGTGGAAGTaccaggac > 4:252830/1‑148 (MQ=255) cAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCAcc < 2:15205/112‑1 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tGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGt < 5:261173/149‑1 (MQ=255) gCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCa < 3:65454/107‑1 (MQ=255) gCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCa > 4:65454/1‑107 (MQ=255) gcagcCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTAc < 8:191838/149‑1 (MQ=255) ccACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGcc > 3:292735/1‑149 (MQ=255) aCCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGCCtt < 8:286016/149‑1 (MQ=255) ccGTTCACCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGCCTTgg > 5:356416/1‑149 (MQ=255) aTCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTgg < 7:73165/149‑1 (MQ=255) aTCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTg < 4:338635/148‑1 (MQ=255) cgtgcCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCa < 8:253177/149‑1 (MQ=255) GTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAg > 4:324225‑M1/1‑149 (MQ=255) GTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAg > 7:174786‑M1/1‑149 (MQ=255) GTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAg > 3:252830‑M1/1‑149 (MQ=255) GTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGGCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAg > 2:266376‑M1/1‑149 (MQ=255) | GAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGC‑CAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGTGTCCAGTGAGGGCAGTGCCGGTGGCTACCGCCTTGGCCCTGGCATGCAG > NC_002947/4032753‑4033046 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |