New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5594092 = | 41 (0.720) | 7 (0.160) | 5/204 | NT | 22.2% | intergenic (‑39/+106) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
? | NC_002947 | 5594185 = | 17 (0.380) | intergenic (‑132/+13) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
GAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACC‑ACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/5594266‑5594092 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCG > NC_002947/5594185‑5594331 GAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACC‑ACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGTAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT < 8:248883/148‑1 GCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACC‑ACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG > 8:336658/1‑149 AGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACC‑ACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 5:60412/149‑1 AGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACC‑ACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 4:186931/149‑1 GGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACC‑ACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGG < 1:65710/149‑1 ATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACC‑ACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAA < 8:119047/149‑1 GTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACC‑ACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGGCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCGTTGCCGGTGTTAGCGGGGAAGCCC > 3:202818/1‑149 CGAGAGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCAACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA > 1:237265/1‑147 C‑ACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGTACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCC > 1:282542/1‑110 C‑ACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCC < 2:282542/110‑1 AAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCG > 3:184319/1‑92 AAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCG < 4:184319/92‑1 TGTGGGAGCGGGCTTTCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCC > 1:196693/1‑82 TGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCC < 2:196693/82‑1 CCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCT > 8:46785/1‑149 CCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCT > 8:77342/1‑149 CGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATTGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTT > 4:258468/1‑149 CGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGTACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTT > 1:45784/1‑149 CGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGC < 7:77342/149‑1 GGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCT > 8:143988/1‑149 CTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTGAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTG < 7:46785/149‑1 TTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACT > 1:99955/1‑148 TCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGG < 3:220355/138‑1 TCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGG > 4:220355/1‑138 CGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCA < 2:65710/148‑1 GCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACG > 3:52042/1‑149 GCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCT < 6:60412/149‑1 GCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACT < 5:11785/145‑1 GCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACT > 6:11785/1‑145 CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGG < 4:127899/149‑1 CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGG < 3:304820/149‑1 GCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGT < 2:183941/149‑1 CTCCCACAGGGTAAGGTGATGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGT > 6:193744/1‑148 CCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGTACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATC < 2:45784/149‑1 AGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCA < 7:248883/149‑1 GTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCG < 4:52042/149‑1 GAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACC‑ACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/5594266‑5594092 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCG > NC_002947/5594185‑5594331 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |