New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 576284 | 42 (0.740) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 7.2% | coding (1321/3069 nt) | fdoG | formate dehydrogenase‑O major subunit |
? | NC_002947 | = 576306 | 37 (0.680) | coding (1343/3069 nt) | fdoG | formate dehydrogenase‑O major subunit |
GGAAGAGATCGCCTCCTGCTCGGTTCCGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGTGACGCCGAGCAGGACTACGCCGCCTACATCGACAAGCGCGCTTCC > NC_002947/576142‑576430 | ggAAGAGATCGCCTCCTGCTCGGTTCCGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTgg < 5:258677/147‑1 (MQ=255) agagATCGCCTCCTGCTCGGTTCCGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCgggg < 2:60601/149‑1 (MQ=255) gagaTCGCCTCCTGCTCGGTTCCGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGt > 8:210532/1‑149 (MQ=255) cctcctGCTCGGTTCCGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGcc < 8:192306/149‑1 (MQ=255) cctcctGCTCGGTTCCGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGcc > 6:179196/1‑149 (MQ=255) tCGGTTCCGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATACGCAGTGCGGCCATAGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGcgg < 1:293210‑M2/149‑4 (MQ=255) ttCCGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGcggg > 8:196319‑M2/1‑142 (MQ=255) ttCCGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGcggg < 7:196319‑M2/146‑5 (MQ=255) tCCGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGGCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGcgcagggcattgaccccgccaccgggcatg < 4:273335‑M1/149‑31 (MQ=255) ccGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCAc < 1:217759/147‑1 (MQ=255) ccGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCAc > 2:217759/1‑147 (MQ=255) gCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAAc < 7:210532/149‑1 (MQ=255) gACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATc > 5:358967/1‑148 (MQ=255) tGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGc < 5:179196/149‑1 (MQ=255) gATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTga > 1:324654/1‑149 (MQ=255) cTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTgaccga > 8:73992/1‑149 (MQ=255) cTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTgaccga > 1:40701/1‑149 (MQ=255) tttATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTgaccgac > 2:194700/1‑149 (MQ=255) tttATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCACGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTgaccgac > 4:139323/1‑149 (MQ=255) gcgcTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCgg > 5:231114/1‑149 (MQ=255) gcTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGcc > 3:151504/1‑149 (MQ=255) ggTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCctg < 1:194700/147‑1 (MQ=255) ggACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTc < 6:358967/148‑1 (MQ=255) cGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAAc > 2:274103/1‑149 (MQ=255) gcagcaTTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGcgcagggcattgaccccgccaccgggcat < 4:167714‑M1/106‑30 (MQ=255) gcagcaTTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGcgcagggcattgaccccgccaccgggcat > 3:167714‑M1/1‑77 (MQ=255) agcaTTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCATTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCg > 4:55224/1‑149 (MQ=255) gcaTTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGc > 1:87252/1‑149 (MQ=255) gATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCTgg > 7:21734/1‑149 (MQ=255) gATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCg < 2:324654/148‑1 (MQ=255) gATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCACGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCg < 3:139323/148‑1 (MQ=255) gTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTg < 5:167993/83‑1 (MQ=255) gTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTg > 6:167993/1‑83 (MQ=255) gTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTAc < 6:231114/149‑1 (MQ=255) tGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCATTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTAcc < 3:55224/149‑1 (MQ=255) gCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCTGGGCTACCTGACCCTGGCCGGt < 8:21734/149‑1 (MQ=255) gCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGt < 7:73992/149‑1 (MQ=255) gCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGt > 2:355340/1‑149 (MQ=255) aGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGTGa < 2:40701/149‑1 (MQ=255) aTGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGTGACGCCGAg > 2:292374/1‑147 (MQ=255) gTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGTGACGCCGAGCAGGa < 2:293210/149‑1 (MQ=255) cTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGTGACGCCGAGCAGGACTACGCCGCCTa > 8:159942/1‑149 (MQ=255) ggCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGTGACGCCGAGCAGGACTACGCCGCCTACAt > 6:369601/1‑149 (MQ=255) aCGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGTGCCGCCGAGCAGGACTACGCCGCCTACATCGa > 4:193647/1‑148 (MQ=255) gTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGTGACGCCGAGCAGGACTACGCCGCCTACATCGAc > 3:334763/1‑147 (MQ=255) cGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGTGACGCCGAGCAGGACTACGCCGCCTACATCGACAAgc < 7:159942/149‑1 (MQ=255) cATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGcgggcatgccgacgttgccgagcaacagctggcccatggccgcactgcggataatctgcgcaccgatcgaatgctgcgtccaacctagcgcataaaggatcgtcatggtcttgcccgga < 4:273335‑M2/149‑120 (MQ=255) cATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGc > 2:22404/1‑105 (MQ=255) cATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGc < 1:22404/105‑1 (MQ=255) aTGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGcgggcatgccgacgttgccgagcaacagctggaccatggccgcactgcggataatctgcgcaccgatcgaatgctgc > 3:167714‑M2/1‑29 (MQ=255) aTGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGcgggcatgccgacgttgccgagcaacagctggaccatggccgcactgcggataatctgcgcaccgatcgaatgctgc < 4:167714‑M2/106‑78 (MQ=255) tGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGTGACGCCGAGCAGGACTACGCCGCCTACATCGACAAGCGCGCt < 1:274103/149‑1 (MQ=255) cccGcgcagggcattgaccccgccaccgggcatgccgacgttgccgagcaacagctggaccatggccgcactgcggataatctgcgcaccgatcgaatgctgcgtccaacctagcgcataaaggatcgtcatggtcttgcccggaa < 7:196319‑M1/146‑143 (MQ=255) cccGcgcagggcattgaccccgccaccgggcatgccgacgttgccgagcaacagctggaccatggccgcactgcggataatctgcgcaccgatcgaatgctgcgtccaacctagcgcataaaggatcgtcatggtcttgcccggaa > 8:196319‑M1/1‑4 (MQ=255) ccGcgcagggcattgaccccgccaccgggcatgccgacgttgccgagcaacagctggactatggccgcactgcgtataatctgcgcaccgatcgaatgctgcgtccaacctagcgcataaaggatcgtcatggtcttgcccggaaccga < 1:293210‑M1/149‑147 (MQ=255) | GGAAGAGATCGCCTCCTGCTCGGTTCCGGGCAAGACCATGACGATCCTTTATGCGCTAGGTTGGACGCAGCATTCGATCGGTGCGCAGATTATCCGCAGTGCGGCCATGGTCCAGCTGTTGCTCGGCAACGTCGGCATGCCCGGTGGCGGGGTCAATGCCCTGCGCGGGCACTCCAACATCCAGGGCCTGACCGACCTCGGCCTGCTGTCCAACTCGCTGCCGGGCTACCTGACCCTGGCCGGTGACGCCGAGCAGGACTACGCCGCCTACATCGACAAGCGCGCTTCC > NC_002947/576142‑576430 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |