| New junction evidence | |||||||||||
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gCTTGCCCGCTCCCACAGGTTTACCTCCAGACTTGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAG‑A‑AGCCG‑GC‑‑‑A‑CC‑‑GTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCgg < 5:322981/149‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCTCCCACAGGTTTACCTCCAGACTTGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAG‑A‑AGCCG‑GC‑‑‑A‑CC‑‑GTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGt < 5:246523/149‑1 (MQ=255) aataccgctctggatgccgcacacaaggtgctggacgaaattcgccggcgctttgccgaaattctctacccggcgcagccgcgggatttgcagtgcaccttcagtgccggggtggtgcaactggacgaggggctggatgcactgaccat > 3:216232‑M1/149‑149 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTTTACCTCCAGACTTGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAG‑A‑CGCCG‑GC‑‑‑A‑CC‑‑GTGAGTGCGAAGTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTa > 7:242764/1‑147 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTTTACCTCCAGACTTGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAG‑A‑AGCCG‑GC‑‑‑A‑CC‑‑GTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTa < 1:27462/147‑1 (MQ=255) accgcgctggatgccgcacacaaggtgctggacgaaattcgccggcgctttgccgaaattctctacccggcgcagccgcgggatttgcagtgcaccttcagtgccggggtggtgcaactggacgaggggctggatgcactgaccaTgg < 1:55666‑M1/3‑1 (MQ=255) accgcgctggatgccgcacacaaggtgctggacgaaattcgccggcgctttgccgaaattctctacccggcgcagccgcgggatttgcagtgcaccttcagtgccggggtggtgcaactggacgaggggctggatgcactgaccaTgg > 2:55666‑M1/146‑148 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTTTACCTCCAGACTTGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAG‑A‑AGCCG‑GC‑‑‑A‑CC‑‑GTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAgc < 4:184056/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTTTACCTCCAGACTTGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAG‑A‑AGCCG‑GC‑‑‑A‑CC‑‑GTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAgc < 4:138584/149‑1 (MQ=255) cgcgctggatgccgcacacaaggtgctggacgaaattcgccggcgctttgccgaaattctctacccggcgcagccgcgggatttgcagtgcaccttcagtgccggggtggtgcaactggacgaggggctggatgcactgaccaTGGc < 6:124198‑M1/4‑1 (MQ=255) 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ttGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAG‑A‑AGCCG‑GC‑‑‑A‑CC‑‑GTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCCTGGt > 4:60489/1‑149 (MQ=255) aGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAG‑A‑AGCCG‑GC‑‑‑A‑CC‑‑GTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCa < 2:271549/148‑1 (MQ=255) aGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAG‑A‑AGCCG‑GC‑‑‑A‑CC‑‑GTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAg < 8:128538/149‑1 (MQ=255) aGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAG‑A‑AGCCG‑GC‑‑‑A‑CC‑‑GTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAg > 7:16439/1‑149 (MQ=255) ggTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAG‑A‑AGCCG‑GC‑‑‑A‑CC‑‑GTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAg < 8:16439/148‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |