New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 655028 = | 61 (1.080) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 6.8% | coding (1315/1356 nt) | PP_0563 | two‑component system response regulator |
? | NC_002947 | 655064 = | 51 (0.940) | coding (1279/1356 nt) | PP_0563 | two‑component system response regulator |
ACTTGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCGGCATCCAGCGCGGTATT > NC_002947/654917‑655211 | aCTTGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATg < 2:80329/149‑1 (MQ=255) ttGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCGAGCACCGTGAGTGCGATTTTCAGGGGTGTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCTTGCTTGGCCCGTTACAGCGCATCGTCCGCTGCACTGGCCATgg > 1:271549/1‑149 (MQ=255) ttGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCCTGGt > 4:60489/1‑149 (MQ=255) attcgccggcgctttgccgaaattctctacccggcgcagccgcgggatttgcagtgcaccttcagtgccggggtggtgcaactggacgaggggctggatgcactgaccaTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCAt > 8:186406‑M1/110‑146 (MQ=255) attcgccggcgctttgccgaaattctctacccggcgcagccgcgggatttgcagtgcaccttcagtgccggggtggtgcaactggacgaggggctggatgcactgaccaTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCAt < 7:186406‑M1/37‑1 (MQ=255) aGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCa < 2:271549/148‑1 (MQ=255) aGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAg < 8:128538/149‑1 (MQ=255) aGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAg > 7:16439/1‑149 (MQ=255) ggTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAg < 8:16439/148‑1 (MQ=255) cgccggcgctttgccgaaattctctacccggcgcagccgcgggatttgcagtgcaccttcagtgccggggtggtgcaactggacgaggggctggatgcactgaccaTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCa > 2:86483‑M1/107‑148 (MQ=255) gAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATc > 8:272331/1‑147 (MQ=255) aTGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCAATGGCCATGGTCAGTGCATCCAGcc > 4:246697/1‑149 (MQ=255) tGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCg > 5:248702/1‑149 (MQ=255) ggAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTcc < 4:317443/149‑1 (MQ=255) gCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCa < 7:89066/125‑1 (MQ=255) gCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCa < 7:84092/125‑1 (MQ=255) gCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCa > 8:89066/1‑125 (MQ=255) gCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCa > 8:84092/1‑125 (MQ=255) gggCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTg > 5:141554/1‑148 (MQ=255) ggCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGca < 6:248702/149‑1 (MQ=255) gCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCaccacc > 3:226411/1‑149 (MQ=255) gCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAg < 6:328415/149‑1 (MQ=255) cG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGt < 3:328733/149‑1 (MQ=255) gCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTg > 8:52315/1‑148 (MQ=255) aGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCAATGCAAATCACGCGGCTgc > 2:58020/1‑149 (MQ=255) acacGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCggg > 6:240523/1‑147 (MQ=255) acacGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTCCGCCggg > 2:358246/1‑147 (MQ=255) acgacgCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTaga < 8:4395/145‑1 (MQ=255) acgacgCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTaga > 7:4395/1‑145 (MQ=255) acgacgCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAAt > 8:15199/1‑149 (MQ=255) cgacgCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGt > 4:29688/1‑68 (MQ=255) gacgCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAAttt > 8:45667/1‑149 (MQ=255) acgCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTc > 8:192179/1‑149 (MQ=255) cgCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCATTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCg < 3:246697/149‑1 (MQ=255) cgCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCg < 7:15199/149‑1 (MQ=255) aaTTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGc > 5:304344/1‑148 (MQ=255) cccTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGcc < 5:240523/149‑1 (MQ=255) cccTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGcc < 7:45667/149‑1 (MQ=255) ccTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCg < 7:272331/149‑1 (MQ=255) ccTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCg > 7:7505/1‑149 (MQ=255) tgaccatggccagtgcagcggacgaggcgctgtaccgggccaTGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCg > 2:86483‑M2/43‑148 (MQ=255) cATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCg > 8:127983/1‑148 (MQ=255) aTGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCTCCCCGGCACTGAAGGTGCTCTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGc > 1:297176/1‑146 (MQ=255) aTGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCTCCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGc < 2:297176/146‑1 (MQ=255) aTGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGaa < 1:291763/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAAttt > 5:25286/1‑149 (MQ=255) atggccagtgcagcggacgaggcgctgtaccgggccaTGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAAt < 7:186406‑M2/109‑1 (MQ=255) atggccagtgcagcggacgaggcgctgtaccgggccaTGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAAt > 8:186406‑M2/38‑146 (MQ=255) GGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGGGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTc > 1:58020‑M1/1‑147 (MQ=255) GCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGt > 6:141554‑M1/1‑148 (MQ=255) aGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCTCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCtt < 7:52315/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCtt < 7:192179/149‑1 (MQ=255) cgcCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGc < 4:117477/117‑1 (MQ=255) cgcCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGc > 3:117477/1‑117 (MQ=255) ccTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTtgtgt < 4:226411/149‑1 (MQ=255) gTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCg < 6:304344/148‑1 (MQ=255) tCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCgg > 6:155668/1‑148 (MQ=255) tggatGCACTGACCATGGCCAGTGCAGCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCGGCa > 1:329651/5‑149 (MQ=255) cgctgtaccgggccaTGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCGGCa < 1:86483‑M2/134‑1 (MQ=255) cGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGGACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAAGTTCGGCAAAGCGCCGGCGGATTTCGTCCCGCACCTGGTGTGCGGcgt > 4:108000/1‑147 (MQ=255) cGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCGGCAt > 5:124198/1‑149 (MQ=255) tGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCg < 2:155793/103‑1 (MQ=255) tGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCg > 1:155793/1‑103 (MQ=255) cACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCGGCATCCa < 6:25286/147‑1 (MQ=255) tGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCg > 6:295239/1‑47 (MQ=255) tGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCg < 5:295239/47‑1 (MQ=255) gccaTGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCGGCATCCAGcgcg < 6:124198‑M2/143‑1 (MQ=255) ccaTGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCGGCATCCAGCGCGGt < 1:55666‑M2/145‑1 (MQ=255) ccaTGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCGGCATCCAGCGCGGt > 2:55666‑M2/4‑148 (MQ=255) aTGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCGGCATCCAGAGCGGTAtt > 3:216232‑M2/2‑149 (MQ=255) | ACTTGAGGTATGTGAAATGCCTGGGGAAGCGGGCGAGCCTGTGAAGAAGCCG‑GCACCGTGAGTGCGAATTTCAGGGCTCTACACGAACGACGCAATTGCGCCCTGCATGCTTGGCCCGGTACAGCGCCTCGTCCGCTGCACTGGCCATGGTCAGTGCATCCAGCCCCTCGTCCAGTTGCACCACCCCGGCACTGAAGGTGCACTGCAAATCCCGCGGCTGCGCCGGGTAGAGAATTTCGGCAAAGCGCCGGCGAATTTCGTCCAGCACCTTGTGTGCGGCATCCAGCGCGGTATT > NC_002947/654917‑655211 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |