| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1591794 | 60 (1.060) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 6.5% | coding (100/921 nt) | PP_1395 | AraC family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 1591834 | 58 (1.080) | coding (60/921 nt) | PP_1395 | AraC family transcriptional regulator | |||||
TGCAGTGGGTCGTAGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGA > NC_002947/1591649‑1591939 | tGCAGTGGGTCGTAGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGc < 8:343834/149‑1 (MQ=255) cAGTGGGTCGTAGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCAGATGCTg > 1:299246/1‑149 (MQ=255) gTGGGTCGTAGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTATAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGa < 6:223857/149‑1 (MQ=255) gTAGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAg < 5:113677/148‑1 (MQ=255) tACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGAgctgatcaaccgccatgcggg > 6:46484‑M1/1‑128 (MQ=255) tCGTCACCCAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCACCCGCATg > 5:370902/1‑149 (MQ=255) gTCACCCAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGc < 1:40937/149‑1 (MQ=255) tCACCCACGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCATGCTGCGCCATGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATAGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGc < 1:53127/149‑1 (MQ=255) cccAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACAATTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑CCTCGCCCGCATGGCGGtt > 5:24993/1‑149 (MQ=255) ccAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTg < 6:302616/120‑1 (MQ=255) ccAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTg > 5:302616/1‑120 (MQ=255) aGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGAt < 7:102559/149‑1 (MQ=255) gttagaGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTATCGCACCAGGTACTGGTCATCGAT‑TGCCGATGCTGGACCaaa < 2:262711/119‑1 (MQ=255) ggAACAGGCTTTTGCTGACCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGAACaaa > 1:262711/1‑124 (MQ=255) aCAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGTGCAGGCGGCGCCAGTGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAg < 6:24993/148‑1 (MQ=255) cTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggc < 7:175070‑M2/149‑6 (MQ=255) ttGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGAgctgatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtccagcatcggcca < 5:213115‑M1/148‑48 (MQ=255) ctgcCCTGTGCATCCTTGCCCAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTc > 7:185082/1‑149 (MQ=255) ctgcCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGAgctgatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtccagcatcggccatcga < 2:15201‑M1/149‑52 (MQ=255) ctgcCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTc > 3:131674/1‑149 (MQ=255) tgcCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGAgctgatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtccagcatcggccatcgat < 5:46484‑M1/149‑53 (MQ=255) cTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGgc > 8:46198/1‑149 (MQ=255) cTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGgc < 2:337588/149‑1 (MQ=255) gggCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGgcgc > 1:345846/1‑149 (MQ=255) aaGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCACCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCa < 6:370902/149‑1 (MQ=255) ggATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACAAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGt > 7:274069/1‑149 (MQ=255) gATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGCGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGtt > 1:22656/1‑149 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGTTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAg < 8:190649/149‑1 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAg < 6:184258/149‑1 (MQ=255) acaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAgg < 8:175070/149‑1 (MQ=255) aaaGGCCAGGCTGCGCCAGGCTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAACG‑GCTCTCCCGCATGGCCGGTGATCAGCACGGCCAGCTACAGGCGCTGCAGTTCCAgt > 8:141944/3‑148 (MQ=255) gggCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtc < 2:345846/149‑1 (MQ=255) gggCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtc > 1:265921/1‑149 (MQ=255) ggCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcg > 4:90650/1‑149 (MQ=255) ggCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGTTTGATAAGATCGGCCAGATCAAGGCGCTGCAGTTCAAGGGtcggttc > 7:145877/1‑149 (MQ=255) ggCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttc < 2:22656/149‑1 (MQ=255) gCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcg > 2:36517/1‑149 (MQ=255) cTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcgg > 2:117256/1‑149 (MQ=255) tGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcggt > 2:340167/1‑149 (MQ=255) gggtgggtACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTg > 8:100153/1‑149 (MQ=255) tgggtACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCg < 1:36517/149‑1 (MQ=255) tACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGATCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCggtgg > 3:38749/1‑149 (MQ=255) aGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCa > 6:205387/1‑149 (MQ=255) gAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCat < 8:185082/149‑1 (MQ=255) tACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATgg > 5:342192/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGGCGTGGCGGTGGTCAGGATGGCTTTcc > 4:42104/1‑149 (MQ=255) tCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGTACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCct > 6:127553/1‑149 (MQ=255) aCGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGGAGCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGCCGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTctgctgc > 1:74666/1‑148 (MQ=255) aCGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAc > 1:65765/1‑149 (MQ=255) aCGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAc < 1:340167/149‑1 (MQ=255) gCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAcc > 6:329114/1‑148 (MQ=255) gCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTCGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAcc > 1:62841/1‑148 (MQ=255) cACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGa < 2:74666/149‑1 (MQ=255) aCCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGAc > 8:265125/1‑149 (MQ=255) ccAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcggt > 3:112101/1‑106 (MQ=255) ccAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcggt < 4:112101/106‑1 (MQ=255) cAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATc > 4:62857/1‑61 (MQ=255) tACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTGCGGTGGACGTGGCGTGGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAACGACgcagca > 8:233930/1‑149 (MQ=255) aGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAg < 2:265921/149‑1 (MQ=255) gTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGc < 8:24846/120‑1 (MQ=255) gTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGc > 7:24846/1‑120 (MQ=255) tcctCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGT‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCAAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGTTGGACGTGGCGGTTGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGt < 2:299246/145‑1 (MQ=255) tCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGtt < 7:100153/149‑1 (MQ=255) aTCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggca < 5:46484‑M2/149‑98 (MQ=255) aTCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGttt < 2:65765/148‑1 (MQ=255) aTCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTg > 5:107505/1‑149 (MQ=255) tCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggcag < 2:15201‑M2/149‑99 (MQ=255) gAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTggg < 4:38749/148‑1 (MQ=255) aT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTcc > 6:269140/1‑75 (MQ=255) aT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTcc < 5:269140/75‑1 (MQ=255) aT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCa < 4:131674/149‑1 (MQ=255) t‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggcagcaa < 5:213115‑M2/148‑102 (MQ=255) gCCGAgctgatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtccagcatcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggcagcaaaag < 7:175070‑M1/149‑145 (MQ=255) gCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCaaa < 5:205387/148‑1 (MQ=255) ccGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGa < 1:117256/149‑1 (MQ=255) cGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACg > 2:190606/1‑127 (MQ=255) cGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACg < 1:190606/127‑1 (MQ=255) | TGCAGTGGGTCGTAGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGAT‑GGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGA > NC_002947/1591649‑1591939 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |