New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1591794 | 60 (1.060) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 6.5% | coding (100/921 nt) | PP_1395 | AraC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 1591834 | 58 (1.080) | coding (60/921 nt) | PP_1395 | AraC family transcriptional regulator |
CTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGC > NC_002947/1591691‑1591981 | cTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggc < 7:175070‑M2/149‑6 (MQ=255) ctgcCCTGTGCATCCTTGCCCAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTc > 7:185082/1‑149 (MQ=255) ctgcCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTc > 3:131674/1‑149 (MQ=255) cTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGgc > 8:46198/1‑149 (MQ=255) cTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGgc < 2:337588/149‑1 (MQ=255) gggCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGgcgc > 1:345846/1‑149 (MQ=255) aaGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCACCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCa < 6:370902/149‑1 (MQ=255) ggATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACAAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGt > 7:274069/1‑149 (MQ=255) gATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGCGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGtt > 1:22656/1‑149 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGTTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAg < 8:190649/149‑1 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAg < 6:184258/149‑1 (MQ=255) acaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAgg < 8:175070/149‑1 (MQ=255) aaaGGCCAGGCTGCGCCAGGCTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAACG‑GCTCTCCCGCATGGCCGGTGATCAGCACGGCCAGCTACAGGCGCTGCAGTTCCAgt > 8:141944/3‑148 (MQ=255) gggCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtc > 1:265921/1‑149 (MQ=255) gggCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtc < 2:345846/149‑1 (MQ=255) ggCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcg > 4:90650/1‑149 (MQ=255) ggCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGTTTGATAAGATCGGCCAGATCAAGGCGCTGCAGTTCAAGGGtcggttc > 7:145877/1‑149 (MQ=255) ggCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttc < 2:22656/149‑1 (MQ=255) gCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcg > 2:36517/1‑149 (MQ=255) cTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcgg > 2:117256/1‑149 (MQ=255) tGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcggt > 2:340167/1‑149 (MQ=255) gggtgggtACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTg > 8:100153/1‑149 (MQ=255) tgggtACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCg < 1:36517/149‑1 (MQ=255) tACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGATCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCggtgg > 3:38749/1‑149 (MQ=255) aGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCa > 6:205387/1‑149 (MQ=255) gAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCat < 8:185082/149‑1 (MQ=255) tACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATgg > 5:342192/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGGCGTGGCGGTGGTCAGGATGGCTTTcc > 4:42104/1‑149 (MQ=255) tCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGTACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCct > 6:127553/1‑149 (MQ=255) aCGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGAGCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGCCGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTctgctgc > 1:74666/1‑148 (MQ=255) aCGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAc > 1:65765/1‑149 (MQ=255) aCGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAc < 1:340167/149‑1 (MQ=255) gCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAcc > 6:329114/1‑148 (MQ=255) gCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTCGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAcc > 1:62841/1‑148 (MQ=255) cACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGa < 2:74666/149‑1 (MQ=255) aCCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGAc > 8:265125/1‑149 (MQ=255) ccAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcggt < 4:112101/106‑1 (MQ=255) ccAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcggt > 3:112101/1‑106 (MQ=255) tACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTGCGGTGGACGTGGCGTGGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAACGACgcagca > 8:233930/1‑149 (MQ=255) aGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAg < 2:265921/149‑1 (MQ=255) gTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGc > 7:24846/1‑120 (MQ=255) gTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGc < 8:24846/120‑1 (MQ=255) tcctCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGT‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCAAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGTTGGACGTGGCGGTTGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGt < 2:299246/145‑1 (MQ=255) tCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGtt < 7:100153/149‑1 (MQ=255) aTCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggca < 5:46484‑M2/149‑98 (MQ=255) aTCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGttt < 2:65765/148‑1 (MQ=255) aTCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTg > 5:107505/1‑149 (MQ=255) tCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggcag < 2:15201‑M2/149‑99 (MQ=255) gATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTggg < 4:38749/148‑1 (MQ=255) aTGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTcc > 6:269140/1‑75 (MQ=255) aTGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTcc < 5:269140/75‑1 (MQ=255) aTGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCa < 4:131674/149‑1 (MQ=255) tGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggcagcaa < 5:213115‑M2/148‑102 (MQ=255) gCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCaaa < 5:205387/148‑1 (MQ=255) ccGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGa < 1:117256/149‑1 (MQ=255) cGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACg < 1:190606/127‑1 (MQ=255) cGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACg > 2:190606/1‑127 (MQ=255) tGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTACAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACAGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGAAGGgcg > 8:298643/1‑148 (MQ=255) ggACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGc > 1:119506/1‑57 (MQ=255) ggACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGc < 2:119506/57‑1 (MQ=255) ccAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTGCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGt < 2:62841/149‑1 (MQ=255) cTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGGGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCt < 7:46198/149‑1 (MQ=255) cccGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggcagcaaaagcctgttcctgggtgacgagcagta > 6:46484‑M2/1‑21 (MQ=255) gCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTg > 2:54682/1‑149 (MQ=255) agctgCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTTCAGTTCCAGGGTCGGTGCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGGTGACCGACGCAGCATAGGTGTGGGCATCGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATc < 7:141944/145‑1 (MQ=255) aTCAGCTGGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCGAGTGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTGTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATc < 8:274069/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGc > 6:13535/1‑149 (MQ=255) | CTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGG‑GCTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGC > NC_002947/1591691‑1591981 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |