| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2295773 | 102 (1.800) | 8 (0.150) | 5/250 | NT | 7.3% | intergenic (+19/+114) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
| ? | NC_002947 | = 2295860 | 104 (1.910) | intergenic (+106/+27) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GGTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAA > NC_002947/2295628‑2295920 | ggTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCtt < 7:329613/148‑1 (MQ=255) tCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTtgt‑g < 6:147772/149‑1 (MQ=255) tCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTtgt‑g < 1:175786/149‑1 (MQ=255) tCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTtgt‑g < 5:216899/149‑1 (MQ=255) gTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGCGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑gg > 5:123784/1‑148 (MQ=255) gTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGTC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑gg < 4:72369/148‑1 (MQ=255) aCTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑gg < 8:214857/146‑1 (MQ=255) cTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGc > 3:284388/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCggg > 1:82180/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCgg < 2:186416/148‑1 (MQ=255) ccAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCgg < 7:161922/148‑1 (MQ=255) ccAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCgg < 7:166596/148‑1 (MQ=255) caaGCGCATGCCCATGCCTACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCgg < 7:337727/146‑1 (MQ=255) cAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCggg > 3:88382/1‑148 (MQ=255) catgcccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCg > 1:351148/1‑141 (MQ=255) gcccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCgtgtgggagcgggcatgcccgc > 8:276729‑M1/1‑127 (MQ=255) gcccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATg < 6:258932/144‑1 (MQ=255) gcccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGcagat > 5:258932/1‑145 (MQ=255) cccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGCGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGCGCGGGCATGCCcgc > 4:277301/1‑148 (MQ=255) ccattccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTtgt < 2:3170/129‑1 (MQ=255) ccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTtgt‑g < 2:64033/130‑1 (MQ=255) ccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTtgt > 1:3170/1‑129 (MQ=255) ccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGTGCGGGCATGCCcgc < 2:167567/147‑1 (MQ=255) ccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGTGCGGGCATGCCcgc > 1:162048/1‑147 (MQ=255) ccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGTGCGGGCATGCCcgc < 2:162048/147‑1 (MQ=255) ccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGTGCGGGCATGCCcgc > 1:167567/1‑147 (MQ=255) ccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCcgcg > 3:271027/1‑148 (MQ=255) ccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGa < 6:123784/149‑1 (MQ=255) ccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAacac < 8:2598/148‑1 (MQ=255) gcagcaAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCaga < 7:267293/149‑1 (MQ=255) agcaAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGc < 7:326566/149‑1 (MQ=255) gcaAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGcc > 5:1688/1‑149 (MQ=255) caAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCCAGCAGTACCTGCGCCAGACCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCCCTGATCTGGCTTGTGTTAGGTCCttgtgggagcgggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggt < 8:224559‑M1/149‑40 (MQ=255) ggCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTg < 4:289542/149‑1 (MQ=255) ggCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGGCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTg < 4:51139/149‑1 (MQ=255) gCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCTCTGCCGGTgt < 5:55311/149‑2 (MQ=255) cTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGc > 6:60675/1‑148 (MQ=255) tCTGCCACCCCCAGCTACACCGAGCAGAACCTGCGCCCGAGCGCCAATATCCATGCGGCCCTGAGTGGCTAGAACCCCCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGc < 1:294336/149‑1 (MQ=37) cTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCa < 6:24959/147‑1 (MQ=255) cTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCa < 2:82180/147‑1 (MQ=255) ccacAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGCCTTGTGTGAGCTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTTCCAT‑CCAAcgcc > 4:44733/1‑148 (MQ=255) caGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTg < 4:284388/149‑1 (MQ=255) caGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTg > 3:68436/1‑149 (MQ=255) aGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGc > 1:8194/1‑149 (MQ=255) acacCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGc > 4:103738/1‑149 (MQ=255) acacCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGc > 6:371726/1‑149 (MQ=255) acCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAaca < 8:301410/112‑1 (MQ=255) acCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCtt < 7:139879/149‑1 (MQ=255) cGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTcg > 6:169452/1‑149 (MQ=255) aGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTcgcg > 2:346394/1‑149 (MQ=255) gCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCttgtgggagcgggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgg < 4:88382‑M1/149‑70 (MQ=255) gCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg < 1:241604/149‑1 (MQ=255) cAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCgtgtgggagcgggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcggg < 7:276729‑M1/149‑71 (MQ=255) aGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCggg < 4:271027/148‑1 (MQ=255) ccTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCCCTTCGCGGGCCTGc > 3:171865/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGAGCTGGCTTGTGTGAGGGCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGc < 4:54613/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCggg < 7:190900/141‑1 (MQ=255) cAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTcc > 3:324093/1‑149 (MQ=255) cagcCCCATTTACCATGCGGCCGTGAGGGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCGgtgggggagcgggcttccccgctaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctccca < 4:193633‑M1/148‑85 (MQ=255) gcgcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg > 7:62493/1‑132 (MQ=255) cgcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCCGGCATGCCCGCTCCCacac > 8:311824/1‑149 (MQ=255) cgcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCAGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCacac < 6:1688/149‑1 (MQ=255) gcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCgtgtgggagcgggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggc > 3:348387‑M1/1‑61 (MQ=255) gcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCATCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCCg > 8:104212/1‑149 (MQ=255) cAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACgga < 1:60434‑M2/149‑4 (MQ=255) cATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCa > 2:179705/1‑97 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgtg > 7:45935/1‑149 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgtg < 5:169452/149‑1 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgtg > 2:107563/1‑149 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTCGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGTTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTGCCAAACggaccaaagtg < 3:98246‑M2/149‑12 (MQ=255) tgggcc‑‑‑AAGCACCCCCCCTGTTGTGGCTGGTGTTGGGCCCTTGG‑GGGTGGGGGCTTCCCCGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAC‑CCCCCGCGGGGCCCGCTGCGGGGGAAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAt < 4:171865/142‑1 (MQ=255) gTGGC‑‑‑AAGCACCACCCCTGTGCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATCCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGtt < 3:44733/149‑1 (MQ=255) tGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCgtgtgggagcgggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctcggccggtgttcgcggggctgcccgctcccacaaggcccgcacccaagccagatcagt > 1:279909‑M1/1‑38 (MQ=255) gC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGc < 3:345026/107‑1 (MQ=255) c‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTaa > 8:34088/1‑148 (MQ=255) c‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCCCATCGCGGGCCTGCCCCCGCCCCCCCCGCCCCAAGTGCCCCCCGATGtttta > 4:33194/1‑146 (MQ=25) aaGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAAt > 8:259941/1‑148 (MQ=255) caccaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCGTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCGGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGc < 7:104212/149‑1 (MQ=255) ccaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCg > 1:58826/1‑149 (MQ=255) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGa > 6:83252/1‑149 (MQ=255) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACCGACCCAAGTGCAGCCCGATGTTTTATCAGCGGa > 3:51516/1‑149 (MQ=255) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCATTCT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCCGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCCCCGGGATGCCCGCACGCACACGGACCCATCTGCAGACCCAAGGTTAATAAGCCGa > 1:323050/1‑149 (MQ=25) cacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg < 1:330737/94‑1 (MQ=255) cacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg > 2:330737/1‑94 (MQ=255) acTGATCTGGCTTGGGTGCGGGCCTTGT‑GGGAGCGGGCAGCCCCGCGAACACCGGCCGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgcca > 1:279909‑M2/1‑111 (MQ=255) tGGCTTGTGGGAGTTCCTTGT‑GGGAGGGGGCATGCCGGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCTCGCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGcc < 7:311824/149‑1 (MQ=38) gggttGTGTGCGGTCTTTGG‑GGGCGGGGGCATGCCCGCTAACACGGGCTTCGCGGGTGCCAT‑CCACGGCGGTGCCCGCTTCGGGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGcc < 2:284221/145‑1 (MQ=255) gCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGcc < 7:259941/147‑1 (MQ=255) gCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGc < 1:14336/146‑1 (MQ=255) gCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGc < 2:60434/146‑1 (MQ=255) gCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCtt < 7:272646/149‑1 (MQ=255) ttGTGTGAGGTCCttgtgggagcgggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgg > 7:45234‑M1/1‑13 (MQ=255) gtgtgtGGTCCTTGT‑GGTAGCGGTCTTGCCCGTTTACACGGGCAGAGCCGGTGCATT‑CGACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCTTGGCCGCTCCGACACGGACCCATGTGGAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGaa < 4:98246/148‑1 (MQ=255) gtgtgAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGaa < 2:8194/148‑1 (MQ=255) gtgAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATGCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAGGTTTAATAAGCGGACCATGATTGCCTGGAACa > 1:280550/1‑149 (MQ=37) tgAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGGATGGCCGCGCCCCCCCGGCCCCATGTGGAGCCCGATGTTTAATGAGCGGGCCATGATTGCCTTGAACAGc > 3:196514/1‑149 (MQ=37) tgAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCGCCCCCACGGGCCCATGTGGCGCCCGAGGTTTTATGAACGGACCATGCTTGCCTTGGACAGc > 3:151171/1‑149 (MQ=25) gTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTcc > 2:102457/1‑148 (MQ=255) tCCgtgtgggagcgggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccactcagggccgcatggaaattg < 1:60434‑M1/149‑147 (MQ=255) ccTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGaa < 5:83252/149‑1 (MQ=255) | GGTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGC‑‑‑AAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAA > NC_002947/2295628‑2295920 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |