| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2295773 | 102 (1.800) | 8 (0.150) | 5/250 | NT | 7.3% | intergenic (+19/+114) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
| ? | NC_002947 | = 2295860 | 104 (1.910) | intergenic (+106/+27) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC > NC_002947/2295712‑2296004 | cgcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCCGGCATGCCCGCTCCCacac > 8:311824/1‑149 (MQ=255)cgcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCAGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCacac < 6:1688/149‑1 (MQ=255)cgcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGAGCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCacac < 3:277301/149‑1 (MQ=255) gcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCATCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCCg > 8:104212/1‑149 (MQ=255) cAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACgga < 1:60434‑M2/149‑4 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgtg < 5:169452/149‑1 (MQ=255) tgggccAAGCACCCCCCCTGTTGTGGCTGGTGTTGGGCCCTTGG‑GGGTGGGGGCTTCCCCGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAC‑CCCCCGCGGGGCCCGCTGCGGGGGAAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGAt < 4:171865/142‑1 (MQ=255) gTGGCAAGCACCACCCCTGTGCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATCCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGtt < 3:44733/149‑1 (MQ=255) tGGAAAGCACCACCACTGATGTGGTTTTTGTTTGGTCTTTGG‑GGGTGGGGGCAGGCCCGGTAACACCGGAAGAGCGGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCGGCTTGGGGGGAATGCCGGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGtt < 6:16322/148‑1 (MQ=255) gCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTaa < 4:68436/149‑1 (MQ=255) cAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCCGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTaa > 8:34088/1‑148 (MQ=255) cAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCCCATCGCGGGCCTGCCCCCGCCCCCCCCGCCCCAAGTGCC‑CCCCGATGtttta > 4:33194/1‑146 (MQ=25) caccaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCGTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCGGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGc < 7:104212/149‑1 (MQ=255) ccaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCg > 1:58826/1‑149 (MQ=255) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCCGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGa > 1:284221/1‑149 (MQ=255) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGa > 6:83252/1‑149 (MQ=255) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGa > 6:365954/1‑149 (MQ=255) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACCGACCCAAGTGCA‑GCCCGATGTTTTATCAGCGGa > 3:51516/1‑149 (MQ=255) 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ggAGCGGGCTTGCCGGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagccagcc < 3:33194/149‑1 (MQ=255) ggggCATGCCGGCGAAAACGGGCAGTTCGTGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGTTTGGGGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGGTCCGAAGCCAGCCAccc < 5:192923/148‑1 (MQ=255) ggCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCt < 8:45935/149‑1 (MQ=255) gCATGCCGGCGAACACCGGCTGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTc < 2:280550/149‑1 (MQ=255) gCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAgccagcca < 1:333595/143‑1 (MQ=255) 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cccGCTGCGGGGCCAGGCCCGCCCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTg < 5:60675/149‑1 (MQ=255) acGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGATCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGc > 1:18134/2‑149 (MQ=255) gCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTg > 3:166756/1‑146 (MQ=255) gCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTg < 4:166756/146‑1 (MQ=255) cgcgGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTc < 1:102457/148‑1 (MQ=255) cgcgGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTc > 4:109850/1‑148 (MQ=255) cgcgGGAATGCCCGCTCCCACACGTACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTc < 7:101841/148‑1 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACACggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccactcagggccgcatggaaattggcgctctggcgcaggtactgctcggtgtagctgtgggtggcagaagccttgctgctgtcggcatgggc > 8:276729‑M2/1‑22 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCg > 3:242072/1‑130 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGa > 3:111264/1‑149 (MQ=255) gggCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAcc > 7:331201/1‑149 (MQ=255) gggCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAcc > 7:335957/1‑149 (MQ=255) gggCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAcc > 4:200087/1‑149 (MQ=255) gCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAcccc < 4:196514/149‑1 (MQ=255) aTGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCgg > 3:193731/1‑149 (MQ=255) gCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGc > 7:139202/1‑148 (MQ=255) cccGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCa < 4:35335/148‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCa > 4:208477/1‑148 (MQ=255) ccGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGc < 4:111420/146‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGc > 3:111420/1‑146 (MQ=255) ccGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCaaa > 7:179718/1‑149 (MQ=255) cTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTg < 7:192077/149‑1 (MQ=255) ccACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGTCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCTGGCAAACTGgc < 1:98050/149‑1 (MQ=255) ccACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGgcg > 4:140353/1‑149 (MQ=255) cacaCGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGgcgc < 3:200087/149‑1 (MQ=255) | CGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGT‑GGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCAT‑CCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCA‑GCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCG‑CACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC > NC_002947/2295712‑2296004 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |