| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3572273 = | 55 (0.970) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.2% | coding (309/444 nt) | PP_3153 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 3572311 = | 39 (0.730) | coding (347/444 nt) | PP_3153 | hypothetical protein | |||||
GGCCAGGACGAGGCCAATGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAGGCGCCCACGACCGTTAACCTTAACTGGCGTTGATGAAA > NC_002947/3572127‑3572413 | ggCCAGGACGAGGCCAATGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGc < 4:151801/149‑1 (MQ=255) gCCAGGACGAGGCCAATGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGcc > 2:118468/1‑149 (MQ=255) gCCACGACGAGGCCAATGCCCTGCGCAAGACAACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGcc > 4:199021/1‑149 (MQ=255) ggCCAATGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCgctgc < 6:1624/149‑1 (MQ=255) cAATGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGt < 1:133441/149‑1 (MQ=255) cAATGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGt > 7:227260/1‑149 (MQ=255) aaTGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCgctgct < 8:256143/146‑1 (MQ=255) aaTGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCgctgct < 8:251218/146‑1 (MQ=255) aaTGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCgctgct > 7:256143/1‑146 (MQ=255) aaTGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCgctgct > 7:251218/1‑146 (MQ=255) tGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCgctgct < 8:242243/144‑1 (MQ=255) tGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCgctgct > 7:242243/1‑144 (MQ=255) tGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTAtg < 8:3421/149‑1 (MQ=255) cTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCCGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGc > 7:314619/1‑148 (MQ=255) gcgcAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCg > 8:232510/1‑133 (MQ=255) gcgcAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCg < 7:232510/133‑1 (MQ=255) cGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGc < 3:328247/149‑1 (MQ=255) cccgacttttcatcaacgccagttaaggttaacggtcgtgggcgccttgcccgtgacggtcgcccactgctgcactgcctggccttgggcattgccaatgaccttgtattTGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGc > 2:306495‑M1/111‑147 (MQ=255) ttATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGCCCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCaaa > 7:259123/1‑148 (MQ=255) gACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCaaa < 1:75613/144‑1 (MQ=255) gACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCaaa > 2:75613/1‑144 (MQ=255) aCCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑AAGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAg < 5:338964/149‑1 (MQ=255) ccTGCACGTAGAGCTTTCGACCTGCCCTGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCTTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGTAATTGCCTCCCGGCAAATACAAg < 3:199021/148‑1 (MQ=255) ccTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAgg > 5:12308/1‑149 (MQ=255) ccTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAgg > 7:111943/1‑149 (MQ=255) cTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGt > 5:92230/1‑149 (MQ=255) agagCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAAt < 4:293580/119‑1 (MQ=255) agagCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAAt > 3:293580/1‑119 (MQ=255) agagCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACaa > 5:286360/1‑138 (MQ=255) agagCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACaa < 6:286360/138‑1 (MQ=255) agCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAAt < 6:12308/149‑1 (MQ=255) agCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAAt < 8:111943/149‑1 (MQ=255) cTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTgg > 8:253143/1‑143 (MQ=255) cTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTgg < 7:253143/143‑1 (MQ=255) cTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGc < 1:118468/149‑1 (MQ=255) cTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGc > 8:31320/1‑149 (MQ=255) cGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGt > 4:152159/1‑133 (MQ=255) cGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGt < 3:152159/133‑1 (MQ=255) gACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCaa < 5:333189/148‑1 (MQ=255) gACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAg < 7:31320/149‑1 (MQ=255) aCCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAgg < 5:125429/149‑1 (MQ=255) ttaacggtcgtgggcgccttgcccgtgacggtcgcccactgctgcactgcctggccttgggcattgccaatgaccttgtattTGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAg < 6:78219‑M1/46‑1 (MQ=255) ttaacggtcgtgggcgccttgcccgtgacggtcgcccactgctgcactgcctggccttgggcattgccaatgaccttgtattTGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAg > 5:78219‑M1/83‑128 (MQ=255) gCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGAGATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTc > 1:256909/1‑129 (MQ=255) gCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTc < 2:256909/128‑1 (MQ=255) aaGTTCCAGAGCGGGGCTACAGTCCATATCCAGA‑ATGCCAAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCCGCGATGCCCGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCCGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGACAGGCAGTgaagca > 7:142848/1‑149 (MQ=255) ccAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTgg < 8:227260/148‑1 (MQ=255) cAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGc > 3:247246/1‑149 (MQ=255) ggCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCa > 8:106569/1‑149 (MQ=255) cGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGc > 4:76228/1‑148 (MQ=255) tCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAGGCGcc < 3:76228/148‑1 (MQ=255) aGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAGGCGCCCAc > 5:171185/1‑148 (MQ=255) a‑aTGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAGGCGCCCACGAc > 2:38957/1‑149 (MQ=255) tGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGAATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAGGCGCCCACGACCg < 7:106569/149‑1 (MQ=255) aGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAg > 4:58369/1‑131 (MQ=255) aGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAg < 3:58369/131‑1 (MQ=255) aGCCCGTACTCCGTGGCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAGGCGCCCACGACCGTTAACCTTAAc < 4:37196/149‑1 (MQ=255) gCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAGGCGCCCACGACCGTTAACCTTAACt > 8:139093/1‑149 (MQ=255) aGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAGGCGCCCACGACCGTTAACCTTAACTGGCGTtgat < 6:171185/148‑1 (MQ=255) aGTGGCAGCGATTCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTTCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAGGCGCCCACGACCGTTAACCTTAACTGGCGTtga < 8:259123/147‑1 (MQ=255) tCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAGGCGCCCACGACCGTTAACCTTAACTGGCGTTGATGaaa < 6:92230/148‑1 (MQ=255) | GGCCAGGACGAGGCCAATGCCCTGCGCAAGACCACGGGTTATGACCTGCACGTAGAGCTTTCGACCGGCCCGGAAGGCAAGTTCCAGAGCGGGGCTACCGTCGATATCCAGA‑ATGCCCAGGGCCAGCCCGTACTCAGTGTCAGCGATGCCGGGCCGCTGCTGTATGTGCAATTGCCTCCCGGCAAATACAAGGTCATTGGCAATGCCCAAGGCCAGGCAGTGCAGCAGTGGGCGACCGTCACGGGCAAGGCGCCCACGACCGTTAACCTTAACTGGCGTTGATGAAA > NC_002947/3572127‑3572413 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |