New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3729852 = | 28 (0.490) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 12.6% | coding (341/435 nt) | PP_3296 | putative transporter |
? | NC_002947 | 3729887 = | 29 (0.540) | coding (376/435 nt) | PP_3296 | putative transporter |
CGGCCTTGCTGGGAAGTAAGATACAGCTGCCTGCCAGGCGCGACATCGACCGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTGAGTTCTGATCGATATCAGAATAAGGCACTTACTGAGTGTAA > NC_002947/3729705‑3730000 | ggaataactacgctaaatattcatttagtagagttacactcagtaagtgccttattctgatatcgatcagaactcaattgtttaccgtcaaaccctgccctgatgacggctgcgaaacgcttccgcaacattaaacactcccataccgg < 3:81952‑M1/2‑1 (MQ=255) atacctacgctaaatattcatttagtagagttacactcagtaagtgccttattctgatatcgatcagaactcaattgtttaccgtcaaaccctgccctgatgacggctgcgaaacgcttccgcaacattaaacactcccataccGGCaa > 4:40753‑M1/145‑149 (MQ=255) ctaaatattcatttagtagagttacactcagtaagtgccttattctgatatcgatcagaactcaattgtttaccgtcaaaccctgccctgatgacggctgcgaaacgcttccgcaacattaaacactcccataccGGCAAGCCTGGCTa < 5:113149‑M1/14‑1 (MQ=255) aaGTAAGATACAGCTGCCTGCCAGGCGCGACATCGACCGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTAt < 4:212632/149‑1 (MQ=255) gTAAGATACAGCTGCCTGCCAGGCGCGACATCGACCGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTc > 6:45991/1‑149 (MQ=255) ctgcctgcCAGGCGCGACATCGACCGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGAt > 3:190414/1‑149 (MQ=255) tgcctgccAGGCGCGACATCGACCGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATg > 3:177775/1‑149 (MQ=255) gccAGGCGCGACATCGACCGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGc > 7:3463/1‑149 (MQ=255) gccAGGCGCGACATCGACCGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTAGCCGGGGGGTACTGGCAAGCGTGGCTATTCGTGCTAGCGATGCTTGc > 5:73924/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCGACATCGACCGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTCCTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCg < 5:45991/149‑1 (MQ=255) gcgACATCGACCGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATg > 3:248319/1‑149 (MQ=255) cgACATCGACCGTCGCCGCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGGGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATgg < 3:359099/149‑1 (MQ=255) aTCGACCGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAgt < 2:253262/149‑1 (MQ=255) cttattctgatatcgatcagaactcaattgtttaccgtcaaaccctgccctgatgacggctgcgaaacgcttccgcaacattaaacactcccataccGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTaa > 6:113149‑M1/98‑149 (MQ=255) cGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTaa < 8:3463/149‑1 (MQ=255) aCTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTGCGGCATCGGCGGGGGGCTTGCCGGCGAATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTCCTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTg < 3:112969/149‑1 (MQ=255) tatcgatcagaactcaattgtttaccgtcaaaccctgccctgatgacggctgcgaaacgcttccgcaacattaaacactcccataccGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATg < 6:327255‑M1/54‑1 (MQ=255) tatcgatcagaactcaattgtttaccgtcaaaccctgccctgatgacggctgcgaaacgcttccgcaacattaaacactcccataccGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATg > 5:327255‑M1/88‑141 (MQ=255) gggAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGtt > 4:107115/1‑149 (MQ=255) ccTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGTAGCGTTTCg > 6:99066/1‑147 (MQ=255) gCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATcag > 2:167747/1‑149 (MQ=255) ggCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGa < 4:190414/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCCGGCGTATGGCCGGGGCCGGGGCGGGGGGTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGa < 4:248319/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGTCCGTCCGGCGCCGGTGCTGGTGTCACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGt < 4:41928/148‑1 (MQ=255) gCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATcaggg > 1:325534/1‑130 (MQ=255) gTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAAt > 2:57256/1‑149 (MQ=255) tATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAAtt < 3:107115/149‑1 (MQ=255) tGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTGa < 4:177775/149‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTGAGTTCTGATCGat < 6:73924/149‑1 (MQ=255) aCTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGTAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTGAGTTCTGATCGATATCAGAATaa < 5:99066/148‑1 (MQ=255) aCTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTGAGTTCTGATCGATATCAGAATAAg > 6:202708/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTGAGTTCTGATCGATATCAGAATAAg < 1:167747/148‑1 (MQ=255) gCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTGAGTTCTGATCGATATCAGAATAAGGCAc > 2:14032/1‑149 (MQ=255) ggTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTGAGTTCTGATCGATATCAGAATAAGGCACTTACTGa < 1:57256/149‑1 (MQ=255) aCTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTGAGTTCTGATCGATATCAGAATAAGGCACTTACTGAgtg > 1:308570/1‑149 (MQ=255) tGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTg < 5:308927/109‑1 (MQ=255) tGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTg > 6:308927/1‑109 (MQ=255) GGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTGAGTTCTGATCGATATCAGAATAAGGCACTTACTGAGTGTaa < 4:81952‑M1/149‑1 (MQ=255) | CGGCCTTGCTGGGAAGTAAGATACAGCTGCCTGCCAGGCGCGACATCGACCGTCGACTCGTCGGGGGGAGCCTGGTTTTCGGCATAGGCTGGGGGCTTGCCGGCGTATGTCCGGGGCCGGTGCTGGTGTTACTCGCCGGGGGGTACTGGCAAGCCTGGCTATTCGTGCTCGCGATGCTTGCCGGTATGGGAGTGTTTAATGTTGCGGAAGCGTTTCGCAGCCGTCATCAGGGCAGGGTTTGACGGTAAACAATTGAGTTCTGATCGATATCAGAATAAGGCACTTACTGAGTGTAA > NC_002947/3729705‑3730000 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |