New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3956843 = | 51 (0.900) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 7.7% | coding (3542/5844 nt) | mnxG | manganese‑oxidizing multicopper oxidase |
? | NC_002947 | 3956902 = | 47 (0.860) | coding (3483/5844 nt) | mnxG | manganese‑oxidizing multicopper oxidase |
GCTTGCCGTCCGGGCCGACCTTGTTCGGGTCATACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACA > NC_002947/3956703‑3956984 | gCTTGCCGTCCGGGCCGACCTTGTTCGGGTCATACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGt < 7:245383/149‑1 (MQ=255) ttGCCGTCCGGGCCGACCTTGTTCGGGTCATACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGCACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGTGTGAGACCGCCGCGtta > 7:268763/1‑148 (MQ=255) gttcttcctggagtacagtgacttccagcatgcctatgaagctggggtgtacgtaggcgcagggccggacggcattcccaatgcccagtcgtacccggccactgccgacagcttccgttacgtcatcaacCCGCCGCGTTTCTcgacga < 5:76347‑M1/19‑1 (MQ=255) gggCCGACCTTGTTCGGGTCATACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGAt < 8:69734/149‑1 (MQ=255) gggCCGACCTTGTTCGGGTCATACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGAt < 7:73659/149‑1 (MQ=255) ggCCGACCTTGTTCGGGTCATACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCTCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGttt < 8:265187/139‑1 (MQ=255) ggCCGACCTTGTTCGGGTCATACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGCCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGttt > 7:265187/1‑139 (MQ=255) gggTCATACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGtt > 4:336818/1‑149 (MQ=255) gTCATACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTc > 8:123097/1‑148 (MQ=255) gTCATACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTc > 5:24198/1‑148 (MQ=255) tACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGc > 3:262210/1‑149 (MQ=255) tccagcatgcctatgaagctggggtgtacgtaggcgcagggccggacggcattcccaatgcccagtcgtacccggccactgccgacagcttccgttacgccatcaacCCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGcc < 8:296505‑M1/42‑1 (MQ=255) cacGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCt > 3:295460/1‑149 (MQ=255) cAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCcgc < 7:123097/149‑1 (MQ=255) gCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCAcgggcggg < 4:316862/149‑1 (MQ=255) gCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCAcgggcggg < 1:193135/149‑1 (MQ=255) tCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGtt > 4:178176/1‑149 (MQ=255) ttGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAgg > 6:123211/1‑117 (MQ=255) ttGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAgg < 5:123211/117‑1 (MQ=255) tgtacgtaggcgcagggccggacggcattcccaatgcccagtcgtacccggccactgccgacagcttccgttacgtcatcaacCCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATg > 6:76347‑M1/84‑149 (MQ=255) gtacgtaggcgcagggccggacggcattcccaatgcccagtcgtacccggccactgccgacagcttccgttacgccatcaacCCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATgg > 7:296505‑M1/83‑149 (MQ=255) gTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGt < 3:215660/149‑1 (MQ=255) gTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGt < 4:262210/149‑1 (MQ=255) ttGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACg < 3:336818/149‑1 (MQ=255) acgacgAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGCTCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTGGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGGTGATGGCGTAACGGaa < 8:276569/149‑1 (MQ=255) cgacgaACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAg < 4:295460/149‑1 (MQ=255) gacgaACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTc < 3:332932/106‑1 (MQ=255) gacgaACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTc > 4:332932/1‑106 (MQ=255) gaACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGt > 7:319671/1‑149 (MQ=255) cATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCgg > 1:233662/1‑149 (MQ=255) cGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTgg > 1:82119/1‑149 (MQ=255) tCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCgg < 2:14465/149‑1 (MQ=255) cACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTAc < 6:24198/148‑1 (MQ=255) aCCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGa > 8:196185/1‑149 (MQ=255) aCCGAGATCGCCTGCGGGCAGGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTTGACGAGGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTTGCCGGGTACGa < 8:268763/149‑1 (MQ=255) ccGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGt > 2:100987/1‑144 (MQ=255) ccGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGt < 1:100987/144‑1 (MQ=255) cGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACt > 5:336845/1‑149 (MQ=255) cGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCAt > 3:290248/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGCCTGGGCATTg > 4:271491/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTg < 2:82119/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGt < 3:192226/134‑1 (MQ=255) cTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGt > 4:192226/1‑134 (MQ=255) cTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTgg < 2:233662/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTgg > 6:83969/1‑149 (MQ=255) ggCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTg > 3:211409/1‑117 (MQ=255) ggCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTg < 4:211409/117‑1 (MQ=255) gCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTc < 8:319671/148‑1 (MQ=255) ccGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCg < 6:336845/149‑1 (MQ=255) ccGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCg < 4:290248/149‑1 (MQ=255) cGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCgg > 3:166109/1‑149 (MQ=255) ttGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCt > 8:192993/1‑149 (MQ=255) cAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGcc < 4:166109/149‑1 (MQ=255) cccGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATg < 2:29024/78‑1 (MQ=255) gTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTaca > 1:253136/1‑149 (MQ=255) | GCTTGCCGTCCGGGCCGACCTTGTTCGGGTCATACACGCGCAGGGCCAGCGGCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACA > NC_002947/3956703‑3956984 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |