New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3956843 = | 51 (0.900) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 7.7% | coding (3542/5844 nt) | mnxG | manganese‑oxidizing multicopper oxidase |
? | NC_002947 | 3956902 = | 47 (0.860) | coding (3483/5844 nt) | mnxG | manganese‑oxidizing multicopper oxidase |
GCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAGGCATGCTGGAAGTCACTGTACTCCAGGAAGAACTCGCGGTAGCTGTCGTTCT > NC_002947/3956754‑3957050 | gCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCAcgggcggg < 1:193135/149‑1 (MQ=255) gCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCAcgggcggg < 4:316862/149‑1 (MQ=255) tCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGtt > 4:178176/1‑149 (MQ=255) tgtacgtaggcgcagggccggacggcattcccaatgcccagtcgtacccggccactgccgacagcttccgttacgtcatcaacCCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATg > 6:76347‑M1/84‑149 (MQ=255) gtacgtaggcgcagggccggacggcattcccaatgcccagtcgtacccggccactgccgacagcttccgttacgccatcaacCCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATgg > 7:296505‑M1/83‑149 (MQ=255) gTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGt < 3:215660/149‑1 (MQ=255) gTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGt < 4:262210/149‑1 (MQ=255) ttGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACg < 3:336818/149‑1 (MQ=255) acgacgAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGCTCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTGGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGGTGATGGCGTAACGGaa < 8:276569/149‑1 (MQ=255) cgacgaACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAg < 4:295460/149‑1 (MQ=255) gaACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGt > 7:319671/1‑149 (MQ=255) cATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCgg > 1:233662/1‑149 (MQ=255) cGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTgg > 1:82119/1‑149 (MQ=255) tCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCgg < 2:14465/149‑1 (MQ=255) cACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTAc < 6:24198/148‑1 (MQ=255) aCCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGa > 8:196185/1‑149 (MQ=255) aCCGAGATCGCCTGCGGGCAGGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTTGACGAGGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTTGCCGGGTACGa < 8:268763/149‑1 (MQ=255) ccGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGt > 2:100987/1‑144 (MQ=255) ccGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGt < 1:100987/144‑1 (MQ=255) cGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACt > 5:336845/1‑149 (MQ=255) cGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCAt > 3:290248/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGCCTGGGCATTg > 4:271491/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTg < 2:82119/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGt > 4:192226/1‑134 (MQ=255) cTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGt < 3:192226/134‑1 (MQ=255) cTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTgg > 6:83969/1‑149 (MQ=255) cTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTgg < 2:233662/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTg < 4:211409/117‑1 (MQ=255) ggCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTg > 3:211409/1‑117 (MQ=255) gCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTc < 8:319671/148‑1 (MQ=255) ccGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCg < 4:290248/149‑1 (MQ=255) ccGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCg < 6:336845/149‑1 (MQ=255) cGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCgg > 3:166109/1‑149 (MQ=255) ttGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCt > 8:192993/1‑149 (MQ=255) cAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGcc < 4:166109/149‑1 (MQ=255) cccGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATg < 2:29024/78‑1 (MQ=255) ccatcaacccgcccgtgcgcggcaaggcgtcgaacctgctcgaagccatcgtcgagaaacgcggcggGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTac > 7:296505‑M2/68‑149 (MQ=255) gTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTaca > 1:253136/1‑149 (MQ=255) catcaacccgcccgtgcgcggcaaggcgtcgaacctgctcgaagccatcgtcgagaaacgcggcggGTTGATGACGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTaca > 6:76347‑M2/67‑149 (MQ=255) cgTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATa < 7:192993/149‑1 (MQ=255) gTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAg < 3:312381/149‑1 (MQ=255) tctcGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAGGCa > 6:141869/1‑149 (MQ=255) tcGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACg > 4:233194/1‑126 (MQ=255) tcGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACg < 3:233194/126‑1 (MQ=255) gacgaTGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAGGCATGCt < 7:196185/149‑1 (MQ=255) acgaTGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAg > 4:124718/1‑141 (MQ=255) acgaTGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAg < 3:124718/141‑1 (MQ=255) ggcgtcgaacctgctcgaagccatcgtcgagaaacgcggcggGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAGGCATGCTGGa < 8:296505‑M2/107‑1 (MQ=255) aTGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAGGCATGCTGGaa < 3:178176/149‑1 (MQ=255) gCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTc > 7:153229/1‑131 (MQ=255) gCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTc < 8:153229/131‑1 (MQ=255) ttCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAGGCATGCTGGAAGTCAc > 3:220587/1‑149 (MQ=255) tCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAgg > 8:5878/1‑123 (MQ=255) tCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAgg < 7:5878/123‑1 (MQ=255) tcgtcgagaaacgcggcggGTTGATGACGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAGGCATGCTGGAAGTCACTGTACTCCAGGAAGAAc < 5:76347‑M2/130‑1 (MQ=255) cTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAGGCATGCTGGAAGTCACTGTACTCCAGGAAGAACt > 8:180470/1‑149 (MQ=255) aCGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAGGCATGCTGGAAGTCACTGTACTCCAGGAAGAACTCGCGGTAGCt < 2:253136/149‑1 (MQ=255) gTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAGGCATGCTGGAAGTCACTGTACTCCAGGAAGAACTCGCGGTAGCTGTCGTTCt > 6:184723/1‑149 (MQ=255) | GCTCGTTGCGGTAGTTGACGACGAACATCCCCGGGTCATCCACCGAGATCGCCTGCGGGCATGGCCGGCTTGGGCAGCCCGGGTTGAGACCGCCGCGTTTCTCGACGATGGCTTCGAGCAGGTTCGACGCCTTGCCGCGCACGGGCGGGTTGATGGCGTAACGGAAGCTGTCGGCAGTGGCCGGGTACGACTGGGCATTGGGAATGCCGTCCGGCCCTGCGCCTACGTACACCCCAGCTTCATAGGCATGCTGGAAGTCACTGTACTCCAGGAAGAACTCGCGGTAGCTGTCGTTCT > NC_002947/3956754‑3957050 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |