New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4146453 = | 64 (1.130) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.3% | coding (536/2184 nt) | PP_3651 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | 4146516 = | 47 (0.880) | coding (599/2184 nt) | PP_3651 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
CGATTCGCGGCCATGATGGCGAGATTCTGGGCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCTGGTGGGCCACTATCACCTGCAT > NC_002947/4146306‑4146598 | cGATTCGCGGCCATGATGGCGAGATTCTGGGCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTCAACTTTCTCGATACCCGCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCCGA‑CCAGCTCATGGcc > 5:309624/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGCCATGATGGCGAGATTCTGGGCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATc < 6:196248/149‑1 (MQ=255) attgatcaccagggccaggcggctgcgcaggcggctgagagccaggcggccgaagtcatgcaggtgatagtggccgaccaggcgtggtgaaccgggggtcactgcatcgccgcaaatggtgaaaccgtcctcgtcggggtCCATcacc > 4:342056‑M1/141‑148 (MQ=255) atgatgGCGAGATTCTGGGCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGAGCCAGAACTTTCTCGATACCCTCTCGCGAGCCG‑TGACCCAGCCGACCGCCCCGTA‑CCACATCATGGCCATCAAAACCCg > 5:179601/1‑148 (MQ=255) tgatgGCGAGATTCTGGGCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCa > 6:28491/1‑149 (MQ=255) ggCGAGATTCTGGGCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCt > 8:59861/1‑149 (MQ=255) ggCGAGATTCTGGGCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCt > 3:319455/1‑149 (MQ=255) cGAGATTCTGGGCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTgg > 7:147978/1‑149 (MQ=255) tCTGGGCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAg < 4:161295/148‑1 (MQ=255) tCTGGGCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAg < 4:155809/148‑1 (MQ=255) ggCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCa < 6:367904/146‑1 (MQ=255) ggCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCt > 3:316270/1‑149 (MQ=255) ggCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCACCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCAc < 3:107092/147‑1 (MQ=255) cATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTg < 4:316270/149‑1 (MQ=255) aTGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCGTTGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTg < 1:107044/149‑1 (MQ=255) gACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGACCCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGc < 1:74655/145‑1 (MQ=255) gACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGc > 2:74655/1‑144 (MQ=255) ggTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCt > 6:191363/1‑149 (MQ=255) tCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTgc < 1:61218/149‑1 (MQ=255) aCCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTgcgc > 1:361278/1‑149 (MQ=255) aaaCCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTAt > 3:124528/1‑149 (MQ=255) aaaCCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTAt < 7:59861/149‑1 (MQ=255) accaccGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGc < 5:191363/149‑1 (MQ=255) accaccGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGc < 4:319455/149‑1 (MQ=255) caccGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTgg < 3:175915/113‑1 (MQ=255) caccGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTgg > 4:175915/1‑113 (MQ=255) caccGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCgg < 8:147978/149‑1 (MQ=255) caacGCCATCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCgg < 6:179601/146‑1 (MQ=255) accGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGt > 4:122537/1‑149 (MQ=255) cgaagtcatgcaggtgatagtggcccaccaggcgtggtgaaccgggggtcactgcatcgccgcaaatggtgaaaccgtcctcgtcggggtCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGt < 2:11059‑M1/58‑1 (MQ=255) ccAGCGTGGTCACCAACCAGCTCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGTGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATg < 4:279413/149‑1 (MQ=255) agtcatgcaggtgatagtggcccaccaggcgtggtgaaccgggggtcactgcatcgccgcaaatggtgaaaccgtcctcgtcggggtCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATg > 1:11059‑M1/88‑149 (MQ=255) aGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGa > 7:335811/1‑149 (MQ=255) gTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATCCCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGAccc < 6:303771/149‑1 (MQ=255) catgcaggtgatagtggcccaccaggcgtggtgaaccgggggtcactgcatcgccgcaaatggtgaaaccgtcctcgtcggggtCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGa > 8:223646‑M1/85‑148 (MQ=255) accaaccaGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCcgacga < 4:124528/149‑1 (MQ=255) caaccaGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCg < 6:17864/130‑1 (MQ=255) caaccaGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCg > 5:17864/1‑130 (MQ=255) caaccaGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAgg < 2:361278/149‑1 (MQ=255) cTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCAc > 7:292208/1‑149 (MQ=255) tGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCAc > 1:238056/1‑148 (MQ=255) gAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCt > 3:171143/1‑99 (MQ=255) gAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCt < 4:171143/99‑1 (MQ=255) aCTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCAtt < 5:360222/149‑1 (MQ=255) tttCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTCTCCAGCTCCGCCTATGCGGTTATGGACCCCGACGAGCACGGTTTAACCATTTg > 8:275845/1‑149 (MQ=255) tctcGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTg < 7:275845/147‑1 (MQ=255) tctcGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTAAGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTgcg > 5:294094/1‑149 (MQ=255) gATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTgcggc < 2:40334/147‑1 (MQ=255) gATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGa < 5:181113/149‑1 (MQ=255) aTACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGAt > 5:87469/1‑149 (MQ=255) tACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATg < 4:55145/149‑1 (MQ=255) cccTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCa < 8:292208/149‑1 (MQ=255) ccTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGAGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAg > 3:67482/1‑149 (MQ=255) gggCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGAc < 4:67482/149‑1 (MQ=255) gAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGAccccc > 8:172623/1‑149 (MQ=255) gCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCgg > 8:79665/1‑149 (MQ=255) ccGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTcacca > 6:158055/1‑149 (MQ=255) ccGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTcacca > 4:20481/1‑149 (MQ=255) cGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTca < 4:33842/145‑1 (MQ=255) cGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTca > 3:33842/1‑145 (MQ=255) accgtccCGGA‑CCAGATACTTTCCATCACCACCCGCAAGCTGGTCGTGCACATTGGCCTGTCCTGCTGCGCCTATGCGGTGCTGGACGCCGACGAGGAGGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCtggt < 6:309624/149‑1 (MQ=255) cgaccCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCtggtgg < 2:238056/149‑1 (MQ=255) ccGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGtt > 4:129928/1‑130 (MQ=255) ccGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGtt < 3:129928/130‑1 (MQ=255) ggA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCTGGTGGGCCAc > 3:179177/1‑148 (MQ=255) gA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCTGGTGGGCCACTa > 5:277726/1‑149 (MQ=255) gA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATCCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCTGGTGGGCCACTa < 5:151947/149‑1 (MQ=255) gATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCTGGTGGGCCACTATCAcc < 3:20481/149‑1 (MQ=255) tCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGt > 7:16908/1‑109 (MQ=255) tCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGt < 8:16908/109‑1 (MQ=255) aTGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCTGGTGGGCCACTATCACCTGc < 6:277726/148‑1 (MQ=255) tGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCTGGTGGGCCa < 7:340970/136‑1 (MQ=255) tGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCTGGTGGGCCa > 8:340970/1‑136 (MQ=255) tGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCTGGTGGGCCACTATCACCTGCAt < 3:122537/149‑1 (MQ=255) | CGATTCGCGGCCATGATGGCGAGATTCTGGGCATGCTCGACACGGTCACCGAAACCACCGCCAGCGTGGTCACCAACCAGCGCCTGAACTTTCTCGATACCCTCGGGCGAGCCG‑TGACCGAGGCGACCGACCCGGA‑CCAGATCATGGCCATCACCACCCGCATGCTGGTCGAGCACCTTGGCCTGTCCAGCTGCGCCTATGCGGTGATGGACCCCGACGAGGACGGTTTCACCATTTGCGGCGATGCAGTGACCCCCGGTTCACCACGCCTGGTGGGCCACTATCACCTGCAT > NC_002947/4146306‑4146598 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |