New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4233848 | 57 (1.010) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 6.9% | coding (1217/1512 nt) | PP_3711 | diguanylate cyclase |
? | NC_002947 | = 4233885 | 53 (0.980) | coding (1180/1512 nt) | PP_3711 | diguanylate cyclase |
GTCGGTTTCCACCAGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATCCCGCCCCTCCAGGCCCGTCAGCACCACGGCAAACTCGTC > NC_002947/4233703‑4233996 | gTCGGTTTCCACCAGGCGGCGCTGGCGGCCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATACATAACGATTACGGCCGTTACGCTAGGCCTCGAACAGCGCCATCTCAGCGTAGCACAGCAATTGCTCTGCATCGTCATGGTCATCTGgct > 4:30727/1‑148 (MQ=255) tttCCACCAGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCgcgatg > 3:251314/1‑149 (MQ=255) tttCCACCAGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCgcgatg > 2:86850/1‑149 (MQ=255) ttCCACCAGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCgcgatgg > 7:232910/1‑149 (MQ=255) caccaGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCgcgatggcg < 4:26259/148‑1 (MQ=255) accaGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGttcgcggtggggg > 2:333992‑M1/1‑136 (MQ=255) accaGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCgcgatggcgat > 2:32479/1‑149 (MQ=255) accaGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCgcgatggcgat > 6:366191/1‑149 (MQ=255) accaGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGAAGCCCAGCAGTTCATCTGCATGGTCATGGTCATCAGCCgcgatgcctat > 4:339708/1‑144 (MQ=255) caGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGcgatgc < 3:35840/149‑1 (MQ=255) caGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGcgatgc < 8:232910/149‑1 (MQ=255) gcggcgCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCgcgatggcg < 6:104282/142‑1 (MQ=255) gcggcgCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCgcgatggcg > 5:104282/1‑142 (MQ=255) gcgggcggCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCAc < 7:245620/147‑1 (MQ=255) cgggcggCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCgcgatg > 6:194293/1‑129 (MQ=255) cgggcggCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCgcgatg < 5:194293/129‑1 (MQ=255) gggcggCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCAcacc > 5:259024/1‑148 (MQ=255) gggcggCAACGTCCAGTGCGACATCGAAGCATGCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCAccccc < 6:190958/149‑1 (MQ=255) cggcAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCAcc < 6:322742/149‑1 (MQ=255) ccAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTAGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAActga < 1:253424‑M2/149‑5 (MQ=255) cAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAActgat > 1:32479‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAActga > 5:366191‑M2/1‑144 (MQ=255) aGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGAATACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAActgatg < 8:327543‑M2/149‑7 (MQ=255) ttCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGttcgcggtgggggtgagcatcggcatcgccatcgcgcctgatgac < 1:333992‑M1/149‑46 (MQ=255) gACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCAcc < 5:55876/127‑1 (MQ=255) gACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCAcc > 6:55876/1‑127 (MQ=255) cATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTc > 7:176622/1‑148 (MQ=255) cGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCAcc > 3:180695/1‑128 (MQ=255) cGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCAcc < 4:180695/128‑1 (MQ=255) gAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGttcgcggtgggggtgagcatcggcatcgccatcgcgcctgatgacc < 8:336433‑M1/141‑47 (MQ=255) gAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGttcgcggtgggggtgagcatcggcatcgccatcgcgcctgatgacc > 7:336433‑M1/1‑95 (MQ=255) aaGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCg > 3:286726/1‑149 (MQ=255) aTAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAAcggcg > 4:4228/1‑149 (MQ=255) tAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGAATGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGGCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCGGATGCTGACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAAcggcgg > 7:151769/1‑149 (MQ=255) gATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCt > 7:345254/1‑148 (MQ=255) ttACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGAt > 3:124919/1‑149 (MQ=255) cGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGc > 3:55438/1‑149 (MQ=255) ggCCGTTACGCTTGGCCTTGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCTTCAGTTGCTCTGCCTGTTCATGGTCATCACGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGcc < 8:151769/149‑1 (MQ=255) ggCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGcc > 2:258788/1‑149 (MQ=255) ggCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGcc > 2:263760/1‑149 (MQ=255) gTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGa < 7:327543/149‑1 (MQ=255) tACGCTTGGCCTGGTACAGCTCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCGGGGTCATGTTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGAt < 3:30727/148‑1 (MQ=255) cGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAg < 8:176622/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCt > 1:23074/1‑141 (MQ=255) gCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCt < 2:23074/141‑1 (MQ=255) gCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTACCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAgg > 1:134127/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTAAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAgg < 6:259024/149‑1 (MQ=255) ttGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTATGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATCCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTAGATCCGGAACGGCGGGCTGAAGGCCTTGATCAGgcg > 2:167719/1‑149 (MQ=255) gCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCt < 2:253424/148‑1 (MQ=255) gTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGATCTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCgg > 8:219851/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTa < 4:55438/148‑1 (MQ=255) aGCGCCATGTCAGGGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGGCTGGTCATGGTGATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCAACCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTAtt < 4:239454/149‑1 (MQ=255) aGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTAtt < 3:339708/149‑1 (MQ=255) aGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTCATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTAtt < 4:251314/149‑1 (MQ=255) ccATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCAc > 1:223286/1‑149 (MQ=255) gTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAAGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCgg > 1:252620/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCAGTTGCTCTGCGTGGTCATGGTCATGAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGGCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATACCGc < 1:167719/148‑1 (MQ=255) ccAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATg < 3:335262/104‑1 (MQ=255) ccAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATg > 4:335262/1‑104 (MQ=255) gcagTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATCCCGCCCCTcc < 5:318082/149‑1 (MQ=255) ttGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATCCCGCCCCTCCAGGc < 1:86850/149‑1 (MQ=255) ctctGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATCCCGCCCCTCCAGGCCCg > 1:248297/1‑149 (MQ=255) tcatggtcatCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATCCCGCCCCTCCAGGCCCGTCAGcaccac > 1:1184/1‑149 (MQ=255) tggtcatCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATCCCGCCCCTCCAGGCCCGTCAGCACCACGGc < 4:286726/149‑1 (MQ=255) ggtcatCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAActgatgaccatgaccaggcagagcaactgctgggctacgctgacatggcgctgtaccaggccaagcgtaacggccgtaatcgttatgaatgcttc > 7:336433‑M2/1‑46 (MQ=255) ggtcatCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAActgatgaccatgaccaggcagagcaactgctgggctacgctgacatggcgctgtaccaggccaagcgtaacggccgtaatcgttatgaatgcttc < 8:336433‑M2/141‑96 (MQ=255) gtcatCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAActgatgaccatgaccaggcagagcaactgctgggctacgctgacatggcgctgtaccaggccaagcgtaacggccgtaatcgttatgaatgcttcgatgtcgaa < 1:333992‑M2/149‑105 (MQ=255) tcatcaGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATCCCGCCCCTCCAGGCCCGTCAGCACCACGGCaaa < 2:134127/149‑1 (MQ=255) catcaGttcgcggtgggggtgagcatcggcatcgccatcgcgcctgatgaccatgaccaggcagagcaactgctgggctacgctgacatggcgctgtaccaggccaagcgtaacggccgtattcgttatgaatgcttcgatgtcgaact < 8:327543‑M1/149‑144 (MQ=255) catcaGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATCCCGCCCCTCCAGGCCCGTCAGCACCACGGCAAAc > 3:170101/1‑149 (MQ=255) atcaGttcgcggtgggggtgagcatcggcatcgccatcgcgcctgatgaccatgaccaggcagagcaactgctgggctacgctgacatggcgctgtaccaggccaagcgtaacggccgtaatcgttatgaatgcttcgatgtcgaactg > 1:32479‑M1/1‑5 (MQ=255) tcaGttcgcggtgggggtgagcatcggcatcgccatcgcgcctgatgaccatgaccaggcagagcaactgctgggctacgctgacatggcgctgtaccaggcctagcgtaacggccgtaatcgttatgaatgcttcgatgtcgaactgg < 1:253424‑M1/149‑146 (MQ=255) tcaGttcgcggtgggggtgagcatcggcatcgccatcgcgcctgatgaccatgaccaggcagagcaactgctgggctacgctgacatggcgctgtaccaggccaagcgtaacggccgtaatcgttatgaatgcttcgatgtcgaactg > 5:366191‑M1/1‑4 (MQ=255) tcaGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGAGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATCCCGCCCCTCCAGGCCCGTCAGCCCCCCGGCAAACtc > 8:28386/1‑149 (MQ=255) ggCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGATCTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATCCCGCCCCTCCAGGCCCGTCAGCACCACGGCAAACtcgtc < 7:219851/149‑1 (MQ=255) | GTCGGTTTCCACCAGGCGGCGCTGGCGGGCGGCAACGTCCAGTTCGACATCGAAGCATTCATAACGATTACGGCCGTTACGCTTGGCCTGGTACAGCGCCATGTCAGCGTAGCCCAGCAGTTGCTCTGCCTGGTCATGGTCATCAGGCGCGATGGCGATGCCGATGCTCACCCCCACCGCGAACTGATGCCCTTCGATCCGGAACGGCGGGCTGATGGCCTTGATCAGGCGCTGCGCGGTATTGCACGCGGCATCCCGCCCCTCCAGGCCCGTCAGCACCACGGCAAACTCGTC > NC_002947/4233703‑4233996 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |