New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5657326 = | 51 (0.900) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.7% | coding (369/1998 nt) | tktA | transketolase A |
? | NC_002947 | 5657374 = | 51 (0.950) | coding (321/1998 nt) | tktA | transketolase A |
GTGCCGGCCAGCGAGGCGACTTCATGGGAGATGCCTTCCATCATGCAGCCGTCGCCGAGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGATGGTGACGTCGTAGCCGGTCAGGTGCAG > NC_002947/5657180‑5657472 | gcttcgtgctgtccaacggccacggctcgatgctgatctactcgctgctgcacctgaccggctacgacgtcaccatcgatgacatcaaaggcttccgccaactgcacagccgcaccccgggccacccggaatacggctacaccccaGGc > 1:342548‑M1/147‑149 (MQ=255) ttcgtgctgtccaacggccacggctcgatgctgatctactcgctgctgcacctgaccggctacgacgtcaccatcgatgacgtcaaaggcttccgccaactgcacagccgcaccccgggccacccggaatacggctacaccccaGGCGt < 8:176393‑M1/5‑1 (MQ=255) ggCCAGCGAGGCGACTTCATGGGAGATGCCTTCCATCATGCAGCCGTCGCCGAGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTgg < 4:308984/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCGAGGCGAATTCATGGGAGATGCCTTCCATCATGCAGCCGTCGCCGAGCAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCAGGGTTCAACTGGGCAGCCATTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTgg < 7:33356/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGGCGACTTCATGGGAGATGCCTTCCATCATGCAGCCGTCGCCGAGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGc > 1:180245/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGGCTACTTATTGGTATATGCCTTCCATAATGAAGCCGTCGCCGAGCAACACTTAGGTGTTGTGGTCTACTATTTTGTGGCGGTAACGTTTTAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCTGGGCTAAGCCCACGGCGTTGGCg < 2:196461/149‑1 (MQ=255) gCGAGGCGACTTCATGGGAGATGCCTTCCATCATGCAGCCGTCGCCGAGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATa > 2:203548/1‑149 (MQ=255) aGGCGACTTCATGGGAGATGCCTTCCATCATGCAGCCGTCGCAGAGGAACACATAGGTGTTGTCGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCAACGGCGTTGGCGATAccc > 5:300158/1‑149 (MQ=255) tGGGAGATGCCTTCCATCATGCAGCCGTCGCCGAGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGAGAAGCAAAAGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCgg > 5:173863/1‑149 (MQ=255) gagaTGCCTTCCATCATGCAGCCGTCGCCGAGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGAAATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCCGGGCGAAGCCCCCGGCGTTGGCCAAACCCTCCACGAGCGGGcc > 8:258212/1‑149 (MQ=255) cgaggCCTTCCATCATGCCGCCGCCGCCGAGGACCCCATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGGGGCCGCCACGGTGGACCGGGGCAGCCAGAACTTTTTCGGCCCGGCCTAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCg < 6:17065/145‑1 (MQ=255) cattcatGCAGCCGTCGCCGAGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATTTTGTGGCCGTCAGGGTTGAAGTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCggtggtgg < 2:75157/144‑1 (MQ=255) tactcgctgctgcacctgaccggctacgacgtcaccatcgatgacatcaaaggcttccgccaactgcacagccgcaccccgggccacccggaatacggctacaccccaGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGtt < 4:53295‑M1/40‑1 (MQ=255) catcatGCAGCCGTCGCCGAGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGttt > 6:81576/1‑149 (MQ=255) catcatGCAGCCGTCGCCGAGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGtt < 1:203548/148‑1 (MQ=255) catGCAGCCGTCGCCGAGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCaa > 4:241373/1‑149 (MQ=255) ctgcacctgaccggctacgacgtcaccatcgatgacgtcaaaggcttccgccaactgcacagccgcaccccgggccacccggaatacggctacaccccaGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTg > 7:176393‑M1/100‑149 (MQ=255) cacctgaccggctacgacgtcaccatcgatgacatcaaaggcttccgccaactgcacagccgcaccccgggccacccggaatacggctacaccccaTGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTggg > 3:53295‑M1/97‑148 (MQ=255) aGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGcc < 3:241373/149‑1 (MQ=255) cacaTAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTAt > 6:52433/1‑148 (MQ=255) acaTAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACGCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTc < 1:89930/149‑1 (MQ=255) cttAGGTGTTGTGGTCGACTATATTGTGCCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTGGGCCTGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTcc < 6:300158/147‑1 (MQ=255) aTAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCg > 3:15776/1‑149 (MQ=255) tAGGTGTTGTGGTCGACGTTTTTGTGGCGGTCACGGGTGAACTGGGCAGCCAGTAGTTTTTCGGCCTGGGCTAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCgg < 4:15776/149‑1 (MQ=255) catcgatgacatcaaaggcttccgccaactgcacagccgcaccccgggccacccggaatacggctacaccccaGGCGtt < 4:46078‑M1/6‑1 (MQ=255) catcgatgacatcaaaggcttccgccaactgcacagccgcaccccgggccacccggaatacggctacaccccaGGCGtt > 3:46078‑M1/74‑79 (MQ=255) gtgGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCg > 8:37549/1‑149 (MQ=255) gtgGGCGACGTTTTTGGGGCCGGCCCGGGTGACCGGGGCCGCCAGTACTTTTTCGGCCCGGGCGAAGCCCACGGCGGTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTCGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCg < 7:258212/149‑1 (MQ=255) ggTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCggg > 4:137826/1‑149 (MQ=255) gacgaTATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGc > 2:255438/1‑149 (MQ=255) ttGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCtgt < 6:287370/148‑1 (MQ=255) ttGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCtgt < 1:255438/148‑1 (MQ=255) tgGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCtgtg < 4:258362/146‑1 (MQ=255) tgGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCtgtg > 3:258362/1‑146 (MQ=255) gCCGTCACGGGTGAACGGGGGAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGACGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGGGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGtt < 8:164073/149‑1 (MQ=255) cGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCggtgg > 1:76486/1‑87 (MQ=255) cGTCACGGTTCAACTGGGCTGCCTGTACTTTTTCGGCCAGGGCGATGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCggtgg < 2:76486/87‑1 (MQ=255) cGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGTGGCTGTGCAGTTGGCGGaa < 7:37549/149‑1 (MQ=255) cGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCCGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGaa < 5:52433/149‑1 (MQ=255) cGGTGGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGTCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGaa < 5:152768/149‑1 (MQ=255) cggatcTGGGCATCAAGTAATTTTTCGGCCAGGGCTAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGc < 4:143566/143‑1 (MQ=255) aaCTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCtt < 5:81576/148‑1 (MQ=255) aCTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTg < 3:137826/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGTACATTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGc > 3:143566/1‑140 (MQ=255) gCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGATTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGt > 2:363426/1‑148 (MQ=255) cAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAg < 5:301583/137‑1 (MQ=255) cAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAg > 6:301583/1‑137 (MQ=255) gCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGAGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATc > 1:99266/1‑149 (MQ=255) aGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGAt > 5:341689/1‑149 (MQ=255) cTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGATGGt < 2:99266/148‑1 (MQ=255) ggCCTGGGCTAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGATGGTGAcgtcgt < 5:53051/149‑1 (MQ=255) ggCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGATGGTGACGTCGTAGCCgg > 3:257202/1‑149 (MQ=255) gCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCgg < 4:269025/80‑1 (MQ=255) gCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCgg > 3:269025/1‑80 (MQ=255) cgtaGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCGGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGATGGTGACGTCGTAGCCGGTc < 6:173863/146‑1 (MQ=255) cGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCgg < 2:184424/79‑1 (MQ=255) cGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCgg > 1:184424/1‑79 (MQ=255) cGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGATGGTGACGTCGTAGCCGGt > 5:55037/1‑148 (MQ=255) cccACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGATGGTGACGTCGTAGCCGGTCAGGTg > 1:138402/1‑149 (MQ=255) cACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGATGGTGACGTCGTAGCCGGTCAGGTg > 6:108363/1‑147 (MQ=255) aCGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGATGGTGACGTCGTAGCCGGTCAGGTgcag > 4:74510/1‑149 (MQ=255) aCGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGATGGTGACGTAGTAGCCGGTCAGGTgcag > 4:128540/1‑149 (MQ=255) | GTGCCGGCCAGCGAGGCGACTTCATGGGAGATGCCTTCCATCATGCAGCCGTCGCCGAGGAACACATAGGTGTTGTGGTCGACGATATTGTGGCCGTCACGGTTGAACTGGGCAGCCAGTACTTTTTCGGCCAGGGCGAAGCCCACGGCGTTGGCGATACCCTGGCCGAGCGGGCCGGTGGTGGTTTCAACGCCTGGGGTGTAGCCGTATTCCGGGTGGCCCGGGGTGCGGCTGTGCAGTTGGCGGAAGCCTTTGATGTCATCGATGGTGACGTCGTAGCCGGTCAGGTGCAG > NC_002947/5657180‑5657472 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |