New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 959664 | 39 (0.690) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 9.8% | coding (469/540 nt) | PP_5460 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 959675 | 37 (0.690) | coding (480/540 nt) | PP_5460 | membrane protein |
TGGTAGCGATGGTGGTGTTTTGCCTGGGGCAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGCACTGGCCTGCGTGCTACCGGTAGCAATGGCGGACGAT > NC_002947/959530‑959821 | tGGTAGCGATGGTGGTGTTTTGCCTGGGGCAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCtcg < 1:203228‑M2/149‑4 (MQ=255) gTAGCGATGGTGGTGTTTTGCCTGGGGCAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCtcgct < 1:80716‑M2/149‑6 (MQ=255) cGATGGTGGTGTTTTGCCTGGGGCAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTgcgc < 4:322010/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGTGTTTTGCCTGGGGCAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCtt < 5:167774/149‑1 (MQ=255) ttttGCCTGGGGCAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAgg > 7:136021/1‑149 (MQ=255) ccTGGGGCAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAgg > 1:259273/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGTGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTCCTGa > 4:307432/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCaa < 1:92900/141‑1 (MQ=255) gCAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCaa > 2:92900/1‑141 (MQ=255) cAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGTGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGAt < 3:307432/149‑1 (MQ=255) cAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGAt < 6:209001/149‑1 (MQ=255) cAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGAt < 2:80716/149‑1 (MQ=255) aGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGc < 3:106018/149‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCt < 5:365759/149‑1 (MQ=255) cTGGTTTTGCGGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGGTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTTTATTCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGAGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTc < 6:215973/149‑1 (MQ=255) gTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCg < 2:203228/148‑1 (MQ=255) gTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCg < 8:136021/148‑1 (MQ=255) gAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGc < 4:79150/149‑1 (MQ=255) aaGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCg > 1:362103/1‑147 (MQ=255) cgAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCt > 4:274169/1‑149 (MQ=255) gAAGGGCTGACGACGTGGCTGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGTTTGCCGCCGTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCtt < 3:239268/149‑1 (MQ=255) gggCTGACGACGTGCCAGTCGGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGCTTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCGCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGAGGCTTTGa < 6:160209/149‑1 (MQ=255) tGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATAcc > 1:347243/1‑149 (MQ=255) acgacgTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCca < 2:347243/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCAGCAGACGC‑TTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGa > 5:94555/1‑149 (MQ=255) gCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGa > 5:200931/1‑92 (MQ=255) gCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGa < 6:200931/92‑1 (MQ=255) gCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATc < 2:362103/147‑1 (MQ=255) ttGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAg > 1:172859/1‑148 (MQ=255) aTGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCAt < 2:259273/148‑1 (MQ=255) tGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTa > 4:110683/1‑149 (MQ=255) gcgacTTTATTGCCGGCCCGGCGGTAACCTTGTATGCAGCGACGCAACTTCCCGCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTTCTGCTGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGCAGGGTTAGCATGATCACGCATTAc < 2:95614/144‑1 (MQ=255) gCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCCGCGAGGGCATTTGCGtcgctgcatacaacgttacccccagggcggcaatcaaggcgacatcaagccagttccagcctggcacgtcgtcagcccttcgcgccttc < 3:282577‑M2/140‑90 (MQ=255) gCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGAGGGCATTTGCGtcgctgcatacaacgttacccccagggcggcaatcaaggcgacatcaagccagttccagcctggcacgtcgtcagcccttcgcgccttc > 4:282577‑M2/1‑51 (MQ=255) cTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTgg > 1:342943/1‑148 (MQ=255) gATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGAAACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAg < 1:76040/148‑1 (MQ=255) aTTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGc > 3:137938/1‑149 (MQ=255) ccgccCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTgg > 3:121837/1‑149 (MQ=255) gCAGCGACGCAAATGCCCtcgctgcatacaacgttacccccagggcggcaatcaaggcgacatcaagc > 1:304207‑M2/1‑18 (MQ=255) gCAGCGACGCAAATGCCCtcgctgcatacaacgttacccccagggcggcaatcaaggcgacatcaagc < 2:304207‑M2/68‑51 (MQ=255) gCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGCACTGGCCt < 1:260383/132‑1 (MQ=255) gCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGCACTGGCCt > 2:260383/1‑132 (MQ=255) cGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGCACTGGCCTGCGTGCTACCGGTAGCAATgg < 4:121837/149‑1 (MQ=255) gCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGCACTGGCCTGCGTGCTACCGGTAGCAATGGc > 8:13828/1‑149 (MQ=255) aaaTGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGCACTGGCCTGCGTGCTACCGGTAGCAATGGCg > 6:80316/1‑148 (MQ=255) ccTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGTACTGGCCTGCGTGCTACCGGTAGCAAt > 3:338740/1‑138 (MQ=255) ccTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGTACTGGCCTGCGTGCTACCGGTAGCAAt < 4:338740/138‑1 (MQ=255) ccTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGCACTGGCCTGCGTGCTACCGGTa > 5:305651/1‑133 (MQ=255) ccTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGCACTGGCCTGCGTGCTACCGGTa < 6:305651/133‑1 (MQ=255) ccTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGCACTGGCCTGCGTGCTACCGGTAGCAATGGCGGACGAt > 3:133032/1‑148 (MQ=255) ccTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGCACTGGCCTGCGTGCTACCGGTAGCAATGGCGGACGAt > 4:170174/1‑148 (MQ=255) cTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCAt > 3:114416/1‑93 (MQ=255) cTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCAt < 4:114416/93‑1 (MQ=255) | TGGTAGCGATGGTGGTGTTTTGCCTGGGGCAAGCCTGGTTTTGCTGGAAGGCGCGAAGGGCTGACGACGTGCCAGGCTGGAACTGGCTTGATGTCGCCTTGATTGCCGCCCTGGGGGTAACGTTGTATGCAGCGACGCAAATGCCCTCGCTGCGCTTCGAGCCAGGCAAGGTGCTGATGCCTCCGGAGCAGCCGCAGACGCTTTGATACCCACAAGGAGGGTTAGCATGATCAAGCATTACCTGGCAGGCCTGGCACTGGCCTGCGTGCTACCGGTAGCAATGGCGGACGAT > NC_002947/959530‑959821 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |