New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1221777 | 59 (1.040) | 8 (0.150) | 7/248 | NT | 11.9% | coding (1433/1908 nt) | PP_1067 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | = 1221820 | 62 (1.150) | coding (1390/1908 nt) | PP_1067 | sensor histidine kinase |
GCTGGTCCTCGAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCAGTGGCTGGTTCAGCTCGTGGGCAATGCTGGTG > NC_002947/1221673‑1221968 | gCTGGTCCTCGAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATg < 4:114753‑M2/149‑2 (MQ=255) cTGGGCCTCGAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATgc > 6:332212‑M2/1‑147 (MQ=255) gTCCTCGAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATgcggc > 5:18854‑M2/1‑144 (MQ=255) ccTCGAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGccc < 3:226655/149‑1 (MQ=255) cTCGAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCa > 1:24541/1‑149 (MQ=255) cTCGAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCa > 1:94232/1‑149 (MQ=255) cTCGAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCa > 4:208413/1‑149 (MQ=255) cTCGAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCa < 5:151876/149‑1 (MQ=255) gAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATg < 3:42969/148‑1 (MQ=255) gAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATg < 3:114753/148‑1 (MQ=255) gtgCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGAt > 2:224895/1‑147 (MQ=255) cAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAgg < 4:132416/148‑1 (MQ=255) aTTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGtca < 4:306557/149‑1 (MQ=255) cAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGtcattc < 1:224895/148‑1 (MQ=255) aaTGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATg < 3:305394/149‑1 (MQ=255) aaTGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATg < 2:64345/149‑1 (MQ=255) tGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGt < 2:94232/149‑1 (MQ=255) tGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGt > 2:189832/1‑149 (MQ=255) gCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAg > 5:255675/1‑149 (MQ=255) gCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTCGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCGGGGCGAACGAGCGAAGGATCGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATCGTGCGCac > 4:334588/1‑148 (MQ=255) tGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTg > 6:220230/1‑149 (MQ=255) aTGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTg < 6:255675/147‑1 (MQ=255) cGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCt > 1:154663/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTgg < 1:189832/149‑1 (MQ=255) ttGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGc > 7:173896/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑gg > 6:349006/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGtt > 3:37090/1‑149 (MQ=255) cAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGAt < 8:254762/111‑1 (MQ=255) cAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGAt > 7:254762/1‑111 (MQ=255) aGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTc < 2:154663/149‑1 (MQ=255) aCCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAg > 8:312423/1‑149 (MQ=255) ccTGCAGGTTTGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAATCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCTGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCAATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTGGGTGCTGGC‑GGTTTCCAgc < 8:95707/149‑1 (MQ=255) cTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAgcg > 8:322900/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCTTGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCcgc > 8:29777/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCcgc > 3:59155/1‑149 (MQ=255) gCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAgg < 8:161398/99‑1 (MQ=255) gCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAgg > 7:161398/1‑99 (MQ=255) ctctACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCTGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGa < 3:334588/149‑1 (MQ=255) ctctACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGa < 2:24541/149‑1 (MQ=255) cTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAg > 8:10946/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAgcg > 6:61409/1‑148 (MQ=255) ttGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCAc > 8:172515/1‑149 (MQ=255) ggCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTg > 3:101713/1‑149 (MQ=255) ggCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTAATGGAGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTg > 3:217375/1‑149 (MQ=255) gCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTg > 3:195049/1‑148 (MQ=255) gCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGt < 4:101713/149‑1 (MQ=255) aGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTAtt < 7:312423/149‑1 (MQ=255) gAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCTTGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGc < 7:29777/148‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAg > 1:233123/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATgcggccaggcttcactggccaaggcagtagaggccaccctgcaggagctggccaaccgcatcagtgcctgtcatttgcaattgc > 4:274079‑M2/1‑52 (MQ=255) ccTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATgcggccaggcttcactggccaaggcagtagaggccaccctgcaggagctggccaaccgcatcagtgcctgtcatttgcaattgc < 3:274079‑M2/136‑85 (MQ=255) ccTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGa > 6:80034/1‑148 (MQ=255) cTGGCTGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGaaa < 4:59155/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATgcggccaggcttcactggccaaggcagtagaggccaccctgcaggtgctggccaaccgcatcagtgcctgtcatttgcaattgcaccaccagttcgag < 1:85676‑M2/149‑99 (MQ=255) cTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGaaa < 3:208413/149‑1 (MQ=255) tGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGATCGAGCGAAGGCTGGCGGTGATgcggcgaggcttcactggccaaggcagtagaggccaccctgcaggtgctggccatccgcatcagtgcctgtgatttgcaattgcaccagcagttcgcg < 7:90450‑M2/148‑99 (MQ=255) tGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATgcggccaggcttcactggccaaggcagtagaggccaccctgcaggtgctggccaaccgcatcagtgcctgtcatttgcaattgcaccaccagttcgag < 8:147470‑M2/148‑99 (MQ=255) gCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATgcggccaggcttcactggccaaggcagtagaggccaccctgcaggtgctggccaaccgcatcagtgcctgtcatttgcaattgcaccacgagttcgagga > 7:147470‑M2/1‑48 (MQ=255) gCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATgcggccaggcttcactggccaaggcagtagaggccaccctgcaggtgctggccaaccgcatcagtgcctgtcatttgcaattgcaccaccagttcgaggac < 1:241767‑M2/149‑102 (MQ=255) gCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGCGGGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAgg < 1:261790/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTGGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAggg > 5:323444/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGGCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGt < 5:349006/149‑1 (MQ=255) cTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTgcg < 5:61409/149‑1 (MQ=255) ccgcgccgGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCgcagcgcagc < 6:62928/149‑1 (MQ=255) cgcgccgGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGcc < 8:173896/149‑1 (MQ=255) gcgccgGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCa < 6:323444/149‑1 (MQ=255) ccgGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATgcggccaggcttcactggccaaggcagtagaggccaccctgcaggtgctggccaaccgcatcagtgcctgtcatttgcaattgcaccaccagttcgaggaccagcaactggccatcgac > 2:241767‑M2/1‑30 (MQ=255) ggCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCAGTGGCt < 7:322900/149‑1 (MQ=255) gCGAACGAGCGAAGGCTGGCGTTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGCTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTgcgcag > 4:93628/1‑134 (MQ=255) gCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTgcgcag < 3:93628/134‑1 (MQ=255) aaCGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCAGTGGCTGGtt < 4:37090/149‑1 (MQ=255) gAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCgcagcgcagc < 6:233608/134‑1 (MQ=255) gAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCgcagcgcagc > 5:233608/1‑134 (MQ=255) gAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCAGTGGCTGGTTCAg > 5:187919/1‑149 (MQ=255) gCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCgcagcgcagc < 7:257352/132‑1 (MQ=255) gCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCgcagcgcagc > 8:257352/1‑132 (MQ=255) aaGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCAGTGGCTGGTTCAGCTCGt > 4:80242/1‑149 (MQ=255) ggCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCAGTGGCTGGTTCAGCTCGTgg < 5:220230/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCAGTGGCTGGTTCAGCTCGTgg < 6:15567/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCAGTGGCTGGTTCAGCTCGTggg < 4:195049/149‑1 (MQ=255) gTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCAGTGGCTGGTTCAGCTCGTGGGCAATGCt > 5:230313/1‑149 (MQ=255) tGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCAGTGGCTGGTTCAGCTCGTGGGCAATGCtggtg < 5:80034/149‑1 (MQ=255) | GCTGGTCCTCGAACTGGTGGTGCAATTGCAAATGACAGGCACTGATGCGGTTGGCCAGCACCTGCAGGGTGGCCTCTACTGCCTTGGCCAGTGAAGCCTGGCCGCTGTCATCGCCGCGCCGGGCGAACGAGCGAAGGCTGGCGGTGATGCGGCCCATGCGGTCGATCAGGTCATTCATGGTGCGCAGGTTGGTGCTGGC‑GGTTTCCAGCGCCCCGCGCTCGAGGAAGCGCACTGTATTGCCAGAAAGGGTGCGCAGCGCAGCCAGTGGCTGGTTCAGCTCGTGGGCAATGCTGGTG > NC_002947/1221673‑1221968 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |