| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2344137 = | 84 (1.480) | 5 (0.100) | 5/240 | NT | 5.8% | coding (169/456 nt) | soxR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 2344209 = | 86 (1.640) | coding (97/456 nt) | soxR | DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TTGCTGTTGGGGGCATAACGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGAGCTTTTATAAGCCGGCCCGGTCGGC > NC_002947/2344061‑2344356 | atgctcacagcgggtgaagtggccaagcgcagcggcgtggcggtgtctgcgctgcacttctacgaaaccaaggggcTGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAg > 6:63110‑M1/77‑149 (MQ=255) tgctcacagtgggtgaagtggccaagcgcagcggcgtggcggtgtctgcgctgcacttctacgaaaccaaggggcTGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGc > 6:38357‑M1/76‑149 (MQ=255) gCTGTTGGGGGCATAACGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGcc > 2:98601/1‑149 (MQ=255) gTTGGGGGCATAACGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCt > 5:241412/1‑149 (MQ=255) gggggCATAACGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTg < 6:128866/148‑1 (MQ=255) gggggCATAACGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTg < 3:68848/148‑1 (MQ=255) ggCATAACGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGttt > 2:38727/1‑149 (MQ=255) gCATAACGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTc < 3:41183/149‑1 (MQ=255) cATAACGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCg > 1:162919/1‑149 (MQ=255) tAACGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGGGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTa < 2:226173/149‑1 (MQ=255) tAACGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTa < 7:300093/149‑1 (MQ=255) aaCGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCTGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCg > 1:91022/1‑146 (MQ=255) aaCGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCg > 8:106544/1‑146 (MQ=255) aaCGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCg > 2:261283/1‑146 (MQ=255) cGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAg > 7:140661/1‑147 (MQ=255) cGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGaa < 5:32307/149‑1 (MQ=255) gCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAgcg > 5:90242/1‑148 (MQ=255) ttGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAgcg > 6:46630/1‑146 (MQ=255) tttGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGaca > 1:248104/1‑149 (MQ=255) aTTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGc > 7:217450/1‑149 (MQ=255) cTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCAcgc > 2:26529/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCAcgcc > 4:98872/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCAcgcc > 6:188134/1‑149 (MQ=255) gCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTg > 5:16040/1‑149 (MQ=255) gCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCATGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTg > 1:8828/1‑149 (MQ=255) ggAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCAcgcc > 4:321083/1‑143 (MQ=255) ttCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAAACACCGCCACGCCGCTGCGCTTg < 6:286851/149‑1 (MQ=255) cccGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTgg < 4:75466/148‑1 (MQ=255) ccGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTgcgc > 4:90353/1‑143 (MQ=255) ccGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTgcgc < 3:90353/143‑1 (MQ=255) ccGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGc > 8:178096/1‑148 (MQ=255) cGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCa > 5:278690/1‑149 (MQ=255) gcTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCa > 5:327609/1‑149 (MQ=255) 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8:217450/148‑1 (MQ=255) cTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGa < 5:188134/149‑1 (MQ=255) cTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGa < 3:98872/149‑1 (MQ=255) gctgatcgccagcgtccgcacggctggcaaccagcgccgctatccctcgctggtgctgcgtaccctggcgatcaGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCa > 6:38357‑M2/75‑149 (MQ=255) ctgatcgccagcgtccgcacggctggcaaccagcgccgctatccctcgctggtgctgcgtaccctggcgatcaGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCGCTGTGAGCAt > 6:63110‑M2/74‑149 (MQ=255) GATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATcc < 6:187026‑M1/149‑1 (MQ=255) 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GCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCgtgt > 3:225588‑M1/1‑149 (MQ=255) CCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCTGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGa > 5:172629‑M1/1‑138 (MQ=255) CCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATccgtgag < 4:666‑M1/149‑3 (MQ=255) CCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGACACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGa < 6:172629‑M1/138‑1 (MQ=255) CAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCAc < 4:293564‑M1/123‑1 (MQ=255) CAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCAc > 3:293564‑M1/1‑123 (MQ=255) 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aGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGtt < 3:143496/149‑1 (MQ=255) gATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGa > 6:279078/1‑149 (MQ=255) gATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGa < 7:157957/149‑1 (MQ=255) cggcgCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGGTGTCCGCTGCCAGATATGTTCGAccaa > 8:274427/1‑146 (MQ=255) cggcgCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGACCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCGTGGCCACTTCACCCACGTTTAGCCTCGGTGTGTTGGCAGATACCAGAAATGTTCGAccga > 4:287213/1‑146 (MQ=255) ggcgCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTaaa < 1:144577/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAaag > 3:132711/1‑149 (MQ=255) cgcTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAaagt > 3:283450/1‑149 (MQ=255) gTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAaagttaa < 2:162919/147‑1 (MQ=255) gTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAaagttaa < 2:340778/147‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAaagttaagtt < 2:8828/149‑1 (MQ=255) ccAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCCCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGAg < 2:248104/149‑1 (MQ=255) cAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGAGc < 3:237823/149‑1 (MQ=255) cAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGAGc > 4:182014/1‑149 (MQ=255) cGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGAGCtttt < 7:94368/149‑1 (MQ=255) ctgcgtaccctggcgatcaGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGAGCTTTta < 6:265015‑M2/130‑1 (MQ=255) tGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGAGCTTTtat < 4:264292/149‑1 (MQ=255) cGGACGCTGGCGATCTGCCCCTTGGTTTGGTAGATGTGCAGCGCAGAAACGGCCACGCCGATGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGTGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTCCGACCTAAAGTTAAGTTGAGCTTTTATaa < 1:26529/149‑1 (MQ=255) caCGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGAcc < 6:291957/122‑1 (MQ=255) gCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGAGCTTTTATAAGCCgg > 5:243187/1‑149 (MQ=255) tggcgatcaGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGAGCTTTTATAAGCCg > 8:251535‑M2/10‑146 (MQ=255) gcgatcaGCCCCTAGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGCGCTTTTATtagccgtcagg > 6:251021‑M2/8‑144 (MQ=255) caGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGAGCTTTTATAAGCCGGCCCGGTCgg > 2:11738‑M2/3‑149 (MQ=255) aGCCCCTTGGTTACGTAGAAGTGCAGCGCAGACACAGCCACGACCATGCGATTGGACACTTCACACACTGTGAACATCCGTATTTAGTAATCTGCAATATATGTTCTACATAAAATAAAGTAGATATATTATAAGCCTGCCCggacagc > 8:142353/1‑144 (MQ=255) | TTGCTGTTGGGGGCATAACGGCTGAAGGCTTGTTTGATTTCCTCAAGCGGAATTCCCGTGCGCTGGGCTACCTTGATGATCGCCAGGGTACGCAGCACCAGCGAGGGATAGCGGCGCTGGTTGCCAGCCGTGCGGACGCTGGCGATCAGCCCCTTGGTTTCGTAGAAGTGCAGCGCAGACACCGCCACGCCGCTGCGCTTGGCCACTTCACCCACTGTGAGCATCCGTGTGTTGTCCGCTGCCATATATGTTCGACCTAAAGTTAAGTTGAGCTTTTATAAGCCGGCCCGGTCGGC > NC_002947/2344061‑2344356 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |