New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3451460 = | 49 (0.860) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 7.5% | coding (1987/2478 nt) | PP_3069 | outer membrane autotransporter |
? | NC_002947 | 3451513 = | 52 (0.970) | coding (1934/2478 nt) | PP_3069 | outer membrane autotransporter |
GCGCCAGCGCTCGGACAGGGTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATGGCTTACGTAGATACCAACATGCTGGCG > NC_002947/3451365‑3451658 | aaagggtttgccctggccgttcacgaccgcagcgtgggcgacctgaagctcgatggcgatagcgtgggcacctactggacgctggtcgggccacaGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑Ct > 7:153904‑M1/96‑149 (MQ=255) gcCAGCGCTCGGACAGGGTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑Ctgt < 2:341338/149‑1 (MQ=255) ggtttgccctggccgttcacgaccgcagcgtgggcgacctgaagctcgatggcgatagcgtgggcacctactggacgctggtcgggccacaGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTgg > 1:201235‑M1/92‑149 (MQ=255) cAGCGCTCGGACAGGGTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑Ctgtg < 6:241877/148‑1 (MQ=255) cAGCGCTCGGACAGGGTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑Ctgtg > 5:241877/1‑148 (MQ=255) gcTCGGACAGGGTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGccc > 8:76791/1‑148 (MQ=255) cTCGGACAGGGTGTTGGCGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGGCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACTCCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGa < 1:26604/149‑1 (MQ=255) cTCGGACAGGGTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACNCCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGa < 1:31975/149‑1 (MQ=255) ggACAGGGTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGAc > 8:264716/1‑147 (MQ=255) gACAGGGTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAg > 2:59293/1‑149 (MQ=255) aCAGGGTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGc < 3:65755/149‑1 (MQ=255) gggTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTc < 7:264716/149‑1 (MQ=255) ggTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTc < 2:314048/148‑1 (MQ=255) ggataggggTAGCCCGATGCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCa < 1:306284/144‑1 (MQ=255) gTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCa < 3:331685/149‑1 (MQ=255) gTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTACAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGc < 6:183193/149‑1 (MQ=255) cccGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCAc > 1:8526/1‑149 (MQ=255) aGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGc > 3:54777/1‑148 (MQ=255) aGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGc > 3:50011/1‑148 (MQ=255) gAAGCTGTCCCGGCGTGGCCGTCGAGGTTCCGCGGGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCCTCCCGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTCCGCGCC‑CTGTGGCCCGCCCAGCGTCCCGTAGGGGCCCACGCGCTCGCCagc > 3:211455/1‑147 (MQ=255) gAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATc > 3:206976/1‑149 (MQ=255) aaGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATc < 4:260646/148‑1 (MQ=255) aGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGa > 6:227976/1‑141 (MQ=255) aGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGa < 5:227976/141‑1 (MQ=255) aGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAgg < 7:76791/149‑1 (MQ=255) cGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACg > 8:152229/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGc > 1:325458/1‑149 (MQ=255) tCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCt > 4:129119/1‑149 (MQ=255) cgaGCGTGGCGACACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCCCGCTG‑CGGTCg > 2:285803/3‑149 (MQ=255) catcGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCAGCCCGTCGGGGTTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTCTCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGt < 4:211455/146‑1 (MQ=255) aGCGTGTAGCCACTCTCGGAGCGTGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGt < 4:206976/148‑1 (MQ=255) ccACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGcc < 6:144222/147‑1 (MQ=255) ccACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGcc > 5:144222/1‑147 (MQ=255) cACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAgg > 4:97538/1‑149 (MQ=255) gCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCTGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAg < 7:188009/86‑1 (MQ=255) gCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAg > 8:188009/1‑86 (MQ=255) ggAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCTACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCaaa < 4:54777/147‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCaaa < 4:50011/147‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCaaa < 7:152229/147‑1 (MQ=255) gAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CCGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACg > 4:199635/1‑120 (MQ=255) gAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CCGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACg < 3:199635/120‑1 (MQ=255) ccacagggcgcgtacctggacgcggtgttgcaatacacccgcctggatggccgcgcccTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAAcc > 1:201235‑M2/59‑149 (MQ=255) agggcgcgtacctggacgcggtgttgcaatacacccgcctggatggccgcgcccTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCttt > 7:153904‑M2/55‑149 (MQ=255) gggcgcgtacctggacgcggtgttgcaatacacccgcctggatggccgcgcccTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTg < 2:201235‑M2/96‑1 (MQ=255) GGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGa > 2:8526‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCgg < 3:129119/149‑1 (MQ=255) cATCAAGGCGGGTGTATTGCAACACCCCTTCCATGTACGCGCC‑ATGTGGCCCGCCCCGCGTCCAGTAGGTGCCAACGCAATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGACCGGCAAGGGCAAACCCTTTGACGTCTGCg > 5:155350/1‑149 (MQ=255) aGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAg > 6:4495/1‑149 (MQ=255) acgcggtgttgcaatacacccgcctggatggccgcgcccTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAg < 8:153904‑M2/110‑1 (MQ=255) gctggTGTATTGCAACACCGCGGCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGAGCAGCGTCCAGTAGGTGCCCCCGCTATCGCCATCGATCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAAGCCTTTGACGTCGGCGTCCTggc < 6:155350/146‑1 (MQ=255) ttGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCCGCTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATgg > 1:15591/1‑149 (MQ=255) ttGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATGGc < 1:59293/149‑1 (MQ=255) ttGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATGGc > 3:36273/1‑149 (MQ=255) ttGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGGGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAATCCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATgg < 6:272667/148‑1 (MQ=255) cAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑c > 6:21933/1‑92 (MQ=255) aaCTCCGCGTCCAGGTACGAGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCAGGCTATCGCCTTCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGc < 8:157487/128‑1 (MQ=255) aaCACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGc > 7:162234/1‑128 (MQ=255) aaCACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGc < 8:162234/128‑1 (MQ=255) aaCACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGAGGCTATGGCTTAc > 5:219740/1‑149 (MQ=255) aaCACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCAGACCAGACTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGc > 7:157487/1‑128 (MQ=255) cacCGCGTCCATGGACGCGGC‑CTGTGGCCCGTCCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGGCCACGCTGTTGGTCGTGAACGGCCAGGGTAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATGGCTTACg < 1:285803/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATGGCTTACGTAGATAc > 7:304869/1‑148 (MQ=255) aGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATGGCTTACGTAGATACCAAc < 2:53844/149‑1 (MQ=255) aGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATGGCTTACGTAGATACCAAc < 3:97538/149‑1 (MQ=255) tACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATGGCTTACGTAGATACCAACATg < 4:36273/149‑1 (MQ=255) cccTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATGGCTTACGTAGATACCAACATGCTGGCg < 2:117137‑M2/146‑1 (MQ=255) ccTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTc > 5:86380‑M2/3‑73 (MQ=255) ccTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTc < 6:86380‑M2/71‑1 (MQ=255) | GCGCCAGCGCTCGGACAGGGTGATGGGGTAGCCCGATTCCAGTGAAGCTGTCCAGGCGTGGCCGTCGAGGTTCAGCGTGTCGCCACGCTCGGAGCGGGCGCGGCCATCCAGGCGGGTGTATTGCAACACCGCGTCCAGGTACGCGCC‑CTGTGGCCCGACCAGCGTCCAGTAGGTGCCCACGCTATCGCCATCGAGCTTCAGGTCGCCCACGCTG‑CGGTCGTGAACGGCCAGGGCAAACCCTTTGACGTCGGCGTCCAGGCGGCTATGGCTTACGTAGATACCAACATGCTGGCG > NC_002947/3451365‑3451658 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |