New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3852476 | 48 (0.850) | 6 (0.110) | 5/242 | NT | 10.9% | intergenic (+22/‑137) | PP_3399/alkB | minor curlin subunit CsgB/alpha‑ketoglutarate‑ and Fe(II)‑dependent dioxygenase |
? | NC_002947 | = 3852493 | 53 (1.010) | intergenic (+39/‑120) | PP_3399/alkB | minor curlin subunit CsgB/alpha‑ketoglutarate‑ and Fe(II)‑dependent dioxygenase |
ACAAGGCGTTCGTCGACCAGAGTGGTGTCGCCCAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATCCAGTCCGACCTCGACCTGTT > NC_002947/3852363‑3852638 | acaaGGCGTTCGTCGACCAGAGTGGTGTCGCCCAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCACGGTTCCTTTTTCTg < 1:151198/149‑1 (MQ=255) ataGGCGTGCGACGAGCAGAGTTGTTTCGCCCAAGAGGCCCCCATCACCCAGCTGCGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCt < 4:215297/145‑1 (MQ=255) gtcgACCAGAGTGGTGTCGCCCAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGccc > 5:333239/1‑149 (MQ=255) gACCAGAGTGGTGTCGCCCAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCctct < 5:187136/149‑1 (MQ=255) aCCAGAGTGGTGTCGCCCAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGAAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCACGCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTg > 2:135673/1‑149 (MQ=255) gagTGGTGTCGCCCAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCa > 8:20695/1‑148 (MQ=255) gagTGGTGTCGCCCAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCAt > 7:279206/1‑149 (MQ=255) ggtgTCGCCCAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGtt < 2:276297/149‑1 (MQ=255) gtgtCGCCCAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTc < 7:315296/149‑1 (MQ=255) gCCCAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATcc > 3:264615/1‑149 (MQ=255) cccAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATc < 4:68314/124‑1 (MQ=255) cccAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATc > 3:68314/1‑124 (MQ=255) tCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATccggccgg > 2:162871/1‑149 (MQ=255) gCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGcc > 2:167364/1‑128 (MQ=255) gCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGcc < 1:167364/128‑1 (MQ=255) aTCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTaa > 8:139754/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATc < 8:18040/148‑1 (MQ=255) gCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGa < 5:89552/149‑1 (MQ=255) ggCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACgtg > 5:63531/1‑149 (MQ=255) aGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAg < 7:20695/149‑1 (MQ=255) gAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTc < 1:162871/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCCACTGTTACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCGTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGGGTAGCTGTCgg < 1:135673/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCggg < 6:118983/149‑1 (MQ=255) ggCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTa > 6:28494/1‑148 (MQ=255) gCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTAc < 7:139754/148‑1 (MQ=255) cACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAAt > 7:21154/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCaaa < 5:28494/148‑1 (MQ=255) aCCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAAc > 6:134532/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCAGCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAAccc > 8:189542/1‑148 (MQ=255) cagcagTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACgtg < 8:60262/122‑1 (MQ=255) cagcagTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACgtg > 7:60262/1‑122 (MQ=255) cagcagTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGAAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGc > 1:134273/1‑149 (MQ=255) agTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCg > 5:110653/1‑148 (MQ=255) gTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGaa < 5:134532/149‑1 (MQ=255) tAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCg > 2:272663/1‑146 (MQ=255) cccTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCca < 8:21154/149‑1 (MQ=255) tgttGAAGAGCTGTGCTCCTGTCCGTGGTGGCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGGCCTCTGCCATGGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCGCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACATTGGCAAACGGCTGGAAGTTGTGCAGCcac < 6:63531/147‑1 (MQ=255) ccTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGccgcggttcaagggggagcggtttactgctgggtcacagtggccaggttcgcgctgcccagctgggtgatggtggcggattgggcgacaccactctggtc < 6:167264‑M2/130‑101 (MQ=255) ccTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGccgcggttcaagggggagcggtttactgctgggtcacagtggccaggttcgcgctgcccagctgggtgatggtggcggattgggcgacaccactctggtc > 5:167264‑M2/1‑30 (MQ=255) cTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGccgcggttcaagggggagcggtttactgctgggtcacagtggccaggttcgcgctgcccagctgggtgatggtggcggattgggcgacaccactctggtc > 2:39417‑M2/1‑29 (MQ=255) cTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGccgcggttcaagggggagcggtttactgctgggtcacagtggccaggttcgcgctgcccagctgggtgatggtggcggattgggcgacaccactctggtc < 1:39417‑M2/129‑101 (MQ=255) cTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCcaca > 2:234167/1‑149 (MQ=255) cTTGAACAGCGGACCTCCTCACCCTGGAGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTAATCCCGACCTCTGCCATCGTTAGATCCGGCATGCGCGTCTAATCCACTGACCATTAGCTGTCTGGTACAATGGCAAACCGAACGAAGATATGAAGCcaca > 2:225807/1‑149 (MQ=255) ttGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGccgcggttcaagggggagcggtttactgctgggtcacagtggccaggttcgcgctgcccagctgggtgatggtggcggattgggcgacaccactctggtcgacgaacgccttgttgctttg < 3:54245‑M2/149‑122 (MQ=255) ttGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACAt > 3:267961/1‑149 (MQ=255) aaCCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGa < 6:333239/148‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCGCTCTGCCATCGGTCGAGCCGGCCGGCGAGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATc < 8:315029/149‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATc < 3:13399/149‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATc < 4:264615/149‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATc > 4:13399/1‑149 (MQ=255) ccGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATcc < 8:279206/149‑1 (MQ=255) cgcgGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCa < 6:224177/136‑1 (MQ=255) cgcgGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCa > 5:224177/1‑136 (MQ=255) cgGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGANTATGNTCAGCCACATGATCCAg > 6:20572/1‑148 (MQ=255) gTGCTCCTCTCCCTGGTGccgcggttcaagggggagcggtttactgctgggtcacagtggccaggttcgcgctgcccagctgggtgatggtggcggattgggcgacaccactctggtcgacgaacgccttgttgctttggcctccctgg > 4:54245‑M2/1‑18 (MQ=255) tcCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATCCAGTCcgacctcgac > 3:26336/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATCCAGTCcgacctcgac < 6:110653/147‑1 (MQ=255) ccTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATCCAGTCcgacctcga < 1:272663/146‑1 (MQ=255) ccTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATCCAGTCcgacctcga < 1:234167/146‑1 (MQ=255) ggTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGACATCGTTCGATCCGGCAGGCGCGTGTACTCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTAAAATGGCAACCCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATCCAGGCAGACCTCGACATGtt > 6:30688/1‑149 (MQ=255) | ACAAGGCGTTCGTCGACCAGAGTGGTGTCGCCCAATCCGCCACCATCACCCAGCTGGGCAGCGCGAACCTGGCCACTGTGACCCAGCAGTAAACCGCTCCCCCTTGAACCGCGGTGCTCCTCTCCCTGGTGCCGCGGTTCCTTTTTCTGTCATCCCGCCCTCTGCCATCGTTCGATCCGGCCGGCGCGTGTAATCCCCTGACGTGTAGCTGTCGGGTACAATGGCAAACCGCTCGAAGATGTGCAGCCACATGATCCAGTCCGACCTCGACCTGTT > NC_002947/3852363‑3852638 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |