New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 422593 | 58 (0.990) | 3 (0.050) | 3/242 | NT | 5.2% | coding (1355/2787 nt) | PP_0348 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 422635 | 55 (1.000) | coding (1313/2787 nt) | PP_0348 | hypothetical protein |
AACACTGCGCGCACCCAGTTGTAGCCATGTTCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCGGGCAGTCAGCCAGTAGTCGGTATCGAA > NC_002947/422446‑422741 | aaCACTGCGCGCACCCAGTTGTAGCCATGTTCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACtgat < 1:145327/149‑1 (MQ=255) cgcgcACCCAGTTGTAGCCATGTTCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTgg < 2:246998/149‑1 (MQ=255) aCCCAGTTGTAGCCATGTTCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGtgtg > 6:7729/1‑149 (MQ=255) cccAGTTGTAGCCATGTTCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGtgtg > 1:325161/1‑148 (MQ=255) ccAGTTGTAGCCATGTTCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGtgtg > 2:211705/1‑147 (MQ=255) tAGCCATGTTCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACtt > 1:170484/1‑149 (MQ=255) cATGTTCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCg > 2:44084/1‑149 (MQ=255) aTGTTCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGTGGCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCg > 1:291560/1‑149 (MQ=255) ttCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAgg < 8:145668/136‑1 (MQ=255) ttCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAgg > 7:145668/1‑136 (MQ=255) ttCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGc > 2:129574/1‑149 (MQ=255) gAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCCCGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGGGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGt > 3:237763/1‑149 (MQ=255) gAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGt > 3:223640/1‑149 (MQ=255) gAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGt > 7:218846/1‑149 (MQ=255) gAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGt > 7:184214/1‑149 (MQ=255) tCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCAc < 5:239283/149‑1 (MQ=255) ttCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGAacgtgggtgacagctacgcaaagtacctgcacacccaactca > 1:236611‑M1/1‑107 (MQ=255) cGCCAATGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTGTACTGCTTCAGCGT‑GAATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTTCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGAGTAGCTGTCA‑CCCACGTt > 4:223640‑M2/1‑147 (MQ=255) cGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGt < 5:7729/147‑1 (MQ=255) gCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTtca > 2:325161‑M2/1‑146 (MQ=255) ccAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTtcag < 8:198136‑M2/149‑5 (MQ=255) aGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGAacgtgggtgacagctacgcaaagtacctgcacacccaactcatcagttcc < 3:126273‑M1/149‑51 (MQ=255) gtgtCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTCCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTccc < 7:198136/149‑1 (MQ=255) gtgtCCGGCGTAGAGCGCCTAGACTGGTGCAGCGT‑GCAGGCGTTCACGGTTGACCTCGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTccc < 6:380396/149‑1 (MQ=255) tCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGAacgtgggtgacagctacgcaaagtacctgcacacccaactcatcagttccaga < 2:236611‑M1/148‑54 (MQ=255) cgcgcCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCtt < 5:112929/149‑1 (MQ=255) gACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCACCCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACAt < 1:44084/147‑1 (MQ=255) accGT‑GCACGCATGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGt > 5:318008/3‑147 (MQ=255) cGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCAt > 8:340757/1‑124 (MQ=255) cGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCAt < 7:340757/124‑1 (MQ=255) aTGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCt > 6:300502/1‑92 (MQ=255) aTGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCt < 5:300502/92‑1 (MQ=255) aTGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCcggc > 1:349170/1‑149 (MQ=255) gCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCcggcgg > 4:39175/1‑149 (MQ=255) cACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGACATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCAt < 1:332484/148‑1 (MQ=255) aCGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATgg < 2:291560/149‑1 (MQ=255) cGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAg < 4:48432/81‑1 (MQ=255) cGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAg > 3:48432/1‑81 (MQ=255) cGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGc < 6:336166/149‑1 (MQ=255) gTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCtt > 6:187096/1‑149 (MQ=255) ttGAGCTTGCTGTGCGCATGCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCGTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCttt < 4:237763/149‑1 (MQ=255) ccTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCg > 7:321936/1‑149 (MQ=255) ccTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCg > 7:149736/1‑149 (MQ=255) ccTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCg > 7:284912/1‑149 (MQ=255) ccTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCg > 4:71926/1‑149 (MQ=255) ccTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCg > 4:367540/1‑149 (MQ=255) cTTGCTGTGCACAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCa < 5:193482/59‑1 (MQ=255) cTTGCTGTGCACAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCa > 6:193482/1‑59 (MQ=255) gCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTgg < 2:170484/148‑1 (MQ=255) gCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTgg < 3:71926/148‑1 (MQ=255) cTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTggg < 6:318008/148‑1 (MQ=255) tgCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCAt < 8:284912/148‑1 (MQ=255) tgCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATg > 5:214891/1‑149 (MQ=255) cgcAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGa < 6:214891/149‑1 (MQ=255) cgcAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGa < 8:321936/149‑1 (MQ=255) tCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCACGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCAcc > 2:301944/1‑149 (MQ=255) aGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCg < 3:367540/149‑1 (MQ=255) aGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCg > 3:267102/1‑149 (MQ=255) cgcCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCggg > 5:136590/1‑148 (MQ=255) aTTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCGGGCAGTc < 8:149736/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCGGGCAGTCAGCCa < 1:129574/149‑1 (MQ=255) tGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCGGGCAGTCAGCCag > 2:126480/1‑148 (MQ=255) tctGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTtcagttccagagcaggcaaatggcgcctgactgcgcacagcaaggtcaaccgtgcacgcatgcacgctgaagcagtcaaggcgcgctacgccgga < 2:236611‑M2/148‑96 (MQ=255) tGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCGGGCAGTCAGCCAGTAGTCg > 6:309237/1‑149 (MQ=255) ggAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTtcagttccagagcaggcaaatggcgcctgactgcgcacagcaaggtcaaccgtgcacgcatgcacgctgaagcagtcaaggcgcgctacgccggacact < 3:126273‑M2/149‑100 (MQ=255) gAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCGGGCAGTCAGCCAGTAGTCg < 8:184214/147‑1 (MQ=255) aaCTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCGGGCAGTCAGCCAGTAGTCGGTa < 3:39175/149‑1 (MQ=255) cTGAacgtgggtgacagctacgcaaagtacctgcacacccaactcatcagttccagagcaggcaaatggcgcctgactgcgcacagcaaggtcaaccgtgcacgcatgcacgctgaagcagtcaaggcgcgctacgccggacactttgg < 8:198136‑M1/149‑146 (MQ=255) tgatgaGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCTGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCGGGCAGTCAGCCAGTAGTCGGTATc > 5:367454/1‑148 (MQ=255) tGAacgtgggtgacagctacgcaaagtacctgcacacccaactcatcagttccagagcaggcaaatggcgcctgactgcgcacagcaaggtcaaccgtgcacgcatgcacgctgaagcagtcaaggcgcgctacgccggacactttggc > 2:325161‑M1/1‑3 (MQ=255) gatgaGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCGGGCAGTCAGCCAGTAGTCGGTATCg > 6:155914/1‑148 (MQ=255) atgaGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCGGGCAGTCAGCCAGTAGTCGGTATCGaa > 5:252846/1‑149 (MQ=255) aacgtgggtgacagctactcaaagtacctgcacacccaactcatcagttccagagaaggcaaatggcgcctgactgcgcacagcaaggtcaaccgtgcacgcattcacgctgaagcagtacaggcgcgctacgccggacacattggcg > 4:223640‑M1/1‑1 (MQ=255) | AACACTGCGCGCACCCAGTTGTAGCCATGTTCGAAAAGGTCTTCGCCAAAGTGTCCGGCGTAGCGCGCCTTGACTGCTTCAGCGT‑GCATGCGTGCACGGTTGACCTTGCTGTGCGCAGTCAGGCGCCATTTGCCTGCTCTGGAACTGATGAGTTGGGTGTGCAGGTACTTTGCGTAGCTGTCA‑CCCACGTTCAGTTCCCGGACCATGTGCTTGACATACTGCGGCGTGAGCCCGGCGGGCATGGCTTTGCCGTGGGCATGGATCACCCGGGCAGTCAGCCAGTAGTCGGTATCGAA > NC_002947/422446‑422741 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |