New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 599803 = | 39 (0.660) | 3 (0.060) | 3/238 | NT | 8.6% | coding (241/408 nt) | PP_0512 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 599853 = | 28 (0.520) | coding (191/408 nt) | PP_0512 | hypothetical protein |
GCAGCGGGCCGGTGGCCTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCAGCAAGGTGCCGCTCAGCTCGCGCTGGTAGGCCGG > NC_002947/599656‑599950 | gCAGCGGGCCGGTGGCCTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAggg > 2:319459/1‑148 (MQ=255) aGCGGGCCGGTGGCCTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAg > 5:299878/1‑149 (MQ=255) gcccgcgccagccccctcggccaaggccgaagtaccgggcccgttgccggcctaccagcgcgagctgagcggcaccttgctggaaatcccggcgggtgccgaggtggaactggccttgctggtgatcgacgaacgcgaccgcccGCAgc < 7:156384‑M1/5‑1 (MQ=255) ccgcgccagccccctcggccaaggccgaagtaccgggtccgttgccggcctaccagcgcgagctgagcggcaccttgctggaaatcccggcgggtgccgaggtggaactggccttgctggtgatcgacgaacgcgaccgcccGCAgcgc < 6:33142‑M1/7‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTg < 5:248860/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCCTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTgg > 6:126013/1‑149 (MQ=255) gTGGCCTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGcc > 2:213326/1‑149 (MQ=255) gTGGCCTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGcc > 6:276721/1‑149 (MQ=255) tGGCCTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCg < 6:290176/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCgg < 8:188545/148‑1 (MQ=255) gCCTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCgg < 6:299878/148‑1 (MQ=255) ccTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTa < 8:258061/149‑1 (MQ=255) gtgCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAg < 3:71315/148‑1 (MQ=255) cTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTtgc > 3:287425/1‑149 (MQ=255) ggCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTg < 1:201182/149‑1 (MQ=255) ggCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTg > 6:58764/1‑149 (MQ=255) gccggcctaccagcgcgagctgagcggcaccttgctggaaatcccggcgggtgccgaggtggaactggccttgctggtgatcgacgaacgcgaccgcccGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTg > 8:156384‑M1/100‑148 (MQ=255) cccggTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTgc < 8:272564/146‑1 (MQ=255) cggcctaccagcgcgagctgagcggcaccttgctggaaatcccggcgggtgccgaggtggaactggccttgctggtgatcgacgaacgcgaccgcccGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTgc < 5:285855‑M1/50‑1 (MQ=255) cggcctaccagcgcgagctgagcggcaccttgctggaaatcccggcgggtgccgaggtggaactggccttgctggtgatcgacgaacgcgaccgcccGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTgc > 6:285855‑M1/98‑147 (MQ=255) aTGTTCAGCGGGCGGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTc < 6:86196/149‑1 (MQ=255) tGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGGAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTGAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTgcggggggggg > 4:281461/1‑146 (MQ=255) aTCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTcgcg < 1:319459/149‑1 (MQ=255) aTCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTcgcg > 6:7208/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGCCCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGGCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTtcgt < 5:276721/149‑1 (MQ=255) gCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTAc < 8:29527/98‑1 (MQ=255) gCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTAc > 7:29527/1‑98 (MQ=255) gTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCa < 3:281461/149‑1 (MQ=255) cACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAGCGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGc < 2:351202/137‑1 (MQ=255) cACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAGCGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGc > 1:351202/1‑137 (MQ=255) cACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTc > 5:249962/1‑148 (MQ=255) aCCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCCGCGGGCGGTCGCGt > 8:128644/1‑111 (MQ=255) aCCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCCGCGGGCGGTCGCGt < 7:128644/111‑1 (MQ=255) ggCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACccgccg < 5:58764/149‑1 (MQ=255) gCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCgg < 5:126013/149‑1 (MQ=255) aCCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCca < 3:40034/80‑1 (MQ=255) aCCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCca > 4:40034/1‑80 (MQ=255) cgggAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCa < 5:7208/149‑1 (MQ=255) cgggAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCa < 4:287425/149‑1 (MQ=255) ggCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGAt < 8:315886/99‑1 (MQ=255) ggCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGAt > 7:315886/1‑99 (MQ=255) gggTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCAGCAAGGTGCCGCt < 1:213326/149‑1 (MQ=255) aaaCGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCAGCAAGGTGCCGCTCAGCTc < 2:87853/149‑1 (MQ=255) aaaCGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCAGCAAGGTGCCGCTCAGCTc > 4:68020/1‑149 (MQ=255) cAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCAGCAAGGTGCCGCTCAGCTCGCGCt > 2:154298/1‑149 (MQ=255) tggtAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCAGCAAGGTGCCGCTCAGCTCGCGCTgg > 1:1926/1‑147 (MQ=255) gtAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCAGCAAGGTGCCGCTCAGCTCGCGCTGGTAgg > 6:377435/1‑149 (MQ=255) aGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCAGCAAGGTGCCGCTCAGCTCGCGCTGGTAGGcc > 7:177556/1‑149 (MQ=255) GCAGCGCCTGGCTGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCAGCAAGGTGCCGCTCAGCTCGCGCTGGTAGGCCgg < 1:62928‑M1/148‑1 (MQ=255) | GCAGCGGGCCGGTGGCCTGGGTTTGTGCCTGGGTAATGCGCACCGGGGGCAGGTGCATGATCAGCTGGCCGGAGTTGCTGGCGCGGCCACGCAGTTCGACCCGGGCACCGGGCGGGAAGGCTTCGGGGTTGAAACGCAGGTGGTAGGGCAGCGCCTGGCCGGTACCGGTCAGGTTGCTGCTGGCCAGCAGGCGCTGCGGGCGGTCGCGTTCGTCGATCACCAGCAAGGCCAGTTCCACCTCGGCACCCGCCGGGATTTCCAGCAAGGTGCCGCTCAGCTCGCGCTGGTAGGCCGG > NC_002947/599656‑599950 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |