New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 938609 = | 39 (0.660) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 6.7% | coding (7013/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | 938682 = | 46 (0.820) | coding (6940/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
TCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACG > NC_002947/938462‑938750 | tCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACggtggt > 7:131477/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTTGTACCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGGCGACCACCACACTACCCAGCACGgtggtg > 5:331796/1‑149 (MQ=255) accttcaccgtcatcctcaacccggcccaggccaacggcgaactgctggacgtggtggccatcgatggcaccggcgcttcgtccctgccggtgcaaatcgctgcgccagacatcaccccgccggtcaccccgagcgagctagcgatcag < 8:299360‑M1/1‑1 (MQ=255) ccttcaccgtcatcctcaacccggcccaggccaacggcgaactgctggacgtggtggccatcgatggcaccggcgcttcgtccctgccggtgcaaatcgctgcgccagacatcaccccgccggtcaccccgagcgagctagcgatcaGt > 7:299360‑M1/148‑149 (MQ=255) caccgtcatcctcaagccggcccaggccaacggcgaactgctggacgtggtggccatcgatggcaccggcgcttcgtccctgccggtgcaaatcgctgcgccagacatcaccccgccggtcaccccgagcgagctagcgatcaGTGcc > 7:355496‑M1/144‑148 (MQ=255) aaccgtcatcctcaacccggcccaggccaacgtcgaactgctggacgtggtggagatcgctggcaccggcgcttcgtacctgccggtgcaaatcgctgcgccagacatcacacctcctgtcaccccgagcgagctagctatcaGTGc > 4:39885‑M1/144‑147 (MQ=255) gATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCAA‑CCTGCGGGGGGTGGTGGGTGATGGTGAAACTGCCAGTGGCGGCGAACACCACACTACCCAGCCCGGTTTTGCCATcggcg > 1:295913/1‑149 (MQ=255) gATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTA‑AGCCTGCGGGGGGTGGAGGGTGATGGTGAAAATTCCAGTGGCGTCGACCACCACACAACCCCGCACGGTAGTGCCATcggcg > 1:300263/1‑149 (MQ=255) tCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAg < 7:49215/149‑1 (MQ=255) ccggccgTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTTGTACCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGcac < 6:331796/149‑1 (MQ=255) gtTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCGAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGtgctgc > 6:82428/1‑149 (MQ=255) ccGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCAc < 8:131477/149‑1 (MQ=255) gTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGgcgc > 3:209134/1‑149 (MQ=255) aCTTGTAGTACCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTc > 4:310699/1‑149 (MQ=255) ttGTAGTACCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGc > 2:330452/1‑149 (MQ=255) catcgatggcaccggcgcttcgtccctgccggtgcaaatcgctgcgccagacatcaccccgccggtcaccccgagcgagctagcgatcaGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCg < 5:290370‑M1/60‑1 (MQ=255) aCCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGtt > 5:150821/1‑149 (MQ=255) ctctCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTgg > 4:102343/1‑149 (MQ=255) ctcCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCa > 3:340084/1‑149 (MQ=255) cACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCAc < 1:230275/147‑1 (MQ=255) cACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCAc > 2:230275/1‑147 (MQ=255) cACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTAGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCa < 2:300263/146‑1 (MQ=255) cACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTAGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCa < 2:295913/146‑1 (MQ=255) gcgctgcgtccctgccggtgcaaatcgctgcgccagacatcaccccgccggtcaccccgagcgagctagcgatcaGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACt > 7:261863‑M1/76‑149 (MQ=255) cgcttcgtccctgccggtgcaaatcgctgcgccagacatcaccccgccggtcaccccgagcgagctagcgatcaGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTg > 6:290370‑M1/75‑149 (MQ=255) gcggGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAgctcg > 6:90830/1‑149 (MQ=255) gggTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAgctcgct > 3:262385/1‑149 (MQ=255) tCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCgg > 7:338976/1‑149 (MQ=255) tGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTa < 5:60570/126‑1 (MQ=255) tGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTa > 6:60570/1‑126 (MQ=255) tGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCggg > 5:18560/1‑149 (MQ=255) gAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAgctcgctc > 7:5808/1‑133 (MQ=255) gAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAgctcgctc < 8:5808/133‑1 (MQ=255) aaaCTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCgggg < 4:340084/148‑1 (MQ=255) aaaCTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCggg < 8:338976/147‑1 (MQ=255) aaaCTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGt < 3:102343/149‑1 (MQ=255) aaaCTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGt < 4:209134/149‑1 (MQ=255) aGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTg < 5:90830/149‑1 (MQ=255) aGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTg < 4:262385/149‑1 (MQ=255) gTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTgg < 6:150821/149‑1 (MQ=255) tGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGgc < 3:310699/149‑1 (MQ=255) gTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAg > 1:155413/1‑149 (MQ=255) caccacACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGAttt > 5:225300/1‑149 (MQ=255) accacACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACACACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTg < 8:76593/149‑1 (MQ=255) tACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCgg > 3:171490/1‑148 (MQ=255) ccAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAgg > 7:129385/1‑149 (MQ=255) cAGCACGGTGGTGCCATCGTCTGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCTTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAggg < 4:287666/149‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACATGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACg > 1:227549/1‑148 (MQ=255) | TCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTC‑A‑CCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACG > NC_002947/938462‑938750 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |