New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1071578 = | 55 (0.930) | 4 (0.070) | 3/248 | NT | 7.8% | coding (243/375 nt) | PP_0929 | lipoprotein |
? | NC_002947 | 1071621 = | 42 (0.740) | coding (200/375 nt) | PP_0929 | lipoprotein |
CTGTCGCGTCAGTCGCTAAGCCCTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGCGTTTGCCATGGTGGCGCGAGCCGTAGTAGGAAGCGG > NC_002947/1071438‑1071723 | cTGTCGCGTCAGTCGCTAAGCCCTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTgcg > 8:29103/1‑149 (MQ=255) tGTCGCGTCAGTCGCTAAGCCCTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATATTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTgcgc > 3:189111/1‑149 (MQ=255) tCAGTCGCTAAGCCCTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTgg > 5:327521/1‑149 (MQ=255) gTCGCTAAGCCCTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCa > 7:244833/1‑149 (MQ=255) gCTAAGCCCTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGt > 4:71956/1‑149 (MQ=255) cTAAGCCCTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTGGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGtt > 4:92301/1‑149 (MQ=255) cTAAGCCCTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGtt > 4:97595/1‑149 (MQ=255) aGCGCTTGTACTCGCTCGCGGGCTGTTCCGCTAGGGAGCTTGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGGGAGACAGGTGGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCGATGTTg < 4:189111/147‑1 (MQ=255) ccTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTTCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCAc > 3:109706/1‑149 (MQ=255) ccTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTg > 6:26518/1‑135 (MQ=255) ccTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTg < 5:26518/135‑1 (MQ=255) ccTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTgg > 7:312905/1‑145 (MQ=255) ccTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTgg < 8:312905/145‑1 (MQ=255) ttGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGt < 8:302549/140‑1 (MQ=255) ttGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGt > 7:302549/1‑140 (MQ=255) gTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTgg > 8:176861/1‑141 (MQ=255) gTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTgg < 7:176861/141‑1 (MQ=255) tACTCACACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGca < 7:296411/149‑1 (MQ=255) ccagacgggcaccgcttcctactacggctcgcgccaccatggcaaacgcaccgccagtggcgaaccgttcaaccagcacgcccttaccgccgcccaccgcagcctgcccttcggCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGca < 8:30089‑M1/35‑1 (MQ=255) gCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCacac < 6:327521/147‑1 (MQ=255) gCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACAACCACAATTCGCTGGTTGGGCATGTTGGTCACCCGCACACgt > 6:65407/1‑149 (MQ=255) gcaccgcttcctactacggctcgcgccaccatggcaaacgcaccgccagtggcgaaccgttcaaccagcacgcccttaccgccgcccaccgcagcctgcccttcggCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGtgtg > 4:1719‑M1/107‑149 (MQ=255) gcaccgcttcctactacggctcgcgccaccatggcaaacgcaccgccagtggcgaaccgttcaaccagcacgcccttaccgccgcccaccgcagcctgcccttcggCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGtgtg > 4:6993‑M1/107‑149 (MQ=255) gcgGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTGGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGc < 3:92301/149‑1 (MQ=255) gcgGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGc < 3:97595/149‑1 (MQ=255) caccgcttcctactacggctcgcgccaccatggcaaacgcaccgccagtggcgaaccgttcaaccagcacgcccttaccgccgcccaccgcagcctgcccttcggCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGc > 7:30089‑M1/106‑149 (MQ=255) cgGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGcc > 7:260621/1‑149 (MQ=255) cTGTTTCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAg < 4:109706/149‑1 (MQ=255) tGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTTCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGACGCGGGTGTGCGGGCAACGGTCGTTTATGAGTAACACCACACTGCGCTGGTTGGACATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAgg > 7:198410/1‑149 (MQ=255) ccGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGggcgg < 2:357698/148‑1 (MQ=255) cGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGgcggcg < 8:244833/149‑1 (MQ=255) cGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGGGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGgcggcg < 3:43443/149‑1 (MQ=255) gATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGt > 6:380949/1‑140 (MQ=255) gATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGt < 5:380949/140‑1 (MQ=255) gATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGcggcgg > 1:306572/1‑149 (MQ=255) gATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGcggcgg > 7:321748/1‑149 (MQ=255) gctgctGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTg > 7:188951/1‑149 (MQ=255) ctgctgCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGc > 8:140476/1‑149 (MQ=255) ctgctgCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGc < 7:29103/149‑1 (MQ=255) ctgcGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAATGGCGTGCttg < 5:65407/149‑3 (MQ=255) ctgcGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTgg < 3:71956/149‑1 (MQ=255) cgcgAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCGATGTTGGTCACACTGACACGTGTGCTGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGtt < 5:258654/148‑1 (MQ=255) cgAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGaa > 4:168034/1‑149 (MQ=255) gATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCAc > 7:226594/1‑149 (MQ=255) gATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCAc > 3:102955/1‑149 (MQ=255) aTCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACt > 3:81171/1‑149 (MQ=255) aGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTgg < 4:81171/148‑1 (MQ=255) gcggcCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCgg > 1:17586/1‑149 (MQ=255) gcggcCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCgg > 4:152753/1‑149 (MQ=255) gcCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGc < 3:168034/149‑1 (MQ=255) cgcgGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGCGt > 2:12656/1‑149 (MQ=255) cgGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGCGttt < 7:140476/149‑1 (MQ=255) gtgCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCAc < 3:67259/131‑1 (MQ=255) gtgCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCAc > 4:67259/1‑131 (MQ=255) aCGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGCGTTTGCCATGGTGgcgc > 1:320507/1‑148 (MQ=255) cGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGCGTTTGCCATGGTGGCGCGa < 8:321748/149‑1 (MQ=255) gTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGCGTTTGCCATGGTGGCGCGAGCCg > 4:290545/1‑148 (MQ=255) gTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGTGGCGGTAAGGGCGAGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGc < 1:33476/117‑1 (MQ=255) gTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGAGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGc > 2:33476/1‑117 (MQ=255) caccacACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGCGTTTGCCATGGTGGCGCGAGCCGTAGTAGGAAGCgg > 3:273562/1‑149 (MQ=255) caccacACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGCGTTTGCCATGGTGGCGCGAGCCGTAGTAGGAAGCgg > 7:155277/1‑149 (MQ=255) | CTGTCGCGTCAGTCGCTAAGCCCTTGTACTCGCACGCGGGCTGTTCCGCTACGGAGCATGCCGATTTTTTCCGCTGCTGCGCGAGACAGGTCGATCAGGCGGCCGCGGGTGTGCGGGCCACGGTCGTTTATGCGTACCACCACACTGCGCTGGTTGGCCATGTTGGTCACCCGCACACGTGTGCCGAAGGGCAGGCTGCGGTGGGCGGCGGTAAGGGCGTGCTGGTTGAACGGTTCGCCACTGGCGGTGCGTTTGCCATGGTGGCGCGAGCCGTAGTAGGAAGCGG > NC_002947/1071438‑1071723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |