New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1154814 = | 58 (0.990) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.5% | coding (678/726 nt) | gltR‑II | two‑component system response regulator |
? | NC_002947 | 1154888 = | 49 (0.900) | coding (46/1455 nt) | PP_1013 | sensor histidine kinase |
CGCAGCAAATCCTCGACCGCGACACCATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTG > NC_002947/1154666‑1154961 | cactcatggaatgcgccaggctgctggcgctggcacgcagcccctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggag < 1:269180‑M1/1‑1 (MQ=255) gcagcaAATCCTCGACCGCGACACCATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTgc > 8:97250/1‑149 (MQ=255) tcatggaatgcgccaggctgctggcgctggcacgcagcccctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggagcgc < 7:144652‑M1/4‑1 (MQ=255) catggaatgcgccaggctgctggcgctggcacgcagcccctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggaGcgcg < 5:131029‑M1/5‑1 (MQ=255) atggaatgcgccaggctgctggcgctggcacgcagcccctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggaGCGCgg < 7:182062‑M1/6‑1 (MQ=255) atggaatgcgccaggctgctggcgctggcacgcagcccctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggaGCGCgg < 4:96845‑M1/6‑1 (MQ=255) tggaatgcgccaggctgctggcgctggcacgcagcccctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggaGCGCgg < 6:340073‑M1/6‑1 (MQ=255) tggaatgcgccaggctgctggcgctggcacgcagcccctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggaGCGCgg < 5:233031‑M1/6‑1 (MQ=255) gaatgcgccaggctgctggcgctggcacgcagcccctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggaGCGCGGCa > 5:142766‑M1/141‑148 (MQ=255) tCCTCGACCGCGACACCATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGt > 1:211252/1‑149 (MQ=255) tCCTCGACCGCGACACCATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTAGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGt < 8:252191/149‑1 (MQ=255) atgcgccaggctgctggcgctggcacgcagcccctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggaGCGCGGCAg < 2:290705‑M1/9‑1 (MQ=255) tCGACCGCGACACCATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAAGCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGAGACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGc > 7:181225/1‑149 (MQ=255) tCGACCGCGACACCATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGc > 5:183702/1‑149 (MQ=255) tCGACCGCGACACCATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGc > 4:10406/1‑149 (MQ=255) aCCGCGACACCATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCT‑‑GCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACtt < 2:5186/149‑1 (MQ=255) gctgctggcgctggcacgcagcccctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggagcgc > 8:116112‑M1/130‑133 (MQ=255) gctgctggcgctggcacgcagcccctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggagcgc < 7:116112‑M1/4‑1 (MQ=255) cacCATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTgg < 3:47644/149‑1 (MQ=255) cacCATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTgg < 3:64304/149‑1 (MQ=255) cATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTggcgg > 2:134024/1‑149 (MQ=255) cATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTggcgg < 3:355679/149‑1 (MQ=255) gCAACTCGACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGCCCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGTCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACAt < 8:181225/149‑1 (MQ=255) gCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACAt > 1:223710/1‑149 (MQ=255) gCAACGCCACACGTGCTCGCGAACCGATTCCGTTGGACCGTAACGTCGACATGGCGCTCAGCCCTCTGCGCCACCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCACGCCTGATCCGCACTGTGCGCGGCAGTGGCAACTTGATGGCGGCACAt > 4:248549/1‑149 (MQ=255) aCGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTc > 7:226652/1‑149 (MQ=255) gTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTgcg > 7:157410/1‑149 (MQ=255) cctgaagctggctggcgcgcagctgagatacccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggaGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTgcg < 3:169805‑M1/43‑1 (MQ=255) tGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTgcgc < 7:97250/149‑1 (MQ=255) ggTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGcc > 3:94639/1‑149 (MQ=255) gTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGcc < 6:183702/148‑1 (MQ=255) cgAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAg < 2:223710/149‑1 (MQ=255) gAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGccc < 1:137107/144‑1 (MQ=255) gAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGccc > 2:137107/1‑144 (MQ=255) gAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAgc > 2:92786/1‑149 (MQ=255) aTGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCt < 3:10406/149‑1 (MQ=255) cccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaaggaGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCcgc > 4:169805‑M1/77‑148 (MQ=255) ccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaggaGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCt > 3:88404‑M1/75‑149 (MQ=255) tGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCt < 1:92786/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTgggg < 2:211252/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGc < 7:81413/149‑1 (MQ=255) tCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTggggag > 5:291130/1‑147 (MQ=255) cAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCg > 5:137615/1‑148 (MQ=255) cAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCg > 4:109595/1‑148 (MQ=255) aGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCgg < 4:94639/148‑1 (MQ=255) gCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGAt < 8:226652/149‑1 (MQ=255) gCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGAt < 8:157410/149‑1 (MQ=255) tCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGAtgctg < 3:109595/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGTGGAtgctgct < 6:291130/147‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGc < 5:341350/134‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGc > 6:341350/1‑134 (MQ=255) cgcgTTACCGACTAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTgg < 3:248549/149‑1 (MQ=255) agcgATACCGACAAGCCTCGCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCt < 6:224975/146‑1 (MQ=255) cGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctg > 6:299943/1‑149 (MQ=255) cGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctg > 5:205697/1‑149 (MQ=255) gACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctgc > 6:236536/1‑149 (MQ=255) gACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctgc > 2:308625/1‑149 (MQ=255) gACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctgc > 1:85770/1‑149 (MQ=255) gACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGAGGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctgc < 1:134024/149‑1 (MQ=255) aCAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTcc < 6:28120/105‑1 (MQ=255) aCAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTcc > 5:28120/1‑105 (MQ=255) aaGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTgg < 6:205697/149‑1 (MQ=255) gCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGcc > 7:355362/1‑149 (MQ=255) tCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAg > 8:174088/1‑149 (MQ=255) ccccGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAgg > 2:269180/1‑149 (MQ=255) cccGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGTTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAggg < 1:277758/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCACTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAgggg > 5:316491/1‑149 (MQ=255) tCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGTACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGa < 6:54972/100‑1 (MQ=255) tCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGTACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGa > 5:54972/1‑100 (MQ=255) cGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCa < 7:174088/149‑1 (MQ=255) cGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCa > 6:233031/1‑149 (MQ=255) gCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCAt > 3:96845/1‑149 (MQ=255) cACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCAt > 4:101224/1‑148 (MQ=255) gTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCt < 2:85770/149‑1 (MQ=255) tGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTg > 5:218867/1‑149 (MQ=255) | CGCAGCAAATCCTCGACCGCGACACCATCGGCAACGCCACCCGTGGTCGCGAACCGATGCCGTTGGACCGTATCGTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTG > NC_002947/1154666‑1154961 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |