New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1154814 = | 58 (0.990) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.5% | coding (678/726 nt) | gltR‑II | two‑component system response regulator |
? | NC_002947 | 1154888 = | 49 (0.900) | coding (46/1455 nt) | PP_1013 | sensor histidine kinase |
GTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCATTCCATGAGTGC > NC_002947/1154740‑1155036 | ccagataatgctggacaacccctgggccagcaggacaaccagcaaggtcagcagcagcatccgccccagcaggaGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCt > 3:88404‑M1/75‑149 (MQ=255) tGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCt < 1:92786/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTgggg < 2:211252/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGc < 7:81413/149‑1 (MQ=255) tCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTggggag > 5:291130/1‑147 (MQ=255) cAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCg > 5:137615/1‑148 (MQ=255) cAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCg > 4:109595/1‑148 (MQ=255) aGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCgg < 4:94639/148‑1 (MQ=255) gCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGAt < 8:226652/149‑1 (MQ=255) gCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGAt < 8:157410/149‑1 (MQ=255) tCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGAtgctg < 3:109595/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGTGGAtgctgct < 6:291130/147‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGc > 6:341350/1‑134 (MQ=255) cAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGc < 5:341350/134‑1 (MQ=255) cgcgTTACCGACTAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTgg < 3:248549/149‑1 (MQ=255) agcgATACCGACAAGCCTCGCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCt < 6:224975/146‑1 (MQ=255) cGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctg > 5:205697/1‑149 (MQ=255) cGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctg > 6:299943/1‑149 (MQ=255) gACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctgc > 2:308625/1‑149 (MQ=255) gACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctgc > 1:85770/1‑149 (MQ=255) gACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctgc > 6:236536/1‑149 (MQ=255) gACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGAGGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCctgc < 1:134024/149‑1 (MQ=255) aCAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTcc > 5:28120/1‑105 (MQ=255) aCAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTcc < 6:28120/105‑1 (MQ=255) aaGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTgg < 6:205697/149‑1 (MQ=255) gCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGcc > 7:355362/1‑149 (MQ=255) tCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAg > 8:174088/1‑149 (MQ=255) ccccGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAgg > 2:269180/1‑149 (MQ=255) cccGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGTTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAggg < 1:277758/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCACTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAgggg > 5:316491/1‑149 (MQ=255) tCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGTACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGa > 5:54972/1‑100 (MQ=255) tCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGTACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGa < 6:54972/100‑1 (MQ=255) cGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCa > 6:233031/1‑149 (MQ=255) cGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCa < 7:174088/149‑1 (MQ=255) gCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCAt > 3:96845/1‑149 (MQ=255) cACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCAt > 4:101224/1‑148 (MQ=255) gTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCt < 2:85770/149‑1 (MQ=255) tGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTg > 5:218867/1‑149 (MQ=255) agcgcggcagcaggcgccagcgccgctcagggcgcacagcagacatgtgccgccaacaagtagccactgccgcgcTCC‑TGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTgg > 3:88404‑M2/76‑149 (MQ=255) gcggcagcaggcgccagcgccgctcagggcgcacagcagacatgtgccgccaacaagtagccactgccgcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTggg > 4:169805‑M2/73‑148 (MQ=255) GCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTggg < 1:290705‑M1/148‑1 (MQ=255) GCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGt > 8:355362‑M1/1‑149 (MQ=255) GCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGt > 6:137615‑M1/1‑149 (MQ=255) GGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTcc < 2:331952‑M1/133‑1 (MQ=255) GGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTcc > 1:331952‑M1/1‑133 (MQ=255) gCTACTTGTTGGCGGCACATCTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGCCGGATGCAGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCATGCTGGCCCAGTGGTAGTCCAGCAATAAATGGGTATCTCAGCt > 8:182062/1‑149 (MQ=255) aCTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTgcg > 6:148436/1‑149 (MQ=255) cTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCa > 1:138819/1‑126 (MQ=255) cTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCa < 2:138819/126‑1 (MQ=255) ttgGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCgcca < 3:101224/149‑1 (MQ=255) gcggcACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTg < 3:132609/112‑1 (MQ=255) gcggcACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTg > 4:132609/1‑112 (MQ=255) ggcACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGccagccag > 5:3034/1‑149 (MQ=255) aTGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTAtctc < 4:55798/127‑1 (MQ=255) aTGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTAtctc > 3:55798/1‑127 (MQ=255) gTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAgg > 8:144652/1‑149 (MQ=255) cgcacagcagacatgtgccgccaacaagtagccactgccgcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAgg < 3:169805‑M2/106‑1 (MQ=255) gctgTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTgg < 5:106350/114‑1 (MQ=255) gctgTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTgg > 6:106350/1‑114 (MQ=255) gcTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCagcagc > 5:340073/1‑149 (MQ=255) ctgctgCCGCGCTCATAGCTCGGGCCGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTCGCCCAGGCGTTTTCCAGCATAATCAGCGTATCTCAGCTCCCCGCAAGCCAGCTTCAGGCGCTGCGTGCCACCGCCACAAGCCTGccgc > 4:109299/1‑148 (MQ=255) ctgccgcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCAt < 2:290705‑M2/138‑1 (MQ=255) tgccgcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCATTc > 5:142766‑M2/9‑148 (MQ=255) ccgcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCATTCCa < 6:340073‑M2/142‑1 (MQ=255) ccgcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCATTCCa < 5:233031‑M2/142‑1 (MQ=255) ccgcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCATTCCAt < 4:96845‑M2/143‑1 (MQ=255) ccgcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCATTCCAt < 7:182062‑M2/143‑1 (MQ=255) cgcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCATTCCATg < 5:131029‑M2/144‑1 (MQ=255) gcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCagcagc < 7:116112‑M2/129‑1 (MQ=255) gcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCagcagc > 8:116112‑M2/5‑133 (MQ=255) gcgcTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCATTCCATGa < 7:144652‑M2/145‑1 (MQ=255) cTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCATTCCATGAGTg < 1:269180‑M2/148‑1 (MQ=255) tCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCATTCCATGAGTGc > 4:53004/1‑149 (MQ=255) | GTCGACATGGCGGTCAGCCGTCTGCGCCAGCGCCTGCGCGATACCGACAAGCCTCCCCGGCTGATCCGCACGGTGCGCGGCAGTGGCTACTTGTTGGCGGCACATGTCTGCTGTGCGCCCTGAGCGGCGCTGGCGCCTGCTGCCGCGCTCCTTGCTGGGGCGGATGCTGCTGCTGACCTTGCTGGTTGTCCTGCTGGCCCAGGGGTTGTCCAGCATTATCTGGGTATCTCAGCTGCGCGCCAGCCAGCTTCAGGGGCTGCGTGCCAGCGCCAGCAGCCTGGCGCATTCCATGAGTGC > NC_002947/1154740‑1155036 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |