| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1591794 | 57 (0.970) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 5.2% | coding (100/921 nt) | PP_1395 | AraC family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 1591834 | 56 (1.010) | coding (60/921 nt) | PP_1395 | AraC family transcriptional regulator | |||||
ATGCAGTGGGTCGTAGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACG > NC_002947/1591648‑1591941 | aTGCAGTGGGTCGTAGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATg < 1:141164/149‑1 (MQ=255) tCGTAGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGCGTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGAAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCATCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCa > 1:237029/1‑148 (MQ=255) gTAGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAg < 1:210263/148‑1 (MQ=255) aGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGc > 4:199451/1‑149 (MQ=255) gCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑Tc > 4:246516/1‑149 (MQ=255) gTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAg > 1:180730/1‑142 (MQ=255) gTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAg < 2:180730/142‑1 (MQ=255) tACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGcc > 4:63490/1‑149 (MQ=255) cTGCTCGTCACCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGccc < 3:124411/148‑1 (MQ=255) cTCGTCACCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCAt < 3:63490/149‑1 (MQ=255) aCCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGt < 4:319858/149‑1 (MQ=255) ccAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCTATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGtt > 1:206253/1‑148 (MQ=255) aGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGTAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCATCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGAt < 2:237029/149‑1 (MQ=255) aGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTgg < 4:337397/113‑1 (MQ=255) aGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTgg > 3:337397/1‑113 (MQ=255) ggC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcg > 2:303722‑M2/1‑146 (MQ=255) ggC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAAAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcg < 1:100982‑M2/149‑4 (MQ=255) gC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcgg < 8:210280‑M2/149‑5 (MQ=255) ttGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGAgctgatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtccagcatcggcca < 7:116460‑M1/148‑48 (MQ=255) agcctgcCCTGTGCATCCTTGCCCAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAg > 7:167126/4‑149 (MQ=255) tgcCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTc > 6:57989/1‑148 (MQ=255) gcCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGAGGTTGATCAGCTCGTCCAGCTc > 5:368548/1‑147 (MQ=255) cccTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGTGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcg > 3:116009‑M2/1‑135 (MQ=255) cccTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCAGCAGGTACAGGTCATCGATGGCGGATGCAGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCCGCtcg < 4:116009‑M2/138‑4 (MQ=255) gcatccttGCCCAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGCTCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTg > 6:178351/8‑149 (MQ=255) cAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTg > 3:230233/1‑148 (MQ=255) cAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGc < 7:91943/149‑1 (MQ=255) aaGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCa < 5:54836/149‑1 (MQ=255) tGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTcc < 3:199451/149‑1 (MQ=255) cccaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAg < 8:167126/147‑1 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTcc < 6:274313/147‑1 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAg > 3:217878/1‑149 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAg > 3:213040/1‑149 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGAGGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTcc > 5:274313/1‑147 (MQ=255) acaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGAgctgatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtccagcatcgg < 4:52641‑M1/123‑45 (MQ=255) acaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGAgctgatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtccagcatcgg > 3:52641‑M1/1‑79 (MQ=255) acaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAgg < 5:316881/134‑1 (MQ=255) acaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAgg > 6:316881/1‑134 (MQ=255) tGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCt < 8:230219/72‑1 (MQ=255) tGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCt > 7:230219/1‑72 (MQ=255) gcCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGgcg > 7:136037/1‑122 (MQ=255) gcCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGgcg < 8:136037/122‑1 (MQ=255) gcCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGa > 8:14883/1‑149 (MQ=255) ggtgggtACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCTATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTgg < 2:206253/149‑1 (MQ=255) ggtgggtACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTgg < 4:217878/149‑1 (MQ=255) ggtgggtACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTgg < 4:213040/149‑1 (MQ=255) tACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCggtgg < 7:14883/149‑1 (MQ=255) tACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCggtgg < 5:57989/149‑1 (MQ=255) cAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGAGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCggtggt > 8:76343/1‑148 (MQ=255) gAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCat < 3:246516/149‑1 (MQ=255) aCATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTg > 6:75230/1‑104 (MQ=255) aCATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTg < 5:75230/104‑1 (MQ=255) aCGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAc < 4:230233/149‑1 (MQ=255) gCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcggt < 3:81258/109‑1 (MQ=255) gCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcggt > 4:81258/1‑109 (MQ=255) aCCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATTCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCTGTTCGGTGGACGTTGCGGTGGTCatga < 2:314191/127‑1 (MQ=255) aCCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGCGTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGCCCGa > 1:257853/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCatga > 1:314191/1‑127 (MQ=255) cAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCAt < 6:210379/148‑1 (MQ=255) aGGTCATCGTTGGCCGTTGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGCTCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCATGGTCGGTTCGTTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAg < 2:257853/149‑1 (MQ=255) gTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCat < 4:367404/114‑1 (MQ=255) gTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGAGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACTTGGCGGAGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTCACCGACGCAGCATAGGt > 8:310703/1‑149 (MQ=255) tCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTgg < 7:210280/149‑1 (MQ=255) gATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTctgct < 4:268735/125‑1 (MQ=255) gATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTctgct < 4:89758/125‑1 (MQ=255) gATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTctgct > 3:89758/1‑125 (MQ=255) gATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTctgct > 3:268735/1‑125 (MQ=255) tGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggcagcaa < 7:116460‑M2/148‑102 (MQ=255) tGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCa > 1:234032/1‑148 (MQ=255) ccGAgctgatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtccagcatcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggcagcaaaagc < 8:210280‑M1/149‑146 (MQ=255) ccGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgt < 4:52641‑M2/123‑80 (MQ=255) ccGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgt > 3:52641‑M2/1‑44 (MQ=255) cGAgctgatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtccagcatcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttttgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggcagcaaaagcc < 1:100982‑M1/149‑147 (MQ=255) cGAgctgatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtccagcatcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggcagcaaaagcc > 2:303722‑M1/1‑3 (MQ=255) cGAgctgatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtccagcatcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccacactggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccaggg > 3:116009‑M1/1‑3 (MQ=255) cGAgcggatcaaccgccatgcgggcgagccctttggtcctgcatccgccatcgatgacctgtacctgctgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccaggg < 4:116009‑M1/138‑136 (MQ=255) gATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACg > 6:311128/1‑149 (MQ=255) gATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACg > 8:98428/1‑149 (MQ=255) | ATGCAGTGGGTCGTAGGCGTACTGCTCGTCACCCAGGAACAGGC‑TTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACG > NC_002947/1591648‑1591941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |