New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1591794 | 57 (0.970) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 5.2% | coding (100/921 nt) | PP_1395 | AraC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 1591834 | 56 (1.010) | coding (60/921 nt) | PP_1395 | AraC family transcriptional regulator |
GGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCT > NC_002947/1591689‑1591973 | ggCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcg > 2:303722‑M2/1‑146 (MQ=255) ggCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAAAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcg < 1:100982‑M2/149‑4 (MQ=255) gCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcgg < 8:210280‑M2/149‑5 (MQ=255) agcctgcCCTGTGCATCCTTGCCCAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAg > 7:167126/4‑149 (MQ=255) tgcCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTc > 6:57989/1‑148 (MQ=255) gcCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGAGGTTGATCAGCTCGTCCAGCTc > 5:368548/1‑147 (MQ=255) cccTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGTGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcg > 3:116009‑M2/1‑135 (MQ=255) cccTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCAGCAGGTACAGGTCATCGATGGCGGATGCAGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCCGCtcg < 4:116009‑M2/138‑4 (MQ=255) gcatccttGCCCAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGCTCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTg > 6:178351/8‑149 (MQ=255) cAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTg > 3:230233/1‑148 (MQ=255) cAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGc < 7:91943/149‑1 (MQ=255) aaGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCa < 5:54836/149‑1 (MQ=255) tGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTcc < 3:199451/149‑1 (MQ=255) cccaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAg < 8:167126/147‑1 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTcc < 6:274313/147‑1 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAg > 3:213040/1‑149 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAg > 3:217878/1‑149 (MQ=255) cacaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGAGGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTcc > 5:274313/1‑147 (MQ=255) acaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAgg < 5:316881/134‑1 (MQ=255) acaGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAgg > 6:316881/1‑134 (MQ=255) gcCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGgcg > 7:136037/1‑122 (MQ=255) gcCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGgcg < 8:136037/122‑1 (MQ=255) gcCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGa > 8:14883/1‑149 (MQ=255) ggtgggtACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCTATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTgg < 2:206253/149‑1 (MQ=255) ggtgggtACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTgg < 4:213040/149‑1 (MQ=255) ggtgggtACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTgg < 4:217878/149‑1 (MQ=255) tACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCggtgg < 7:14883/149‑1 (MQ=255) tACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCggtgg < 5:57989/149‑1 (MQ=255) cAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGAGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCggtggt > 8:76343/1‑148 (MQ=255) gAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCat < 3:246516/149‑1 (MQ=255) aCATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTg < 5:75230/104‑1 (MQ=255) aCATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTg > 6:75230/1‑104 (MQ=255) aCGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGAc < 4:230233/149‑1 (MQ=255) gCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcggt < 3:81258/109‑1 (MQ=255) gCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcggttcggt > 4:81258/1‑109 (MQ=255) aCCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATTCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCTGTTCGGTGGACGTTGCGGTGGTCatga < 2:314191/127‑1 (MQ=255) aCCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGCGTCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGCCCGa > 1:257853/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCatga > 1:314191/1‑127 (MQ=255) cAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCAt < 6:210379/148‑1 (MQ=255) aGGTCATCGTTGGCCGTTGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGCTCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCATGGTCGGTTCGTTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAg < 2:257853/149‑1 (MQ=255) gTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCat < 4:367404/114‑1 (MQ=255) gTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGAGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACTTGGCGGAGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTCACCGACGCAGCATAGGt > 8:310703/1‑149 (MQ=255) tCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTgg < 7:210280/149‑1 (MQ=255) gATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTctgct < 4:89758/125‑1 (MQ=255) gATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTctgct < 4:268735/125‑1 (MQ=255) gATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTctgct > 3:89758/1‑125 (MQ=255) gATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTctgct > 3:268735/1‑125 (MQ=255) tGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgtgcatccttgcccagggcagcaa < 7:116460‑M2/148‑102 (MQ=255) tGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCa > 1:234032/1‑148 (MQ=255) ccGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgt < 4:52641‑M2/123‑80 (MQ=255) ccGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCtcggccatcgatgacctgtacctggtgcgttacaccgaaaatgtacgttctgtacccaccctggcgcagcctgccctgt > 3:52641‑M2/1‑44 (MQ=255) gATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACg > 6:311128/1‑149 (MQ=255) gATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACg > 8:98428/1‑149 (MQ=255) tGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGgcgc < 7:98428/149‑1 (MQ=255) cAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCTGTGGACGTGGCTGTGGTCATGATGGCTTTACTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGTCAAAGACGGGCGCTAGTc > 4:212755/1‑149 (MQ=255) cAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTc > 2:309917/1‑149 (MQ=255) cAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTc > 1:350404/1‑149 (MQ=255) aGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGaa < 2:350404/149‑1 (MQ=255) ggC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAg < 7:310703/149‑1 (MQ=255) c‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCt < 1:309917/149‑1 (MQ=255) gCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGtcgg < 4:341169/57‑1 (MQ=255) gCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTTGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGc < 7:76343/148‑1 (MQ=255) cGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCAtgt < 2:100982/149‑1 (MQ=255) cATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAACGATGCAtgtg > 2:39958/1‑148 (MQ=255) gCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTg < 2:234032/149‑1 (MQ=255) gCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTg > 6:39105/1‑149 (MQ=255) gTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCt > 5:11681/1‑149 (MQ=255) | GGCTTTTGCTGCCCTGGGCAAGGATGCACAGGGCAGGCTGCGCCAGGGTGGGTACAGAACGTACATTTTCGGTGTAACGCACCAGGTACAGGTCATCGATGGCCGATGCTGGACCAAAGGGC‑TCGCCCGCATGGCGGTTGATCAGCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCT > NC_002947/1591689‑1591973 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |