| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CCATGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAG > NC_002947/2356903‑2357197 | ccATGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATg > 6:172174/1‑149 (MQ=255)accagttcaaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggtg < 5:332633‑M1/2‑1 (MQ=255) cctcttcaaggtcgtgcgcatcgaaggctaattcatgtggcacgcgcacccggagacccaccaagcattcctggtgctggaagtcaccctgcgtagcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGc > 2:99810‑M1/147‑149 (MQ=255) ccagttcaaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggtg > 7:64240‑M1/147‑148 (MQ=255) cATGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGc > 8:227373/1‑149 (MQ=255) gttcaaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgtatgtgaaccccggggaactctatgtggTGcccc < 7:311272‑M1/6‑1 (MQ=255) gttcaaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGcccc < 6:72621‑M1/6‑1 (MQ=255) gttcaaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGcc < 3:25601‑M1/4‑1 (MQ=255) ttcaaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGCCCcg < 8:323381‑M1/7‑1 (MQ=255) ttcaaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactcaatgtggTGACCcg < 8:318474‑M1/7‑1 (MQ=255) tAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCACCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCcgcg > 5:59422/1‑149 (MQ=255) caaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatgtggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctgttgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaagcccggggaactctttgtggTGCCCcgc > 5:308513‑M1/141‑148 (MQ=255) aaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggggctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGCCCCGCgg > 1:134937‑M1/140‑149 (MQ=255) 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< 6:172960/148‑1 (MQ=255) cGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGAc < 5:102607/149‑1 (MQ=255) cGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGAc < 3:240529/149‑1 (MQ=255) tACATCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTATCTGCTGTGCGATTCCCCACTTCATGAACTGTATTCATAATTCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCTCAg < 1:238956/129‑1 (MQ=255) tACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGAcgccg > 2:299848/1‑149 (MQ=255) tACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGATCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCACCGAGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCATTGCGAAg > 2:238956/1‑129 (MQ=255) 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cccccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAg > 2:53569/1‑143 (MQ=255) ccccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCgg < 8:212397/92‑1 (MQ=255) ccccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCgg > 7:212397/1‑92 (MQ=255) ccccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATa > 1:15879/1‑149 (MQ=255) ccccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATa > 7:1971/1‑149 (MQ=255) cccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCCCATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATAc > 3:204723/1‑149 (MQ=255) ttCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACg > 1:141757/1‑147 (MQ=255) aTGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCg < 4:255888/131‑1 (MQ=255) aTGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCg > 3:255888/1‑131 (MQ=255) tGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGt < 8:1971/149‑1 (MQ=255) ccGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGc < 7:227373/148‑1 (MQ=255) gTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTc < 8:180034/149‑1 (MQ=255) gTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTc < 2:141757/149‑1 (MQ=255) gTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTc < 3:266022/149‑1 (MQ=255) tATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTcc < 2:362302/149‑1 (MQ=255) aTTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTc > 8:45689/1‑147 (MQ=255) aGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCAc > 8:39842/1‑149 (MQ=255) gAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCa < 3:112481/144‑1 (MQ=255) gAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCa > 4:112481/1‑144 (MQ=255) aaTGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGTGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCa < 1:79796/149‑1 (MQ=255) aTGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAg < 7:39842/149‑1 (MQ=255) | CCATGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCTTGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAG > NC_002947/2356903‑2357197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |