| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 2357122 = | 98 (1.810) | coding (256/387 nt) | PP_2071 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
AAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAACTGGT > NC_002947/2356975‑2357268 | aaaGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCACTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGcacc < 1:107012/149‑1 (MQ=255)aaaGTCGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGACTGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGcacc < 5:203688/149‑1 (MQ=255) aaGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGcacca < 2:203754/149‑1 (MQ=255) ggtgAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACcaca 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aaaTCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATaga < 4:166794/138‑1 (MQ=255) aTCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCggg < 1:144647/146‑1 (MQ=255) tCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGtt > 7:180034/1‑148 (MQ=255) tCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGtt > 2:281010/1‑148 (MQ=255) cAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCgggg < 6:70305/144‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGt < 4:104989/81‑1 (MQ=255) gTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGt > 3:104989/1‑81 (MQ=255) tCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCa < 7:23726/125‑1 (MQ=255) tCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCa > 8:23726/1‑125 (MQ=255) tCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCAc > 3:38806/1‑149 (MQ=255) tCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCAc > 5:72621/1‑149 (MQ=255) gACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCAc < 1:281010/147‑1 (MQ=255) gACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGa > 6:170051/1‑149 (MQ=255) gACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGa > 8:308801/1‑149 (MQ=255) gACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGa < 5:170051/149‑1 (MQ=255) ccgcggggcaCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCCCCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCtt > 1:134937‑M2/11‑149 (MQ=255) gcggggcaCCACAAAGAGTTCCCCGGGCTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCAACAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCACATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTg > 5:308513‑M2/9‑148 (MQ=255) cggggcaCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGaa < 8:323381‑M2/142‑1 (MQ=255) ggggcaCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAAc < 6:15256‑M2/143‑1 (MQ=255) ggggcaCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAAc < 6:72621‑M2/143‑1 (MQ=255) ggggcaCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATACACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAAc < 7:311272‑M2/143‑1 (MQ=255) ggcaCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAAc < 3:25601‑M2/143‑1 (MQ=255) gcaCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGCTACGCAGGGTGACTTCCAGCACCAGGAATGCTTGGTGGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCACATGAATTAGCCTTCGATGCGCACGACcttgaagagg > 2:99810‑M2/4‑145 (MQ=255) caCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAACTgg > 7:64240‑M2/3‑148 (MQ=255) caCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAACTGGt < 5:332633‑M2/147‑1 (MQ=255) caCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAACTGGt < 4:15891‑M2/147‑1 (MQ=255) | AAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAACTGGT > NC_002947/2356975‑2357268 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |