New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2899473 | 46 (0.780) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 7.0% | coding (1157/1374 nt) | PP_2553 | MFS transporter |
? | NC_002947 | = 2899506 | 36 (0.640) | coding (1124/1374 nt) | PP_2553 | MFS transporter |
GTCCGGGTTGCCCAGGTCTTCCATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGCCCCACATGACGA > NC_002947/2899325‑2899617 | gTCCGGGTTGCCCAGCTCTTCCATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACA < 3:275393‑M1/149‑1 (MQ=255) ccGGGTTGCCCAGGTCTTCCATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAgc > 8:161185/1‑149 (MQ=255) gggTTGCCCAGGTCTTCCATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAgcgc > 7:169422/1‑149 (MQ=255) gggTTGCCCAGGTCTTCCATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGAGTGGGGCAACCATTGCGAACAgcgc > 8:303683/1‑149 (MQ=255) gTTTCCCAGGTCTTCCATCGCCATGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCgg < 7:77635/149‑1 (MQ=255) ttGCCCAGGTCTTCCATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCggg < 7:108958/149‑1 (MQ=255) cccAGGTCTTCCATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGgcag > 7:17428/1‑149 (MQ=255) cAGGTCTTCCATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGgcagca > 1:113715/1‑149 (MQ=255) tCTTCCATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGc < 7:161185/149‑1 (MQ=255) ccATCGCCAGGCGGTTGGTTTCCGTGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGTGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCg < 8:17428/146‑1 (MQ=255) ccATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGt > 2:142639/1‑148 (MQ=255) cATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTc < 2:257728/148‑1 (MQ=255) cATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCa < 1:142639/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGc > 8:197350/1‑149 (MQ=255) gTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGACTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAtcggcaccatgctgaccgccatgctgcccgcgc > 4:104214‑M1/1‑116 (MQ=255) tttCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGAtgttc < 3:162472‑M2/149‑6 (MQ=255) cGGGGCAATGTAGACTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAtcggcaccatgctgaccgccatgctgcccgcgctgttcgcaa < 3:104214‑M1/149‑43 (MQ=255) ggggCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAtcggcacgatgctgaccgccatgctgcccgcgctgttcgcaat < 1:55864‑M1/149‑44 (MQ=255) cAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATg > 8:62932/1‑149 (MQ=255) cAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATg < 6:326980/149‑1 (MQ=255) gCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCa < 6:246765/115‑1 (MQ=255) gCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCa > 5:246765/1‑115 (MQ=255) gggCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAAcg < 4:11332/149‑1 (MQ=255) acacacGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCgg > 3:250303/1‑148 (MQ=255) gTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGAGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGtgtg < 7:303683/149‑1 (MQ=255) tgatgaAGAAGGCCAGCCCACCGACTCCCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGAAGCGGgtgt < 7:146674/147‑1 (MQ=255) tgatgaAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGtgtg > 5:378828/1‑148 (MQ=255) atgaAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGaa > 1:290652/1‑149 (MQ=255) tgaAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAAc < 4:250303/149‑1 (MQ=255) gaagGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGct > 4:74065/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTg > 1:361537/1‑149 (MQ=255) gCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTgg < 2:290652/149‑1 (MQ=255) cccACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGa < 8:169422/149‑1 (MQ=255) ccACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGaa < 7:62932/149‑1 (MQ=255) cACCGTCTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGTTGGTGCAAGCATTGCGAACATCGCGGGCATCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGTTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTATGGGtt < 4:117726/145‑2 (MQ=255) cACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTa > 3:117726/1‑145 (MQ=255) cACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAg < 6:378828/149‑1 (MQ=255) aCCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGgcag < 5:266383/63‑1 (MQ=255) aCCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGgcag > 6:266383/1‑63 (MQ=255) cTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTggg < 4:162472/149‑1 (MQ=255) cAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGCCGGTCAGCAAGGTGCCGATGTTCTGCGCTATGGCCATCGCGGTAACGAGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGTTAGAAGCTTGGTAaca > 4:36509/1‑149 (MQ=255) aGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAacac > 5:180289/1‑149 (MQ=255) gAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACcgcg > 2:240405/1‑149 (MQ=255) ttgtCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTgg < 3:367923/134‑1 (MQ=255) ttgtCCGAGCCGGGTCGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTgg > 4:367923/1‑134 (MQ=255) tCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAACATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTa < 8:298265/98‑1 (MQ=255) tCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAACATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTa > 7:298265/1‑98 (MQ=255) aGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTgg < 5:146971/149‑1 (MQ=255) ccGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTa < 3:74065/149‑1 (MQ=255) gggTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGa > 4:69662/1‑149 (MQ=255) ggCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGc > 1:189455/1‑149 (MQ=255) ggCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGc > 7:190067/1‑149 (MQ=255) gCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGt > 6:369152/1‑130 (MQ=255) gCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGt < 5:369152/130‑1 (MQ=255) aTTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATCGTGCCGAtgttcgcaatggttgccccacccggctcggacaacattccgctggtagtcggtgggctggccttcttcatcaccggcgtgtgtgccctggcagcctacattgcccc < 1:55864‑M2/149‑107 (MQ=255) ttGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGAtgttcgcaatggttgccccacccggctcggacaacattccgctggtagtcggtgggctggccttcttcatcaccggcgtgtgtgccctggcagtctacattgccccg < 3:104214‑M2/149‑108 (MQ=255) gAACAtcggcaccatgctgaccgccatgctgcccgcgctgttcgcaatggttgccccacccggctcggacaacattccgctggtagtcggtgggctggccttcttcatcaccggcgtgtgtgccctggcagcctacattgccccggaaa < 3:162472‑M1/149‑145 (MQ=255) | GTCCGGGTTGCCCAGGTCTTCCATCGCCAGGCGGTGGGTTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGCCCCACATGACGA > NC_002947/2899325‑2899617 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |