New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2899473 | 46 (0.780) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 7.0% | coding (1157/1374 nt) | PP_2553 | MFS transporter |
? | NC_002947 | = 2899506 | 36 (0.640) | coding (1124/1374 nt) | PP_2553 | MFS transporter |
TTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGCCCCACATGACGATCGAGGCCGCGAACGCCATTGGCACGTTCTGGATGC > NC_002947/2899363‑2899653 | tttCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGAtgttc < 3:162472‑M2/149‑6 (MQ=255) cAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATg > 8:62932/1‑149 (MQ=255) cAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATg < 6:326980/149‑1 (MQ=255) gggCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAAcg < 4:11332/149‑1 (MQ=255) acacacGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCgg > 3:250303/1‑148 (MQ=255) gTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGAGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGtgtg < 7:303683/149‑1 (MQ=255) tgatgaAGAAGGCCAGCCCACCGACTCCCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGAAGCGGgtgt < 7:146674/147‑1 (MQ=255) tgatgaAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGtgtg > 5:378828/1‑148 (MQ=255) atgaAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGaa > 1:290652/1‑149 (MQ=255) tgaAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAAc < 4:250303/149‑1 (MQ=255) gaagGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGct > 4:74065/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTg > 1:361537/1‑149 (MQ=255) gCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTgg < 2:290652/149‑1 (MQ=255) cccACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGa < 8:169422/149‑1 (MQ=255) ccACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGaa < 7:62932/149‑1 (MQ=255) cACCGTCTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGTTGGTGCAAGCATTGCGAACATCGCGGGCATCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGTTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTATGGGtt < 4:117726/145‑2 (MQ=255) cACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTa > 3:117726/1‑145 (MQ=255) cACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAg < 6:378828/149‑1 (MQ=255) cTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTggg < 4:162472/149‑1 (MQ=255) cAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGCCGGTCAGCAAGGTGCCGATGTTCTGCGCTATGGCCATCGCGGTAACGAGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGTTAGAAGCTTGGTAaca > 4:36509/1‑149 (MQ=255) aGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAacac > 5:180289/1‑149 (MQ=255) gAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACcgcg > 2:240405/1‑149 (MQ=255) ttgtCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTgg < 3:367923/134‑1 (MQ=255) ttgtCCGAGCCGGGTCGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTgg > 4:367923/1‑134 (MQ=255) tCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAACATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTa < 8:298265/98‑1 (MQ=255) tCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAACATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTa > 7:298265/1‑98 (MQ=255) aGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTgg < 5:146971/149‑1 (MQ=255) ccGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTa < 3:74065/149‑1 (MQ=255) gggTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGa > 4:69662/1‑149 (MQ=255) ggCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGc > 1:189455/1‑149 (MQ=255) ggCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGc > 7:190067/1‑149 (MQ=255) gCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGt > 6:369152/1‑130 (MQ=255) gCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGt < 5:369152/130‑1 (MQ=255) aTTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATCGTGCCGAtgttcgcaatggttgccccacccggctcggacaacattccgctggtagtcggtgggctggccttcttcatcaccggcgtgtgtgccctggcagcctacattgcccc < 1:55864‑M2/149‑107 (MQ=255) ttGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGAtgttcgcaatggttgccccacccggctcggacaacattccgctggtagtcggtgggctggccttcttcatcaccggcgtgtgtgccctggcagtctacattgccccg < 3:104214‑M2/149‑108 (MQ=255) gcgcGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGAtgttcgcaatggttgccccacccggctcggacaacattccgctggtagtcggtgggctggccttcttcatcaccggcgtgtgtgccctggcagtctacattgccccggaaacccac > 4:104214‑M2/1‑33 (MQ=255) gggCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGCCCCACATGACGATCGAGGCcg < 7:197350/149‑1 (MQ=255) ggCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGCCCCACATGACGATCGAGGCCGCGAAc < 7:133872/145‑1 (MQ=255) ggCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGCCCCACATGACGATCGAGGCCGCGAAc > 8:133872/1‑145 (MQ=255) aGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGCCCCACATGACGATCGAGGCCGCGAACGCCATTGGCAc < 2:189455/149‑1 (MQ=255) gCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGCCCCACATGTCGATCGAGGCCGCGAACGCCATTGGCACGTTCTGGa > 4:105577/1‑149 (MQ=255) ccGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGCCCCACATGACGATCGAGGCCGCGAACGCCATTGGCACGTTCTGGAt > 4:197567/1‑149 (MQ=255) gATGTTCTGCTCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGCCCCACATGACGATCGAGGCCGCGAACGCCATTGGCACGTTCTGGATGc < 3:36509/149‑1 (MQ=255) | TTTCCGGGGCAATGTAGGCTGCCAGGGCACACACGCCGGTGATGAAGAAGGCCAGCCCACCGACTACCAGCGGAATGTTGTCCGAGCCGGGTGGGGCAACCATTGCGAACAGCGCGGGCAGCATGGCGGTCAGCATGGTGCCGATGTTCTGCGCGATGGCCATGGCGGTAACGCGGTAGCGGGTGTGGAACAGCTCTGGGTAGAAGCTTGGGAACACCGCGTTGTAACCCTGGTAGACCATGCCCCACATGACGATCGAGGCCGCGAACGCCATTGGCACGTTCTGGATGC > NC_002947/2899363‑2899653 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |