| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2986914 | 25 (0.420) | 3 (0.050) | 3/242 | NT | 12.1% | coding (1485/2991 nt) | PP_2612 | membrane protein |
| ? | NC_002947 | 4109619 = | 20 (0.360) | coding (1441/2991 nt) | PP_3616 | membrane protein | |||||
GCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGC > NC_002947/2986773‑2987055 | gCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAgg < 4:185139/149‑1 (MQ=255) aTGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGc < 3:261027/149‑1 (MQ=255) cATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGaa > 8:102832/1‑149 (MQ=39) aTCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAAt < 2:261894/149‑1 (MQ=39) cTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCt > 5:27703/1‑149 (MQ=39) cccGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCtt < 5:145315/147‑1 (MQ=39) gCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGaa < 1:129442/148‑1 (MQ=37) gCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGaa > 2:129442/1‑148 (MQ=37) gAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGgcg > 8:278733/1‑149 (MQ=37) accacGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttcggcgccag < 5:271839‑M1/149‑54 (MQ=255) cacGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttcggcgcca < 8:318570‑M1/146‑53 (MQ=255) cacGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttcggcgcca > 7:318570‑M1/1‑94 (MQ=255) cacGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAgg < 7:102832/149‑1 (MQ=37) gTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGgt < 7:349128/149‑1 (MQ=35) ttGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGgtgt > 6:46544/1‑148 (MQ=34) aCCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAg > 2:87992/1‑149 (MQ=34) cGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCg < 2:168449/149‑1 (MQ=34) aCTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCggg < 7:278733/149‑1 (MQ=34) cTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGc < 6:27703/149‑1 (MQ=34) ggCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGt > 3:218385/1‑149 (MQ=34) ggCGGTGAGGTCGGTGATAGCCCCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCTCGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTg < 5:229063/148‑1 (MQ=255) ggTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCt < 4:235215/147‑1 (MQ=34) ggTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCt > 3:235215/1‑147 (MQ=34) ccGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCggg > 2:303469/1‑125 (MQ=32) ccGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCggg < 1:303469/125‑1 (MQ=32) cATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCa < 4:309811/149‑1 (MQ=32) aGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGaaa < 1:87992/149‑1 (MQ=32) gACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCAGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGc > 1:129418/1‑149 (MQ=17) ggCGCCGttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttcggcgccagcgacaacgtgatcgaagggctggccggtcgcttcccggccatggcggacatcaccgacctcaccgcccagtcggtcaatgccgtggtg < 1:204773‑M1/148‑142 (MQ=255) | GCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGC > NC_002947/2986773‑2987055 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |