New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3227945 = | 44 (0.750) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 6.7% | coding (784/1386 nt) | PP_2828 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3227981 = | 42 (0.750) | coding (820/1386 nt) | PP_2828 | hypothetical protein |
CGCCTGGCCGGCGTGCATGCCCCGCATGCAGTGCACCAGTGCCTGGCGGCGCTGGCCCAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGATGCTTTGCCGCTGTCCGAATTCGTCGACTCGCTAGCCACGG > NC_002947/3227798‑3228080 | gcccggccagcggctccagactgcgggcgcgcagttcatgcagctgtgccgtggctagcgagtcgacgaattcggacagcggcaaagcatccgcagccgtctcgaagtgacaacccagcatcgcgtcaagctgctgctcttcaagcaag > 6:144642‑M1/149‑149 (MQ=255) cccggccagcggctccagactgcgggcgcgcagttcatgcagctgtgccgtggctagcgagtcgacgaattcggacagcggcaaagcatccgcagccgtctcgaagtgacaacccagcatcgcgtcaagctgctgctcttcaagcaaGt > 6:269679‑M1/148‑149 (MQ=255) ccggccagcggctccagactgcgggcgcgcagttcatgcagctgtgccgtggctagcgagtcgacgaattcggacagcggcaaagcatccgcagccgtctcgaagtgacaacccagcatcgcgtcaagctgctgctcttcaagcaaGTg < 7:239205‑M1/3‑1 (MQ=255) ccggccagcggctccagactgcgggcgcgcagttcatgcagctgtgccgtggctagcgagtcgacgaattcggacagcggcaaagcatccgcagccgtctcgaagtgacaacccagcatcgcgtcaagctgctgctcttcaagcaaGTg < 8:327988‑M1/3‑1 (MQ=255) ggccagcggctccagactgcgggcgcgcagttcatgcagctgtgccgtggctagcgagtcgacgaattcggacagcggcaaagcatccgcagccgtctcgaagtgacaacccagcatcgcgtcaagctgctgctcttcaagcaaGTGCg > 3:180444‑M1/145‑149 (MQ=255) ggCGTGCATGCCCCGCATGCAGTGCACCAGTGCCTGGCGGCGCTGGCCCAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGAt < 4:129005/149‑1 (MQ=255) cATGCCCCGCATGCAGTGCACCAGTGCCTGGCGGCGCTGGCCCAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTa < 3:32820/148‑1 (MQ=255) cATGCCCCGCATGCAGTGCACCAGTGCCTGGCGGCGCTGGCCCAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTAt < 8:166182/149‑1 (MQ=255) cccGCATGCAGTGCACCAGTGCCTGGCGGCGCTGGCCCAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATtgatg < 8:34156/149‑1 (MQ=255) cccGCATGCAGTGCACCAGTGCCTGGCGGCGCTGGCCCAA‑AGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATGGCTATtgatg > 3:1566/1‑149 (MQ=255) cAGTGCCTGGCGGCGCTGGCCCAAGGGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCAct > 1:193775/1‑149 (MQ=255) cAGTGCCTGGCGGCGCTGGCCCAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTAtt < 2:198354/129‑1 (MQ=255) cAGTGCCTGGCGGCGCTGGCCCAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTAtt > 1:198354/1‑129 (MQ=255) cAGTGCCTGGCGGCGCTGGCCCAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCActt > 8:189941/1‑149 (MQ=255) tgccgtggctagcgagtcgacgaattcggacagcggcaaagcatccgcagccgtctcgaagtgacaacccagcatcgcgtcaagctgctgctcttcaagcaaGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGaa > 7:114702‑M1/103‑147 (MQ=255) gtggctagcgagtcgacgaattcggacagcggcaaagcatccgcagccgtctcgaagtgacaacccagcatcgcgtcaagctgctgctcttcaagcaaGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCActtgct > 4:304123‑M1/99‑139 (MQ=255) gtggctagcgagtcgacgaattcggacagcggcaaagcatccgcagccgtctcgaagtgacaacccagcatcgcgtcaagctgctgctcttcaagcaaGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCActtgct < 3:304123‑M1/41‑1 (MQ=255) ggCCCAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGagcagcagc > 7:224449/1‑149 (MQ=255) gCCCAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGagcagcagc < 4:41985/148‑1 (MQ=255) ccAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCtt > 2:122902/1‑148 (MQ=255) aa‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGAc < 2:193775/149‑1 (MQ=255) ccGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGc > 1:338055/1‑110 (MQ=255) ccGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGc < 2:338055/110‑1 (MQ=255) cGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTggg < 4:1566/149‑1 (MQ=255) aTTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCAGCGGGTGGTCAGCACGATCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGtt < 5:333043/149‑1 (MQ=255) ttGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTg < 7:189941/149‑1 (MQ=255) gCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCGGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGt < 3:241169/148‑1 (MQ=255) cACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGa < 5:345695/82‑1 (MQ=255) cACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGa > 6:345695/1‑82 (MQ=255) cACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGagcagcagc > 1:160920/1‑127 (MQ=255) cACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGagcagcagc < 2:160920/127‑1 (MQ=255) ggTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTg > 7:73410/1‑138 (MQ=255) ggTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTg < 8:73410/138‑1 (MQ=255) ggTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATGGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACtt < 8:112960/149‑1 (MQ=255) gggggCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGc > 6:243152/1‑149 (MQ=255) gtggtCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGATGCTTTg < 6:117954/149‑1 (MQ=255) tggtCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGATGCTTTGc < 5:243152/149‑1 (MQ=255) tCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGa > 8:257676/1‑102 (MQ=255) tCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGa < 7:257676/102‑1 (MQ=255) cAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCAc > 6:24282/1‑120 (MQ=255) cAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCAc < 5:18927/120‑1 (MQ=255) cAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCAc < 5:24282/120‑1 (MQ=255) cAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCAc > 6:18927/1‑120 (MQ=255) gCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGa < 8:289074/129‑1 (MQ=255) ggTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGATGCTTTGCCGCTGTCCGAATtcg > 4:203409/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGATGCTTTGCCGCTGTCCGAATtcgtc > 6:184466/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGATGCTTTGCCGCTGTCCGAATtcgtc < 8:224449/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCAGTACCGGCGCGTTCGCAGTTGCGGCTGATCGCTATTGATGACATTTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGATTGACGCTATGCTGGGTTGTCACTTCGATACTGCTGCGGATGCTTTGCCGCTGTCCGAATtcgtc < 1:288665/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGATGCTTTGCCGCTGTCCGAATTCGTCGa < 3:203409/148‑1 (MQ=255) cgcCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGATGCTTTGCCGCTGTCCGAATTCGTCGACTCGc > 8:155775/1‑149 (MQ=255) cGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGATGCTTTGCCGCTGTCCGAATTCGTCGACTCGCTAGCCACg > 8:296872/1‑149 (MQ=255) gAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGATGCTTTGCCGCTGTCCGAATTCGTCGACTCGCTAGCCACgg > 8:239205/1‑148 (MQ=255) | CGCCTGGCCGGCGTGCATGCCCCGCATGCAGTGCACCAGTGCCTGGCGGCGCTGGCCCAA‑GGGCTGAGCCGATTGCACGGTGCTGTTGGGGGCGCACCGGGTGGTCAGCACGAGCCGGTTCCAGGCGCCGTACCGGAGCGTGCGCCGGTGCGGCTGATCGCTATTGATGACCTGTTGCCGCACTTGCTTGAAGAGCAGCAGCTTGACGCGATGCTGGGTTGTCACTTCGAGACGGCTGCGGATGCTTTGCCGCTGTCCGAATTCGTCGACTCGCTAGCCACGG > NC_002947/3227798‑3228080 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |